Protein–RNA interactions for Protein: O95460

MATN4, Matrilin-4, humanhuman

Predictions only

Length 622 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MATN4O95460 AC002310.2-201ENST00000486926 950 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
MATN4O95460 RNA5SP421-201ENST00000516864 134 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
MATN4O95460 IGHV3OR16-13-201ENST00000562905 353 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
MATN4O95460 AC141424.1-203ENST00000599026 887 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
MATN4O95460 AC004840.1-201ENST00000636359 365 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
MATN4O95460 LARP6-201ENST00000299213 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
MATN4O95460 PDGFRL-203ENST00000541323 1905 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
MATN4O95460 THRA-203ENST00000450525 4895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
MATN4O95460 TOM1-201ENST00000382034 1300 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
MATN4O95460 URAHP-202ENST00000409873 1349 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
MATN4O95460 G6PD-203ENST00000393564 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
MATN4O95460 NIN-203ENST00000382041 6496 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
MATN4O95460 AC007326.5-201ENST00000640084 1382 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
MATN4O95460 B3GLCT-201ENST00000343307 4254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
MATN4O95460 HSP90B1-201ENST00000299767 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
MATN4O95460 TINF2-202ENST00000399423 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
MATN4O95460 CRYM-201ENST00000219599 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
MATN4O95460 RAPSN-203ENST00000524487 1462 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
MATN4O95460 PSD4-201ENST00000245796 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
MATN4O95460 NOX5-204ENST00000455873 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
MATN4O95460 ING5-213ENST00000636051 4199 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
MATN4O95460 PRKD2-201ENST00000291281 3070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
MATN4O95460 CELF4-223ENST00000603232 1906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
MATN4O95460 AC005264.1-201ENST00000587587 2319 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
MATN4O95460 MED16-207ENST00000589119 2772 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
MATN4O95460 PACSIN2-201ENST00000263246 3249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
MATN4O95460 LENG8-208ENST00000610347 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
MATN4O95460 POM121-203ENST00000434423 3750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
MATN4O95460 CABP5-201ENST00000293255 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
MATN4O95460 CCDC182-201ENST00000299415 832 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
MATN4O95460 ZNF804B-201ENST00000333190 4659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
MATN4O95460 MRPL55-202ENST00000336300 722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
MATN4O95460 MRPL55-206ENST00000366732 722 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
MATN4O95460 PACSIN2-204ENST00000403744 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
MATN4O95460 VAT1-202ENST00000420567 1069 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
MATN4O95460 DIRC3-201ENST00000423123 552 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.33■□□□□ 0.04
MATN4O95460 DBH-AS1-201ENST00000425189 2139 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
MATN4O95460 APOA1-AS-201ENST00000444200 563 ntTSL 4 BASIC15.33■□□□□ 0.04
MATN4O95460 AL627443.1-201ENST00000456477 1035 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
MATN4O95460 AC012615.6-204ENST00000587741 477 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
MATN4O95460 COLGALT2-201ENST00000361927 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
MATN4O95460 LINC01301-205ENST00000531654 1347 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
MATN4O95460 MLKL-201ENST00000306247 1781 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
MATN4O95460 FOLH1-202ENST00000340334 2697 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
MATN4O95460 REPIN1-209ENST00000479668 3182 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
MATN4O95460 MVK-207ENST00000539575 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
MATN4O95460 AC007292.2-201ENST00000593524 1812 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
MATN4O95460 PGC-202ENST00000373025 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
MATN4O95460 AAMP-201ENST00000248450 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
MATN4O95460 AC004922.1-201ENST00000638617 2430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
MATN4O95460 PLXNB1-202ENST00000358536 7308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
MATN4O95460 AC091951.1-201ENST00000512854 2465 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
MATN4O95460 B3GALNT1-203ENST00000392781 3606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
MATN4O95460 CRHR2-208ENST00000506074 3109 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
MATN4O95460 DAGLA-201ENST00000257215 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
MATN4O95460 SLC37A1-201ENST00000352133 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
MATN4O95460 DDX55-203ENST00000421670 1574 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
MATN4O95460 ARID4B-202ENST00000349213 5811 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
MATN4O95460 BUD13-201ENST00000260210 2196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
MATN4O95460 STAT5A-211ENST00000590949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
MATN4O95460 PRRG1-203ENST00000463135 1663 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
MATN4O95460 GDAP1L1-201ENST00000342560 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
MATN4O95460 ZNF586-201ENST00000391702 2265 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
MATN4O95460 KLF11-201ENST00000305883 4030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
MATN4O95460 AC005885.1-204ENST00000637885 2885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
MATN4O95460 BICD2-202ENST00000375512 4636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
MATN4O95460 MEGF10-206ENST00000508365 2365 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
MATN4O95460 MTCL1-203ENST00000400050 6042 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
MATN4O95460 ANP32A-203ENST00000465139 2440 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
MATN4O95460 KNSTRN-202ENST00000416151 1899 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
MATN4O95460 CCL25-201ENST00000253451 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
MATN4O95460 MIR770-201ENST00000390219 98 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
MATN4O95460 NME2-201ENST00000393183 568 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
MATN4O95460 COLEC11-205ENST00000402922 1134 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
MATN4O95460 UBE2F-202ENST00000409332 1138 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
MATN4O95460 CYSRT1-201ENST00000409414 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
MATN4O95460 EFHD1-202ENST00000409613 1156 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
MATN4O95460 LYPLAL1-AS1-201ENST00000441331 724 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
MATN4O95460 AL606760.1-201ENST00000458151 1181 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
MATN4O95460 CXCL6-203ENST00000515050 557 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
MATN4O95460 ERGIC1-212ENST00000523291 586 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
MATN4O95460 ERCC1-212ENST00000591636 836 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
MATN4O95460 LIM2-202ENST00000596399 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
MATN4O95460 FLJ42969-201ENST00000514926 1948 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
MATN4O95460 C14orf180-203ENST00000557649 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
MATN4O95460 CTDSP1-201ENST00000273062 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
MATN4O95460 PRMT2-202ENST00000334494 1334 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
MATN4O95460 POLI-208ENST00000579534 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
MATN4O95460 MTFMT-201ENST00000220058 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
MATN4O95460 SUPT20H-201ENST00000350612 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
MATN4O95460 TRPM2-AS-202ENST00000456880 2056 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
MATN4O95460 AMBP-201ENST00000265132 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
MATN4O95460 RGPD5-202ENST00000272454 2907 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
MATN4O95460 SLC8B1-201ENST00000202831 2975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
MATN4O95460 HEY1-201ENST00000337919 2296 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
MATN4O95460 TUBA3E-201ENST00000312988 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
MATN4O95460 MBD1-207ENST00000398488 1512 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
MATN4O95460 AC012414.7-201ENST00000621235 1507 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
MATN4O95460 CHIA-201ENST00000343320 1624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
MATN4O95460 SLCO5A1-201ENST00000260126 9076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.4 ms