Protein–RNA interactions for Protein: P17540

CKMT2, Creatine kinase S-type, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 419 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CKMT2P17540 TRIM50-202ENST00000453152 1599 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CKMT2P17540 COTL1-201ENST00000262428 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CKMT2P17540 FBXO28-201ENST00000366862 5451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CKMT2P17540 MMP15-201ENST00000219271 4250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CKMT2P17540 TRAF6-201ENST00000348124 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CKMT2P17540 TMC6-216ENST00000590602 5268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CKMT2P17540 HNRNPK-204ENST00000376263 2942 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CKMT2P17540 BCAR1-202ENST00000393420 2667 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CKMT2P17540 DHODH-201ENST00000219240 2426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CKMT2P17540 SEMA4F-201ENST00000339773 2177 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CKMT2P17540 PRRT2-214ENST00000637064 2153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CKMT2P17540 PPP1R16B-201ENST00000299824 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CKMT2P17540 GPR89B-201ENST00000314163 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CKMT2P17540 DNAJC10-210ENST00000616986 5783 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CKMT2P17540 QRFP-202ENST00000623824 1658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CKMT2P17540 ABLIM2-202ENST00000361581 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CKMT2P17540 DUSP18-206ENST00000407308 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CKMT2P17540 ARCN1-203ENST00000392859 1709 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CKMT2P17540 CHAF1A-201ENST00000301280 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CKMT2P17540 IL3RA-202ENST00000381469 1476 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CKMT2P17540 CLK3P2-201ENST00000427566 1453 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
CKMT2P17540 SNX18-202ENST00000343017 3140 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
CKMT2P17540 SOD1-201ENST00000270142 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CKMT2P17540 CCDC12-201ENST00000292314 1017 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CKMT2P17540 CYP4B1-203ENST00000371923 2110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CKMT2P17540 TCP10-202ENST00000397829 2141 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CKMT2P17540 BOLA2P3-201ENST00000404566 256 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
CKMT2P17540 FAM221A-203ENST00000409653 761 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CKMT2P17540 FAM221A-204ENST00000409994 1136 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CKMT2P17540 RHCE-206ENST00000413854 1198 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CKMT2P17540 SFTPC-202ENST00000437090 773 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CKMT2P17540 ZNF589-204ENST00000440261 917 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CKMT2P17540 KRT223P-202ENST00000449164 1292 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
CKMT2P17540 AL161908.2-201ENST00000457964 394 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CKMT2P17540 RNF216P1-213ENST00000494947 946 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CKMT2P17540 AC092658.1-201ENST00000505836 891 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
CKMT2P17540 PNOC-204ENST00000522209 1007 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CKMT2P17540 IL32-215ENST00000529550 772 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CKMT2P17540 OMP-201ENST00000529803 492 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CKMT2P17540 TGIF2-C20orf24-201ENST00000558530 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CKMT2P17540 PIGL-212ENST00000581006 554 ntTSL 4 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CKMT2P17540 DNM1-201ENST00000341179 3254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CKMT2P17540 PELP1-208ENST00000572293 5272 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CKMT2P17540 CAPN2-201ENST00000295006 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CKMT2P17540 BACE2-203ENST00000347667 8764 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CKMT2P17540 CTNND2-214ENST00000511377 4336 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CKMT2P17540 LDB3-208ENST00000623007 1664 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CKMT2P17540 NOL4L-210ENST00000616976 1376 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CKMT2P17540 MCFD2-201ENST00000319466 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CKMT2P17540 ISLR-201ENST00000249842 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CKMT2P17540 ACTL9-201ENST00000324436 1426 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CKMT2P17540 UBE2J1-201ENST00000435041 4290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CKMT2P17540 ZNF496-201ENST00000294753 5336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CKMT2P17540 FHL2-205ENST00000393353 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CKMT2P17540 NFATC1-207ENST00000545796 3558 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CKMT2P17540 ASAH1-249ENST00000637528 2215 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CKMT2P17540 PGAP2-205ENST00000396993 1566 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CKMT2P17540 LINC01267-201ENST00000502417 2284 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CKMT2P17540 AP003680.1-201ENST00000598970 3660 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
CKMT2P17540 PPIL2-212ENST00000626352 2625 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CKMT2P17540 BCAR1-204ENST00000418647 3387 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CKMT2P17540 TBC1D2-201ENST00000342112 3046 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CKMT2P17540 CNKSR1-214ENST00000531191 2673 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CKMT2P17540 TSPOAP1-202ENST00000343736 5947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CKMT2P17540 KREMEN1-201ENST00000327813 2719 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CKMT2P17540 LGALS2-201ENST00000215886 591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CKMT2P17540 AP000317.2-201ENST00000362077 641 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CKMT2P17540 ROPN1-207ENST00000484329 566 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CKMT2P17540 TPD52L1-214ENST00000534199 811 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CKMT2P17540 CACNA2D4-208ENST00000538027 952 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CKMT2P17540 GNG2-209ENST00000555472 908 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CKMT2P17540 SLC38A7-207ENST00000564391 731 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CKMT2P17540 TMEM170A-203ENST00000566980 547 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CKMT2P17540 MIR4259-201ENST00000584466 101 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
CKMT2P17540 AC008735.3-201ENST00000596646 500 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
CKMT2P17540 C11orf53-203ENST00000637637 1049 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CKMT2P17540 AL353997.2-201ENST00000579352 4955 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CKMT2P17540 LIMK2-203ENST00000340552 2789 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CKMT2P17540 CANX-201ENST00000247461 4260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CKMT2P17540 IGHA1-202ENST00000641837 1310 ntAPPRIS P5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CKMT2P17540 FKBP8-201ENST00000222308 1710 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CKMT2P17540 CCDC110-201ENST00000307588 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CKMT2P17540 ATG9A-205ENST00000409618 4025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CKMT2P17540 TRAPPC11-202ENST00000357207 4435 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CKMT2P17540 AC063926.3-201ENST00000624734 5658 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
CKMT2P17540 NAGK-208ENST00000455662 1778 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CKMT2P17540 TRPC6-206ENST00000532133 2648 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CKMT2P17540 BICDL1-201ENST00000397558 3055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CKMT2P17540 EDN3-201ENST00000311585 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CKMT2P17540 SLC6A8-204ENST00000430077 1892 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CKMT2P17540 ALDOA-226ENST00000569798 1499 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CKMT2P17540 ARID4B-202ENST00000349213 5811 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
CKMT2P17540 PIK3IP1-203ENST00000441972 2374 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
CKMT2P17540 SLC20A1-201ENST00000272542 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
CKMT2P17540 MFSD5-202ENST00000534842 2038 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
CKMT2P17540 TDRP-205ENST00000613071 3421 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.09
CKMT2P17540 AL139082.1-201ENST00000613982 3433 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
CKMT2P17540 SLC8B1-201ENST00000202831 2975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
CKMT2P17540 THOC5-202ENST00000397871 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
CKMT2P17540 DEGS1-201ENST00000323699 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.7 ms