Protein–RNA interactions for Protein: Q9BSH3

NICN1, Nicolin-1, humanhuman

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Length 213 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NICN1Q9BSH3 CRTC3-208ENST00000560098 1421 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
NICN1Q9BSH3 BEX3-201ENST00000361298 921 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
NICN1Q9BSH3 ADIPOR1-202ENST00000367254 1116 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
NICN1Q9BSH3 TMEM239-202ENST00000380585 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
NICN1Q9BSH3 ITGB2-204ENST00000397846 422 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
NICN1Q9BSH3 PP14571-201ENST00000404327 934 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
NICN1Q9BSH3 TTC31-205ENST00000442235 958 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
NICN1Q9BSH3 CTBP1-AS2-204ENST00000514984 533 ntTSL 4 BASIC13.42□□□□□ -0.26
NICN1Q9BSH3 PENK-208ENST00000523051 772 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
NICN1Q9BSH3 AL662844.1-201ENST00000546340 181 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
NICN1Q9BSH3 HNRNPUP1-201ENST00000554987 333 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
NICN1Q9BSH3 AL359317.2-203ENST00000557409 538 ntTSL 4 BASIC13.42□□□□□ -0.26
NICN1Q9BSH3 BEAN1-203ENST00000561796 1078 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
NICN1Q9BSH3 NDUFAB1-205ENST00000570319 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
NICN1Q9BSH3 COLQ-206ENST00000603808 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
NICN1Q9BSH3 PRF1-201ENST00000373209 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
NICN1Q9BSH3 ASAP1-202ENST00000518721 5507 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
NICN1Q9BSH3 GGT1-201ENST00000248923 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
NICN1Q9BSH3 CYP4F3-203ENST00000586182 2338 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
NICN1Q9BSH3 APBB1-218ENST00000608655 1920 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
NICN1Q9BSH3 LYPD5-203ENST00000594013 1519 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
NICN1Q9BSH3 MBD1-211ENST00000585595 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
NICN1Q9BSH3 MICA-209ENST00000449934 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
NICN1Q9BSH3 BCL11B-201ENST00000345514 7603 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
NICN1Q9BSH3 CHRNA7-201ENST00000306901 6181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
NICN1Q9BSH3 MRGPRX3-201ENST00000396275 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
NICN1Q9BSH3 MSI2-206ENST00000579180 1635 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
NICN1Q9BSH3 ATF7-205ENST00000548446 1892 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
NICN1Q9BSH3 LRRC6-213ENST00000620350 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
NICN1Q9BSH3 SLC35C1-201ENST00000314134 4171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
NICN1Q9BSH3 WDR20-203ENST00000335263 2616 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
NICN1Q9BSH3 UHRF1BP1L-201ENST00000279907 5168 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
NICN1Q9BSH3 ATP6V0D1-201ENST00000290949 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
NICN1Q9BSH3 ADAM15-204ENST00000359280 2874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
NICN1Q9BSH3 SRPK3-201ENST00000370100 1717 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
NICN1Q9BSH3 MAX-204ENST00000358402 1973 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
NICN1Q9BSH3 AKAP8P1-201ENST00000434743 1349 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
NICN1Q9BSH3 TEAD3-204ENST00000639578 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
NICN1Q9BSH3 MROH4P-201ENST00000431302 1578 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
NICN1Q9BSH3 AC008770.3-201ENST00000590798 1562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
NICN1Q9BSH3 BAIAP3-216ENST00000628027 4732 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
NICN1Q9BSH3 PHYH-203ENST00000396920 1829 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
NICN1Q9BSH3 ZNF286A-218ENST00000583566 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
NICN1Q9BSH3 GPR17-201ENST00000272644 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
NICN1Q9BSH3 TRPM2-AS-202ENST00000456880 2056 ntTSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
NICN1Q9BSH3 ANKRD20A5P-207ENST00000581935 2089 ntTSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
NICN1Q9BSH3 REC8-209ENST00000611366 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
NICN1Q9BSH3 PURA-201ENST00000331327 11497 ntAPPRIS P1 BASIC13.41□□□□□ -0.26
NICN1Q9BSH3 DBR1-201ENST00000260803 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
NICN1Q9BSH3 TSEN2-205ENST00000444864 2697 ntTSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
NICN1Q9BSH3 AC005912.2-201ENST00000619492 2400 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
NICN1Q9BSH3 CYB5R1-201ENST00000367249 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
NICN1Q9BSH3 MTX3-201ENST00000509852 1655 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
NICN1Q9BSH3 SRSF8-201ENST00000587424 4028 ntAPPRIS P1 BASIC13.41□□□□□ -0.26
NICN1Q9BSH3 SH2D3C-206ENST00000429553 2794 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
NICN1Q9BSH3 SH3KBP1-205ENST00000397821 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
NICN1Q9BSH3 ACSL3-202ENST00000392066 3147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
NICN1Q9BSH3 NPM1-201ENST00000296930 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
NICN1Q9BSH3 IL17RA-201ENST00000319363 8607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
NICN1Q9BSH3 CAAP1-206ENST00000625311 1532 ntTSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
NICN1Q9BSH3 THUMPD3-210ENST00000515662 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
NICN1Q9BSH3 PRLH-201ENST00000165524 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
NICN1Q9BSH3 HBQ1-201ENST00000199708 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
NICN1Q9BSH3 CCNL1-201ENST00000295925 549 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
NICN1Q9BSH3 BLZF1-202ENST00000367807 1295 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
NICN1Q9BSH3 TEX30-202ENST00000376021 1038 ntTSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
NICN1Q9BSH3 TEX30-206ENST00000376032 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
NICN1Q9BSH3 C6orf226-201ENST00000408925 552 ntAPPRIS P1 BASIC13.41□□□□□ -0.26
NICN1Q9BSH3 AL355306.1-201ENST00000415580 579 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
NICN1Q9BSH3 TPD52L1-211ENST00000532429 1022 ntTSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
NICN1Q9BSH3 CDC42EP4-206ENST00000581014 737 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
NICN1Q9BSH3 AC074135.2-201ENST00000600896 510 ntTSL 3 BASIC13.41□□□□□ -0.26
NICN1Q9BSH3 LINC01197-204ENST00000611265 956 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
NICN1Q9BSH3 IZUMO4-213ENST00000620263 947 ntTSL 3 BASIC13.41□□□□□ -0.26
NICN1Q9BSH3 UGGT2-213ENST00000638479 1010 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
NICN1Q9BSH3 KATNBL1-201ENST00000256544 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
NICN1Q9BSH3 KCNK4-TEX40-201ENST00000539086 2733 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
NICN1Q9BSH3 SHC1-204ENST00000368450 3059 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
NICN1Q9BSH3 SHC1-205ENST00000368453 3062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
NICN1Q9BSH3 CRYBG1-204ENST00000633556 9909 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
NICN1Q9BSH3 CAMKK2-202ENST00000337174 5304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
NICN1Q9BSH3 EDIL3-201ENST00000296591 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
NICN1Q9BSH3 HMGN1-204ENST00000380749 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
NICN1Q9BSH3 GPKOW-201ENST00000156109 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
NICN1Q9BSH3 SEPT11-206ENST00000505788 2079 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
NICN1Q9BSH3 MAGEA8-205ENST00000542674 2084 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.41□□□□□ -0.26
NICN1Q9BSH3 FUK-201ENST00000288078 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
NICN1Q9BSH3 KTN1-AS1-201ENST00000335142 1465 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
NICN1Q9BSH3 HSPA1B-201ENST00000375650 2521 ntAPPRIS P1 BASIC13.41□□□□□ -0.26
NICN1Q9BSH3 SRRT-217ENST00000618411 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
NICN1Q9BSH3 SBF1-202ENST00000380817 8008 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
NICN1Q9BSH3 FXYD6-201ENST00000260282 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
NICN1Q9BSH3 SNX14-202ENST00000346348 3348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
NICN1Q9BSH3 ZBED1P1-201ENST00000502364 1930 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
NICN1Q9BSH3 STARD8-202ENST00000374597 4820 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
NICN1Q9BSH3 TMEM30B-202ENST00000555868 4471 ntAPPRIS P1 BASIC13.41□□□□□ -0.26
NICN1Q9BSH3 CECR7-202ENST00000441006 2726 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
NICN1Q9BSH3 STEAP2-201ENST00000287908 6873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
NICN1Q9BSH3 ZBED1-201ENST00000381218 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
NICN1Q9BSH3 AC079336.5-201ENST00000581360 2480 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
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