Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRS6

SNX15, Sorting nexin-15, humanhuman

Predictions only

Length 342 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX15Q9NRS6 RPS17-201ENST00000330244 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SNX15Q9NRS6 C9orf116-202ENST00000371789 1278 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SNX15Q9NRS6 FBXO44-205ENST00000376768 959 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SNX15Q9NRS6 NDUFA3-204ENST00000391764 267 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SNX15Q9NRS6 AL627223.1-201ENST00000416693 442 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
SNX15Q9NRS6 BX842568.4-201ENST00000421222 227 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
SNX15Q9NRS6 AL137003.1-201ENST00000423260 491 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SNX15Q9NRS6 LITAF-210ENST00000571976 548 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SNX15Q9NRS6 LITAF-214ENST00000574703 486 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SNX15Q9NRS6 AC099811.2-203ENST00000592574 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SNX15Q9NRS6 AC007193.2-201ENST00000596807 472 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SNX15Q9NRS6 AL513210.1-201ENST00000629608 234 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
SNX15Q9NRS6 RBPJ-205ENST00000355476 5990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SNX15Q9NRS6 ELF2-202ENST00000379549 3005 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
SNX15Q9NRS6 NACC1-201ENST00000292431 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
SNX15Q9NRS6 ERG28-201ENST00000256319 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
SNX15Q9NRS6 GTF2IRD1-203ENST00000455841 3315 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
SNX15Q9NRS6 TAF1C-216ENST00000566732 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
SNX15Q9NRS6 AC007191.1-201ENST00000623179 2995 ntBASIC15.52■□□□□ 0.07
SNX15Q9NRS6 CNOT8-201ENST00000285896 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
SNX15Q9NRS6 CRYBG2-210ENST00000527815 2523 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
SNX15Q9NRS6 CAMSAP3-202ENST00000446248 4179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
SNX15Q9NRS6 FAM160B1-202ENST00000369248 5810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
SNX15Q9NRS6 ATP5B-201ENST00000262030 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
SNX15Q9NRS6 HEMK1-201ENST00000232854 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
SNX15Q9NRS6 MSH5-203ENST00000375750 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
SNX15Q9NRS6 GRK6-203ENST00000393576 2792 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
SNX15Q9NRS6 KCNQ4-201ENST00000347132 4099 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
SNX15Q9NRS6 RCOR2-201ENST00000301459 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SNX15Q9NRS6 FADS2-210ENST00000522056 1689 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SNX15Q9NRS6 ACE3P-201ENST00000423435 1973 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
SNX15Q9NRS6 RASSF5-201ENST00000577571 3496 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SNX15Q9NRS6 JRK-209ENST00000612905 9124 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SNX15Q9NRS6 CD19-201ENST00000324662 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SNX15Q9NRS6 ATP6AP2-233ENST00000638153 1303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SNX15Q9NRS6 SEMA5B-201ENST00000195173 4523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SNX15Q9NRS6 CACNA1A-202ENST00000573710 7569 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SNX15Q9NRS6 SPAG7-201ENST00000206020 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SNX15Q9NRS6 CENPM-201ENST00000215980 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SNX15Q9NRS6 RPS19-201ENST00000221975 500 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SNX15Q9NRS6 PFN4-201ENST00000313213 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SNX15Q9NRS6 C11orf71-201ENST00000325636 652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SNX15Q9NRS6 YBEY-201ENST00000329319 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SNX15Q9NRS6 STOM-202ENST00000347359 870 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SNX15Q9NRS6 C1QA-201ENST00000374642 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SNX15Q9NRS6 YBEY-206ENST00000397701 744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SNX15Q9NRS6 GPS2P2-201ENST00000430745 888 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
SNX15Q9NRS6 ZMYND10-AS1-201ENST00000440013 250 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SNX15Q9NRS6 HYPK-202ENST00000442995 1051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SNX15Q9NRS6 TWIST2-201ENST00000448943 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SNX15Q9NRS6 PTK7-212ENST00000476760 902 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SNX15Q9NRS6 NAALADL1-207ENST00000526799 959 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SNX15Q9NRS6 AC133919.2-202ENST00000563515 416 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SNX15Q9NRS6 AC007216.4-201ENST00000574364 562 ntTSL 4 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SNX15Q9NRS6 CIRBP-204ENST00000585630 870 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SNX15Q9NRS6 HEXIM2-206ENST00000591576 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SNX15Q9NRS6 RPS19-202ENST00000593863 526 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SNX15Q9NRS6 AC008761.1-201ENST00000595363 217 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SNX15Q9NRS6 RN7SL828P-201ENST00000607615 303 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
SNX15Q9NRS6 LINC01635-202ENST00000635097 1023 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SNX15Q9NRS6 PLIN3-202ENST00000585479 1535 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SNX15Q9NRS6 ITFG1-201ENST00000320640 3400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SNX15Q9NRS6 PCDHGB1-202ENST00000611598 2592 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SNX15Q9NRS6 ALAS2-201ENST00000330807 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SNX15Q9NRS6 SLC4A9-203ENST00000506545 2838 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SNX15Q9NRS6 MAPT-213ENST00000571987 2277 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SNX15Q9NRS6 SYT17-201ENST00000355377 3081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SNX15Q9NRS6 ZNF384-202ENST00000355772 2514 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SNX15Q9NRS6 PCDHGB8P-201ENST00000502926 1973 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
SNX15Q9NRS6 AC005089.1-201ENST00000619486 2241 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
SNX15Q9NRS6 PCSK5-205ENST00000545128 9538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SNX15Q9NRS6 TIGD4-201ENST00000304337 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SNX15Q9NRS6 KCNK4-TEX40-201ENST00000539086 2733 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SNX15Q9NRS6 FDPS-202ENST00000368356 1431 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SNX15Q9NRS6 MATN3-202ENST00000421259 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SNX15Q9NRS6 FCHO1-206ENST00000594202 3214 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SNX15Q9NRS6 TCP11-206ENST00000412155 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SNX15Q9NRS6 C1orf228-219ENST00000535358 1685 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SNX15Q9NRS6 TCP10-210ENST00000617120 2182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SNX15Q9NRS6 RPS6KL1-201ENST00000354625 5195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SNX15Q9NRS6 RTKN-202ENST00000272430 2142 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SNX15Q9NRS6 ZMIZ2-202ENST00000309315 5144 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SNX15Q9NRS6 CFLAR-205ENST00000342795 1613 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SNX15Q9NRS6 FAM114A2-215ENST00000522858 3379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SNX15Q9NRS6 MLF1-216ENST00000618075 2116 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SNX15Q9NRS6 ABCG4-205ENST00000619701 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SNX15Q9NRS6 RBM33-205ENST00000392759 1580 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SNX15Q9NRS6 GREB1-205ENST00000389825 1315 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SNX15Q9NRS6 UBXN11-205ENST00000374221 1792 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SNX15Q9NRS6 ADAM22-204ENST00000398204 9334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SNX15Q9NRS6 SGCE-205ENST00000437425 1508 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SNX15Q9NRS6 SUCO-210ENST00000616058 5495 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SNX15Q9NRS6 FBLN7-204ENST00000409667 1124 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SNX15Q9NRS6 AC004461.1-201ENST00000412461 403 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
SNX15Q9NRS6 FAM8A3P-201ENST00000427218 844 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
SNX15Q9NRS6 RPP21-221ENST00000428040 594 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SNX15Q9NRS6 RBPMS2P1-201ENST00000437762 623 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
SNX15Q9NRS6 SPDYE14P-201ENST00000442619 822 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
SNX15Q9NRS6 RPP21-224ENST00000442966 525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SNX15Q9NRS6 AC108047.1-201ENST00000457407 404 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.6 ms