Protein–RNA interactions for Protein: O43854

EDIL3, EGF-like repeat and discoidin I-like domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 480 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EDIL3O43854 MCM7-202ENST00000343023 1968 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
EDIL3O43854 CD19-201ENST00000324662 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
EDIL3O43854 ZNF32-AS3-201ENST00000458063 1932 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
EDIL3O43854 PSMB6-201ENST00000270586 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
EDIL3O43854 CSF2-201ENST00000296871 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
EDIL3O43854 CYTL1-201ENST00000307746 1003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
EDIL3O43854 C1QB-201ENST00000314933 1044 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
EDIL3O43854 AL731661.1-201ENST00000438217 758 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
EDIL3O43854 FDPS-203ENST00000447866 1256 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
EDIL3O43854 PTP4A1P2-201ENST00000546033 454 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
EDIL3O43854 C12orf10-204ENST00000548632 988 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
EDIL3O43854 C17orf62-239ENST00000585080 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
EDIL3O43854 AC239800.4-201ENST00000603712 296 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
EDIL3O43854 AL512343.1-201ENST00000605837 169 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
EDIL3O43854 PSMB6-205ENST00000614486 871 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
EDIL3O43854 ZNF697-201ENST00000421812 5041 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
EDIL3O43854 HDHD3-201ENST00000238379 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
EDIL3O43854 PDZD3-212ENST00000531114 2996 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
EDIL3O43854 TCF25-202ENST00000263347 2377 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
EDIL3O43854 ELMOD1-201ENST00000265840 2852 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
EDIL3O43854 SPG21-203ENST00000433215 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
EDIL3O43854 SLC52A3-201ENST00000217254 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
EDIL3O43854 TCP10-202ENST00000397829 2141 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
EDIL3O43854 NMNAT3-201ENST00000296202 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
EDIL3O43854 GPER1-202ENST00000397088 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
EDIL3O43854 MPPED1-202ENST00000417669 3657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
EDIL3O43854 MYH14-208ENST00000598205 6137 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
EDIL3O43854 PKIG-204ENST00000372889 1489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
EDIL3O43854 UPB1-202ENST00000382760 1928 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
EDIL3O43854 ZNF252P-AS1-201ENST00000527067 3236 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
EDIL3O43854 FAM172A-204ENST00000505869 1387 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
EDIL3O43854 EPS8L2-201ENST00000318562 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
EDIL3O43854 NDUFB7-201ENST00000215565 531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
EDIL3O43854 BLVRA-202ENST00000402924 1161 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
EDIL3O43854 NUS1P3-201ENST00000423502 862 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
EDIL3O43854 GGTLC2-202ENST00000448514 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
EDIL3O43854 FTH1P14-201ENST00000482930 551 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
EDIL3O43854 ST8SIA2-202ENST00000539113 1089 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
EDIL3O43854 KRT17P8-201ENST00000540749 863 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
EDIL3O43854 AC091891.1-201ENST00000560688 688 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
EDIL3O43854 ORC6-206ENST00000568364 888 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
EDIL3O43854 AC010641.1-201ENST00000591757 529 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
EDIL3O43854 LINC00592-202ENST00000640420 768 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
EDIL3O43854 EFR3B-203ENST00000402191 3685 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
EDIL3O43854 HLA-DQB1-205ENST00000434651 1642 ntAPPRIS P1 BASIC17.31■□□□□ 0.36
EDIL3O43854 TCAF2P1-201ENST00000291129 2421 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
EDIL3O43854 SPAG6-201ENST00000313311 2421 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
EDIL3O43854 MAPK8IP3-216ENST00000610761 5626 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
EDIL3O43854 CCNA2-202ENST00000618014 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
EDIL3O43854 ABTB1-202ENST00000453791 1961 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
EDIL3O43854 ZFYVE28-210ENST00000515169 1590 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
EDIL3O43854 ZBED1P1-201ENST00000502364 1930 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
EDIL3O43854 RFK-201ENST00000376736 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
EDIL3O43854 C2CD4A-201ENST00000355522 3445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
EDIL3O43854 ZXDB-201ENST00000374888 5894 ntAPPRIS P1 BASIC17.31■□□□□ 0.36
EDIL3O43854 HNRNPUL1-220ENST00000602130 2932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
EDIL3O43854 DDIAS-203ENST00000525361 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
EDIL3O43854 BUD13-201ENST00000260210 2196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
EDIL3O43854 MBD1-211ENST00000585595 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
EDIL3O43854 CDH16-207ENST00000568632 2526 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
EDIL3O43854 TCEA2-203ENST00000361317 1427 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
EDIL3O43854 SUMO3-203ENST00000397898 1779 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
EDIL3O43854 TPM1-206ENST00000358278 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
EDIL3O43854 DDX19A-202ENST00000417604 1703 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
EDIL3O43854 IL25-201ENST00000329715 1315 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
EDIL3O43854 KRT8P35-201ENST00000483942 1338 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
EDIL3O43854 HID1-202ENST00000425042 3271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
EDIL3O43854 SOD1-201ENST00000270142 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
EDIL3O43854 AP000317.2-201ENST00000362077 641 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
EDIL3O43854 C1orf43-205ENST00000368519 1163 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
EDIL3O43854 CLCN6-207ENST00000376497 814 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
EDIL3O43854 EIF1AX-201ENST00000379593 765 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
EDIL3O43854 CYB5R3-203ENST00000402438 1050 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
EDIL3O43854 CFL1-212ENST00000531413 636 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
EDIL3O43854 HILS1-202ENST00000545329 423 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
EDIL3O43854 COX6B1-204ENST00000592141 660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
EDIL3O43854 AL137783.1-201ENST00000623494 1896 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
EDIL3O43854 SGCE-205ENST00000437425 1508 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
EDIL3O43854 TM4SF19-AS1-203ENST00000452051 1829 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
EDIL3O43854 ZNF331-217ENST00000512387 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
EDIL3O43854 TRA2B-205ENST00000453386 2952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
EDIL3O43854 LMF2-201ENST00000216080 2658 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
EDIL3O43854 FAM32A-201ENST00000263384 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
EDIL3O43854 SLC4A3-204ENST00000373760 4134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
EDIL3O43854 VKORC1L1-201ENST00000360768 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
EDIL3O43854 NOX3-201ENST00000159060 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
EDIL3O43854 FGF7P3-202ENST00000640245 1707 ntTSL 4 BASIC17.3■□□□□ 0.36
EDIL3O43854 AC011270.2-201ENST00000624293 2550 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
EDIL3O43854 SNX5-202ENST00000377768 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
EDIL3O43854 ZBTB4-202ENST00000380599 5866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
EDIL3O43854 CCDC140-201ENST00000295226 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
EDIL3O43854 CCNE1-203ENST00000444983 1680 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
EDIL3O43854 TRA2A-202ENST00000392502 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
EDIL3O43854 EML3-202ENST00000394773 3256 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
EDIL3O43854 NDUFA11-202ENST00000418389 2406 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
EDIL3O43854 TRAF3IP1-202ENST00000391993 4003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
EDIL3O43854 TSPYL5-201ENST00000322128 4491 ntAPPRIS P1 BASIC17.29■□□□□ 0.36
EDIL3O43854 ZNF19-208ENST00000565637 2612 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
EDIL3O43854 AGRP-201ENST00000290953 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
EDIL3O43854 NTMT1-202ENST00000372481 741 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.6 ms