Protein–RNA interactions for Protein: Q9UN81

L1RE1, LINE-1 retrotransposable element ORF1 protein, humanhuman

Predictions only

Length 338 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
L1RE1Q9UN81 AC004461.2-201ENST00000629517 803 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
L1RE1Q9UN81 TRIML1-201ENST00000332517 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
L1RE1Q9UN81 IL18BP-204ENST00000393703 1788 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
L1RE1Q9UN81 TSC2-207ENST00000439673 5287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
L1RE1Q9UN81 TAF6-201ENST00000344095 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
L1RE1Q9UN81 NEIL2-201ENST00000284503 2671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
L1RE1Q9UN81 GATA3-202ENST00000379328 3078 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
L1RE1Q9UN81 ORMDL3-204ENST00000579695 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
L1RE1Q9UN81 CRLF2-203ENST00000400841 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
L1RE1Q9UN81 LOX-206ENST00000639739 1626 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
L1RE1Q9UN81 MKS1-204ENST00000537529 2083 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
L1RE1Q9UN81 DEPDC7-202ENST00000311388 2012 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
L1RE1Q9UN81 GSN-215ENST00000545652 2428 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
L1RE1Q9UN81 ABCA1-203ENST00000423487 1540 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
L1RE1Q9UN81 FAM192A-201ENST00000309137 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
L1RE1Q9UN81 GRK6-203ENST00000393576 2792 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
L1RE1Q9UN81 PRR23C-201ENST00000413199 2791 ntAPPRIS P1 BASIC17.06■□□□□ 0.32
L1RE1Q9UN81 SLC35C2-204ENST00000372230 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
L1RE1Q9UN81 TRIM29-210ENST00000528870 2217 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
L1RE1Q9UN81 PDE1B-207ENST00000550620 2150 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
L1RE1Q9UN81 AP1M2-207ENST00000590923 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
L1RE1Q9UN81 KRT77-201ENST00000341809 3305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
L1RE1Q9UN81 LINC00900-201ENST00000499809 3322 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
L1RE1Q9UN81 UBAP1-202ENST00000359544 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
L1RE1Q9UN81 UGDH-201ENST00000316423 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
L1RE1Q9UN81 ABHD3-201ENST00000289119 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
L1RE1Q9UN81 PTBP1-203ENST00000356948 3598 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
L1RE1Q9UN81 TMPRSS3-204ENST00000433957 2403 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
L1RE1Q9UN81 CACNA2D2-203ENST00000423994 5329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
L1RE1Q9UN81 LLGL2-201ENST00000167462 3480 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
L1RE1Q9UN81 TAAR5-201ENST00000258034 1014 ntAPPRIS P1 BASIC17.05■□□□□ 0.32
L1RE1Q9UN81 CCDC182-201ENST00000299415 832 ntAPPRIS P1 BASIC17.05■□□□□ 0.32
L1RE1Q9UN81 TCF20-203ENST00000404876 1058 ntTSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
L1RE1Q9UN81 AL033519.3-201ENST00000450618 595 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
L1RE1Q9UN81 AL356441.1-201ENST00000452618 492 ntTSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
L1RE1Q9UN81 SNHG6-201ENST00000520348 648 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
L1RE1Q9UN81 FAU-205ENST00000527548 538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
L1RE1Q9UN81 AC084125.2-203ENST00000532766 821 ntTSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
L1RE1Q9UN81 AC010326.2-201ENST00000602124 1020 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
L1RE1Q9UN81 XRCC1-202ENST00000543982 1994 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
L1RE1Q9UN81 CCDC22-201ENST00000376227 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
L1RE1Q9UN81 TRAF7-201ENST00000326181 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
L1RE1Q9UN81 AGT-201ENST00000366667 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
L1RE1Q9UN81 TMEM132D-AS2-201ENST00000542578 1568 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
L1RE1Q9UN81 UBE2D1-204ENST00000615793 2621 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
L1RE1Q9UN81 B3GALNT1-203ENST00000392781 3606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
L1RE1Q9UN81 TAF5-201ENST00000369839 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
L1RE1Q9UN81 MARS-233ENST00000628866 2583 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
L1RE1Q9UN81 CYB561-219ENST00000584031 3200 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
L1RE1Q9UN81 ITGB1BP1-204ENST00000360635 4859 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
L1RE1Q9UN81 LRRC3-201ENST00000291592 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
L1RE1Q9UN81 NEK7-202ENST00000367385 4149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
L1RE1Q9UN81 C16orf58-201ENST00000327237 2793 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
L1RE1Q9UN81 C1QTNF2-201ENST00000393975 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
L1RE1Q9UN81 PPP1R16A-201ENST00000292539 2722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
L1RE1Q9UN81 CRB2-201ENST00000359999 3659 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
L1RE1Q9UN81 MFRP-205ENST00000619721 3917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
L1RE1Q9UN81 COL17A1-202ENST00000369733 5488 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
L1RE1Q9UN81 PEX5-206ENST00000434354 2253 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
L1RE1Q9UN81 FKBP5-201ENST00000357266 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
L1RE1Q9UN81 KCNMA1-201ENST00000286627 6194 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
L1RE1Q9UN81 MAN2A2-216ENST00000559717 6704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
L1RE1Q9UN81 ENDOV-204ENST00000518137 2815 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
L1RE1Q9UN81 FAM156A-206ENST00000612915 2233 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
L1RE1Q9UN81 KLC4-204ENST00000453940 1945 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
L1RE1Q9UN81 DNAJC14-201ENST00000317269 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
L1RE1Q9UN81 AP1M1-202ENST00000429941 1578 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
L1RE1Q9UN81 AC104407.1-201ENST00000511017 1568 ntTSL 3 BASIC17.04■□□□□ 0.32
L1RE1Q9UN81 SHTN1-204ENST00000392903 2400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
L1RE1Q9UN81 MRPL55-201ENST00000295008 632 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
L1RE1Q9UN81 MORN4-202ENST00000370635 419 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
L1RE1Q9UN81 LINC00229-201ENST00000443783 500 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
L1RE1Q9UN81 GNAQP1-201ENST00000444815 1067 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
L1RE1Q9UN81 IGFBP2-204ENST00000456764 846 ntTSL 3 BASIC17.04■□□□□ 0.32
L1RE1Q9UN81 AC092910.3-201ENST00000484076 969 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
L1RE1Q9UN81 ELOF1-205ENST00000589171 743 ntTSL 3 BASIC17.04■□□□□ 0.32
L1RE1Q9UN81 ZNF324B-203ENST00000594214 564 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
L1RE1Q9UN81 CREB3L2-208ENST00000620715 1053 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
L1RE1Q9UN81 KIAA1683-209ENST00000612316 2684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
L1RE1Q9UN81 ARID1A-205ENST00000457599 6268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
L1RE1Q9UN81 RAD51D-218ENST00000590016 1528 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
L1RE1Q9UN81 AC012414.7-201ENST00000621235 1507 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
L1RE1Q9UN81 MYH14-204ENST00000440075 4247 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
L1RE1Q9UN81 ACIN1-203ENST00000357481 2563 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
L1RE1Q9UN81 CHRNG-202ENST00000389494 2262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
L1RE1Q9UN81 AC013726.1-201ENST00000563747 2285 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
L1RE1Q9UN81 MAP3K8-201ENST00000263056 3096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
L1RE1Q9UN81 KCNC3-202ENST00000474951 3347 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
L1RE1Q9UN81 RSRP1-202ENST00000431849 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
L1RE1Q9UN81 CASC2-203ENST00000435944 3270 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
L1RE1Q9UN81 INTS4P1-202ENST00000587624 2985 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
L1RE1Q9UN81 SBNO2-202ENST00000438103 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
L1RE1Q9UN81 PITX2-204ENST00000394595 1693 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
L1RE1Q9UN81 PITPNM1-201ENST00000356404 4225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
L1RE1Q9UN81 ARC-201ENST00000356613 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
L1RE1Q9UN81 CLN3-201ENST00000333496 1608 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
L1RE1Q9UN81 SNHG22-201ENST00000589499 1615 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
L1RE1Q9UN81 HOXC12-201ENST00000243103 3335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
L1RE1Q9UN81 ARHGEF26-AS1-204ENST00000491862 2598 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
L1RE1Q9UN81 SHISA5-210ENST00000444115 2081 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.7 ms