Protein–RNA interactions for Protein: P12814

ACTN1, Alpha-actinin-1, humanhuman

Predictions only

Length 892 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTN1P12814 CRYGN-205ENST00000491928 698 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
ACTN1P12814 OIP5-AS1-209ENST00000561226 775 ntTSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
ACTN1P12814 CD300LG-205ENST00000586233 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
ACTN1P12814 AL354740.1-203ENST00000593917 424 ntTSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
ACTN1P12814 SCGB1C2-201ENST00000595228 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
ACTN1P12814 LINC01115-203ENST00000606068 577 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
ACTN1P12814 AC244093.1-201ENST00000610837 814 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
ACTN1P12814 APBA2-205ENST00000558330 3349 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
ACTN1P12814 C2orf54-202ENST00000388934 1911 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
ACTN1P12814 KRT8-215ENST00000552150 1687 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
ACTN1P12814 CACNA1G-202ENST00000354983 8138 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
ACTN1P12814 B3GALNT1-203ENST00000392781 3606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
ACTN1P12814 RIMS3-201ENST00000372683 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
ACTN1P12814 AC013268.4-201ENST00000637413 2228 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
ACTN1P12814 CLDN19-202ENST00000372539 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
ACTN1P12814 NFIA-205ENST00000371189 1989 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
ACTN1P12814 SLC25A36-201ENST00000324194 1301 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
ACTN1P12814 PGBD2-201ENST00000329291 2136 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
ACTN1P12814 SMURF2-201ENST00000262435 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
ACTN1P12814 NBPF15-202ENST00000488031 4535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
ACTN1P12814 SIGLEC10-201ENST00000339313 2256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
ACTN1P12814 H2AFY-202ENST00000312469 1859 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
ACTN1P12814 HMGA1-204ENST00000401473 1887 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
ACTN1P12814 SLC25A19-202ENST00000375261 1486 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
ACTN1P12814 TUBGCP2-204ENST00000417178 4029 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
ACTN1P12814 ACSL1-202ENST00000454703 3636 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
ACTN1P12814 TBC1D17-202ENST00000535102 2025 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
ACTN1P12814 ARHGEF1-219ENST00000599846 3393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
ACTN1P12814 NCKIPSD-201ENST00000294129 2989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
ACTN1P12814 SYBU-219ENST00000528647 2995 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
ACTN1P12814 AC009802.1-201ENST00000637973 1609 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
ACTN1P12814 HSF5-201ENST00000323777 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
ACTN1P12814 PEPD-202ENST00000397032 1754 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
ACTN1P12814 MYLK3-202ENST00000536476 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
ACTN1P12814 ASAH1-240ENST00000636997 1774 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
ACTN1P12814 SLC34A1-204ENST00000512593 1912 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
ACTN1P12814 HNRNPA1P48-201ENST00000562726 1377 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
ACTN1P12814 ABHD3-201ENST00000289119 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
ACTN1P12814 BRSK2-204ENST00000526678 2091 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
ACTN1P12814 KLK10-202ENST00000358789 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
ACTN1P12814 C19orf54-201ENST00000378313 2753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
ACTN1P12814 CCNA2-202ENST00000618014 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
ACTN1P12814 WIPF3-202ENST00000409123 3491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
ACTN1P12814 CHRDL1-204ENST00000444321 1658 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
ACTN1P12814 LINC00221-201ENST00000603633 1656 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
ACTN1P12814 ASNS-201ENST00000175506 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
ACTN1P12814 SHANK1-204ENST00000391814 6622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
ACTN1P12814 EIF4E-201ENST00000280892 1097 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
ACTN1P12814 CCDC88B-201ENST00000301897 870 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
ACTN1P12814 IFNL2-201ENST00000331982 737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
ACTN1P12814 SS18L1-202ENST00000370848 1238 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
ACTN1P12814 SSH3-203ENST00000376757 2990 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
ACTN1P12814 RPL28-203ENST00000428193 573 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
ACTN1P12814 LNCPRESS1-201ENST00000429254 756 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
ACTN1P12814 AL355994.3-201ENST00000437156 466 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
ACTN1P12814 AC113608.2-201ENST00000448379 487 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
ACTN1P12814 CGB8-201ENST00000448456 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
ACTN1P12814 TAF8-204ENST00000456846 1293 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
ACTN1P12814 SELENOT-203ENST00000477889 944 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
ACTN1P12814 RPL13AP25-201ENST00000484130 612 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
ACTN1P12814 AC008808.1-201ENST00000508923 432 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
ACTN1P12814 MTUS1-215ENST00000519066 567 ntTSL 4 BASIC17.43■□□□□ 0.38
ACTN1P12814 SNHG6-201ENST00000520348 648 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
ACTN1P12814 OVOL1-AS1-202ENST00000532454 494 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
ACTN1P12814 LINC01595-201ENST00000555406 639 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
ACTN1P12814 RPL28-207ENST00000558815 616 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
ACTN1P12814 AC010491.1-202ENST00000567048 528 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
ACTN1P12814 KLK3-204ENST00000593997 1035 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
ACTN1P12814 AL391069.4-201ENST00000609583 481 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
ACTN1P12814 RASD2-201ENST00000216127 3412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
ACTN1P12814 CAMK2B-208ENST00000395747 1557 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
ACTN1P12814 TBP-206ENST00000540980 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
ACTN1P12814 TACR2-203ENST00000619173 1713 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
ACTN1P12814 TNKS1BP1-207ENST00000532437 5952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
ACTN1P12814 PBX3-204ENST00000373489 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
ACTN1P12814 SYT3-201ENST00000338916 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
ACTN1P12814 RIC8B-213ENST00000638198 1611 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
ACTN1P12814 MON2-201ENST00000393629 5612 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
ACTN1P12814 LRRFIP1P1-201ENST00000498774 2246 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
ACTN1P12814 TVP23C-210ENST00000584811 2989 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
ACTN1P12814 RNF182-206ENST00000537388 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
ACTN1P12814 KIAA1217-206ENST00000376462 6123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
ACTN1P12814 ICA1L-201ENST00000358299 3457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
ACTN1P12814 HSP90B1-201ENST00000299767 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
ACTN1P12814 PHTF1-201ENST00000357783 2747 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
ACTN1P12814 LDLR-204ENST00000545707 2429 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
ACTN1P12814 UBE2D1-204ENST00000615793 2621 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
ACTN1P12814 GPAT2-204ENST00000453542 2466 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
ACTN1P12814 EPS8L2-201ENST00000318562 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
ACTN1P12814 MAGI1-202ENST00000402939 4389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
ACTN1P12814 ZNF302-207ENST00000505365 2955 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
ACTN1P12814 INTS4P1-202ENST00000587624 2985 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
ACTN1P12814 ADAMTS1-201ENST00000284984 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
ACTN1P12814 EMC4-201ENST00000249209 852 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
ACTN1P12814 GTSF1-201ENST00000305879 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
ACTN1P12814 PLA2G5-201ENST00000375108 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
ACTN1P12814 APOA1-204ENST00000375323 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
ACTN1P12814 ELP6-209ENST00000446787 894 ntTSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
ACTN1P12814 FAM86LP-201ENST00000478302 853 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
ACTN1P12814 AC136475.2-201ENST00000526612 392 ntTSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.1 ms