Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQ08

RETNLB, Resistin-like beta, humanhuman

Predictions only

Length 111 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RETNLBQ9BQ08 TSC22D3-213ENST00000506081 956 ntTSL 5 BASIC9.36□□□□□ -0.91
RETNLBQ9BQ08 AC103957.2-201ENST00000521218 510 ntTSL 2 BASIC9.36□□□□□ -0.91
RETNLBQ9BQ08 TPT1-AS1-219ENST00000523506 574 ntTSL 4 BASIC9.36□□□□□ -0.91
RETNLBQ9BQ08 TMEM120B-206ENST00000540377 962 ntTSL 3 BASIC9.36□□□□□ -0.91
RETNLBQ9BQ08 ZNF606-202ENST00000546715 636 ntTSL 4 BASIC9.36□□□□□ -0.91
RETNLBQ9BQ08 NDUFA4L2-202ENST00000554503 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
RETNLBQ9BQ08 GREM1-201ENST00000560677 623 ntTSL 4 BASIC9.36□□□□□ -0.91
RETNLBQ9BQ08 AC140878.1-201ENST00000565277 250 ntBASIC9.36□□□□□ -0.91
RETNLBQ9BQ08 IL11-202ENST00000585513 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
RETNLBQ9BQ08 AC104985.1-201ENST00000587528 507 ntTSL 3 BASIC9.36□□□□□ -0.91
RETNLBQ9BQ08 AC013467.2-201ENST00000605472 835 ntBASIC9.36□□□□□ -0.91
RETNLBQ9BQ08 NAPA-AS1-201ENST00000593284 1753 ntTSL 2 BASIC9.36□□□□□ -0.91
RETNLBQ9BQ08 SATB2-211ENST00000614512 4972 ntTSL 5 BASIC9.36□□□□□ -0.91
RETNLBQ9BQ08 FBXL19-202ENST00000380310 3796 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC9.36□□□□□ -0.91
RETNLBQ9BQ08 PSMC3IP-202ENST00000393795 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
RETNLBQ9BQ08 C11orf49-204ENST00000395460 1916 ntTSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
RETNLBQ9BQ08 CEP72-201ENST00000264935 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
RETNLBQ9BQ08 SMURF2-201ENST00000262435 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
RETNLBQ9BQ08 ZNF7-207ENST00000528372 2905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
RETNLBQ9BQ08 ZNF536-201ENST00000355537 4945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
RETNLBQ9BQ08 SLC17A9-201ENST00000370349 2594 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
RETNLBQ9BQ08 ONECUT1-201ENST00000305901 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
RETNLBQ9BQ08 GET4-202ENST00000407192 4356 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
RETNLBQ9BQ08 ITGB7-201ENST00000267082 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
RETNLBQ9BQ08 KCNJ5-201ENST00000338350 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
RETNLBQ9BQ08 TACR2-202ENST00000373307 1740 ntTSL 2 BASIC9.36□□□□□ -0.91
RETNLBQ9BQ08 QRFPR-202ENST00000394427 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
RETNLBQ9BQ08 GGT6-203ENST00000573591 1730 ntTSL 4 BASIC9.36□□□□□ -0.91
RETNLBQ9BQ08 PLEKHA2-208ENST00000616927 1748 ntTSL 5 BASIC9.36□□□□□ -0.91
RETNLBQ9BQ08 AL512652.2-201ENST00000625156 1716 ntBASIC9.36□□□□□ -0.91
RETNLBQ9BQ08 CCDC155-201ENST00000447857 2378 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
RETNLBQ9BQ08 OSBPL1A-203ENST00000399441 1887 ntTSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
RETNLBQ9BQ08 LINC01660-203ENST00000618517 1859 ntTSL 2 BASIC9.36□□□□□ -0.91
RETNLBQ9BQ08 KRT76-201ENST00000332411 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
RETNLBQ9BQ08 CAB39-201ENST00000258418 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
RETNLBQ9BQ08 PRR12-203ENST00000615927 4479 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.36□□□□□ -0.91
RETNLBQ9BQ08 ACTR3-201ENST00000263238 6718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
RETNLBQ9BQ08 VPS13B-201ENST00000355155 2822 ntTSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
RETNLBQ9BQ08 RUSC1-201ENST00000292254 2163 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
RETNLBQ9BQ08 LIPE-AS1-201ENST00000457234 1501 ntTSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
RETNLBQ9BQ08 CD40-207ENST00000620709 1522 ntTSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
RETNLBQ9BQ08 ISG20L2-202ENST00000368219 2310 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.36□□□□□ -0.91
RETNLBQ9BQ08 TBX4-201ENST00000240335 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
RETNLBQ9BQ08 ARNT2-204ENST00000527771 2458 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC9.36□□□□□ -0.91
RETNLBQ9BQ08 RAD1-208ENST00000628399 1678 ntTSL 3 BASIC9.36□□□□□ -0.91
RETNLBQ9BQ08 GABRD-218ENST00000640949 1684 ntTSL 5 BASIC9.36□□□□□ -0.91
RETNLBQ9BQ08 NRXN1-210ENST00000406316 9375 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.35□□□□□ -0.91
RETNLBQ9BQ08 SLC39A8-202ENST00000394833 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
RETNLBQ9BQ08 TRIM39-205ENST00000396551 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.35□□□□□ -0.91
RETNLBQ9BQ08 PBX1-219ENST00000560641 3225 ntTSL 5 BASIC9.35□□□□□ -0.91
RETNLBQ9BQ08 ZDHHC13-201ENST00000399351 2283 ntTSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
RETNLBQ9BQ08 ATG5-210ENST00000636437 2261 ntTSL 5 BASIC9.35□□□□□ -0.91
RETNLBQ9BQ08 HNRNPH3-202ENST00000354695 1332 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
RETNLBQ9BQ08 B3GNT4-206ENST00000546192 2749 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.35□□□□□ -0.91
RETNLBQ9BQ08 RBM33-203ENST00000341148 7058 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
RETNLBQ9BQ08 AC068831.1-204ENST00000501381 1621 ntTSL 2 BASIC9.35□□□□□ -0.91
RETNLBQ9BQ08 AC105202.1-204ENST00000502167 1781 ntTSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
RETNLBQ9BQ08 FUT5-201ENST00000252675 1916 ntAPPRIS P1 BASIC9.35□□□□□ -0.91
RETNLBQ9BQ08 PTGES3-201ENST00000262033 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
RETNLBQ9BQ08 HDLBP-214ENST00000427183 6238 ntTSL 2 BASIC9.35□□□□□ -0.91
RETNLBQ9BQ08 ANKRD20A5P-207ENST00000581935 2089 ntTSL 2 BASIC9.35□□□□□ -0.91
RETNLBQ9BQ08 AL031731.1-201ENST00000642131 2094 ntBASIC9.35□□□□□ -0.91
RETNLBQ9BQ08 UPK3B-202ENST00000334348 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.35□□□□□ -0.91
RETNLBQ9BQ08 LITAF-201ENST00000339430 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
RETNLBQ9BQ08 SNAPC1-201ENST00000216294 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
RETNLBQ9BQ08 MGLL-201ENST00000265052 4642 ntTSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
RETNLBQ9BQ08 JMJD6-208ENST00000617192 5517 ntTSL 5 BASIC9.35□□□□□ -0.91
RETNLBQ9BQ08 BCL2L12-202ENST00000246785 1431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
RETNLBQ9BQ08 SRP19-201ENST00000282999 937 ntTSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
RETNLBQ9BQ08 POP7-201ENST00000303151 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
RETNLBQ9BQ08 MIR346-201ENST00000362234 95 ntBASIC9.35□□□□□ -0.91
RETNLBQ9BQ08 PI16-201ENST00000373674 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
RETNLBQ9BQ08 NME1-NME2-202ENST00000393193 1021 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC9.35□□□□□ -0.91
RETNLBQ9BQ08 CBX7-202ENST00000401405 784 ntTSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
RETNLBQ9BQ08 AC236430.1-201ENST00000402231 743 ntBASIC9.35□□□□□ -0.91
RETNLBQ9BQ08 TCF20-203ENST00000404876 1058 ntTSL 3 BASIC9.35□□□□□ -0.91
RETNLBQ9BQ08 AC008443.3-201ENST00000412295 549 ntTSL 4 BASIC9.35□□□□□ -0.91
RETNLBQ9BQ08 UGT1A2P-201ENST00000454886 866 ntBASIC9.35□□□□□ -0.91
RETNLBQ9BQ08 FXYD1-202ENST00000455515 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.35□□□□□ -0.91
RETNLBQ9BQ08 AC106897.1-201ENST00000512874 394 ntTSL 2 BASIC9.35□□□□□ -0.91
RETNLBQ9BQ08 RNA5SP421-201ENST00000516864 134 ntBASIC9.35□□□□□ -0.91
RETNLBQ9BQ08 CCNC-209ENST00000520371 2186 ntTSL 5 BASIC9.35□□□□□ -0.91
RETNLBQ9BQ08 AC019257.1-202ENST00000521498 445 ntTSL 5 BASIC9.35□□□□□ -0.91
RETNLBQ9BQ08 AP002490.2-201ENST00000524791 560 ntBASIC9.35□□□□□ -0.91
RETNLBQ9BQ08 AC027369.6-201ENST00000525520 931 ntBASIC9.35□□□□□ -0.91
RETNLBQ9BQ08 ASXL1-206ENST00000542461 1068 ntTSL 5 BASIC9.35□□□□□ -0.91
RETNLBQ9BQ08 AL512356.2-201ENST00000546955 174 ntBASIC9.35□□□□□ -0.91
RETNLBQ9BQ08 DIO3OS-208ENST00000556120 2473 ntTSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
RETNLBQ9BQ08 PFN1-203ENST00000574872 1173 ntTSL 2 BASIC9.35□□□□□ -0.91
RETNLBQ9BQ08 TNNT1-211ENST00000588426 683 ntTSL 5 BASIC9.35□□□□□ -0.91
RETNLBQ9BQ08 SSH2-211ENST00000590153 570 ntTSL 4 BASIC9.35□□□□□ -0.91
RETNLBQ9BQ08 AC016168.1-201ENST00000591422 722 ntTSL 3 BASIC9.35□□□□□ -0.91
RETNLBQ9BQ08 MZF1-202ENST00000594108 1110 ntTSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
RETNLBQ9BQ08 AC018529.1-201ENST00000613063 361 ntBASIC9.35□□□□□ -0.91
RETNLBQ9BQ08 RCAN3-211ENST00000630217 658 ntTSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
RETNLBQ9BQ08 EPS8L2-231ENST00000614442 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.35□□□□□ -0.91
RETNLBQ9BQ08 ADAM8-205ENST00000485491 2441 ntTSL 2 BASIC9.35□□□□□ -0.91
RETNLBQ9BQ08 TMEM53-203ENST00000372242 1846 ntTSL 3 BASIC9.35□□□□□ -0.91
RETNLBQ9BQ08 REPIN1-201ENST00000397281 3292 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC9.35□□□□□ -0.91
RETNLBQ9BQ08 FBLIM1-201ENST00000332305 1530 ntTSL 2 BASIC9.35□□□□□ -0.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.3 ms