Protein–RNA interactions for Protein: P04141

CSF2, Granulocyte-macrophage colony-stimulating factor, humanhuman

Predictions only

Length 144 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSF2P04141 CLCNKA-203ENST00000439316 1997 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CSF2P04141 GPR176-205ENST00000561100 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CSF2P04141 BRF1-201ENST00000327359 2292 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CSF2P04141 DAND5-202ENST00000585548 1731 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CSF2P04141 AGER-206ENST00000375070 1463 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CSF2P04141 AGER-208ENST00000438221 1493 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CSF2P04141 KRT9-202ENST00000588431 1493 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CSF2P04141 SH3BP4-201ENST00000344528 5044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CSF2P04141 MYLK3-202ENST00000536476 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CSF2P04141 USE1-206ENST00000595101 1776 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CSF2P04141 HS3ST3B1-201ENST00000360954 5367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CSF2P04141 ACTN2-207ENST00000546208 5103 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CSF2P04141 LRRC57-204ENST00000563454 2407 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CSF2P04141 POM121C-206ENST00000607367 3690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CSF2P04141 CCDC187-205ENST00000638797 10126 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CSF2P04141 CAMTA1-201ENST00000303635 8444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CSF2P04141 XAF1-201ENST00000346752 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CSF2P04141 C15orf52-202ENST00000397536 4717 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CSF2P04141 RPF1-202ENST00000370656 724 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CSF2P04141 PGGT1B-202ENST00000379615 903 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CSF2P04141 BRF1-202ENST00000379932 884 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CSF2P04141 USB1-202ENST00000423271 1217 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CSF2P04141 Z94721.1-201ENST00000444102 385 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CSF2P04141 AC103563.7-201ENST00000448734 478 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CSF2P04141 AC093433.1-201ENST00000458048 571 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
CSF2P04141 AC092658.1-201ENST00000505836 891 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
CSF2P04141 AC012574.2-201ENST00000520375 443 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CSF2P04141 TRAPPC2L-206ENST00000564365 1060 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CSF2P04141 APOBEC3H-206ENST00000613677 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CSF2P04141 KRT73-201ENST00000305748 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CSF2P04141 TCP10-201ENST00000366827 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CSF2P04141 MSI2-204ENST00000442934 1624 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CSF2P04141 AC009802.1-201ENST00000637973 1609 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CSF2P04141 CCDC59-201ENST00000256151 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CSF2P04141 ST3GAL5-229ENST00000638986 2331 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CSF2P04141 C17orf74-201ENST00000333870 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CSF2P04141 MRI1-202ENST00000319545 3027 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CSF2P04141 KLHL42-201ENST00000381271 6703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CSF2P04141 EPOP-201ENST00000621654 3719 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CSF2P04141 PGAP3-201ENST00000300658 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CSF2P04141 EPS8L2-231ENST00000614442 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CSF2P04141 GFAP-233ENST00000639277 1783 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CSF2P04141 NUCB1-202ENST00000407032 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CSF2P04141 NTRK3-202ENST00000355254 2938 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
CSF2P04141 KLK6-203ENST00000391808 1478 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
CSF2P04141 PCDHA12-201ENST00000398631 5233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
CSF2P04141 ZXDA-201ENST00000358697 4113 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.05
CSF2P04141 FAM92B-201ENST00000539556 1898 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
CSF2P04141 AC107871.1-202ENST00000562767 3389 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.05
CSF2P04141 ATP6AP2-226ENST00000637526 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
CSF2P04141 PLTP-205ENST00000477313 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
CSF2P04141 LINC01978-202ENST00000574526 1540 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
CSF2P04141 DAP-201ENST00000230895 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
CSF2P04141 FZD4-201ENST00000531380 7383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
CSF2P04141 WSCD1-208ENST00000573634 1573 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
CSF2P04141 MTHFR-217ENST00000641820 1569 ntBASIC15.33■□□□□ 0.05
CSF2P04141 FLII-221ENST00000578558 2377 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CSF2P04141 AL513523.2-202ENST00000427283 2040 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
CSF2P04141 OTX1-201ENST00000282549 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CSF2P04141 OTX1-202ENST00000366671 2861 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CSF2P04141 KCNQ2-209ENST00000625514 2925 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CSF2P04141 ADARB2-203ENST00000381312 8421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CSF2P04141 GPR148-201ENST00000309926 1267 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CSF2P04141 SCGN-201ENST00000334979 704 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CSF2P04141 ACKR1-201ENST00000368121 1240 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
CSF2P04141 TEX30-203ENST00000376022 828 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CSF2P04141 GZMB-202ENST00000382540 816 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CSF2P04141 RPL7P3-201ENST00000441388 714 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
CSF2P04141 AC007551.1-201ENST00000457394 519 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
CSF2P04141 FAM162A-202ENST00000469967 1015 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CSF2P04141 C8orf37-AS1-202ENST00000517655 562 ntTSL 4 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CSF2P04141 AP000812.2-201ENST00000538934 718 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
CSF2P04141 ST8SIA2-202ENST00000539113 1089 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CSF2P04141 GABARAPL1-217ENST00000545887 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CSF2P04141 AL118558.1-202ENST00000557242 451 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CSF2P04141 SNAI3-AS1-206ENST00000569786 588 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CSF2P04141 LINC01887-202ENST00000584734 860 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CSF2P04141 ELOF1-208ENST00000591912 899 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CSF2P04141 LINC01515-215ENST00000608678 854 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CSF2P04141 RIC8A-217ENST00000626818 159 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CSF2P04141 SLC6A9-204ENST00000372307 2162 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CSF2P04141 MBD4-206ENST00000507208 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CSF2P04141 CARD14-202ENST00000570421 2607 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CSF2P04141 POMP-201ENST00000380842 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CSF2P04141 WASHC2C-202ENST00000359860 4471 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CSF2P04141 ARID4B-202ENST00000349213 5811 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CSF2P04141 DLGAP1-220ENST00000581699 2258 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CSF2P04141 AC024909.3-201ENST00000611513 2257 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
CSF2P04141 AMT-202ENST00000395338 1831 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CSF2P04141 EHD3-201ENST00000322054 4636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CSF2P04141 NAT9-210ENST00000580301 1860 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CSF2P04141 ITPR3-201ENST00000374316 9870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CSF2P04141 AC092718.8-201ENST00000640345 2892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CSF2P04141 PRKAG1-217ENST00000552212 1497 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CSF2P04141 MOG-215ENST00000376888 1529 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CSF2P04141 ACP5-202ENST00000412435 1527 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CSF2P04141 SHOX2-202ENST00000425436 1513 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CSF2P04141 AC004233.2-201ENST00000573315 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CSF2P04141 PAQR8-202ENST00000442253 4738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CSF2P04141 PITPNM1-202ENST00000436757 4216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.4 ms