Protein–RNA interactions for Protein: Q99536

VAT1, Synaptic vesicle membrane protein VAT-1 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 393 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VAT1Q99536 AL359258.1-201ENST00000438965 2481 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
VAT1Q99536 DUPD1-201ENST00000338487 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
VAT1Q99536 AL096814.1-202ENST00000372963 647 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
VAT1Q99536 AC104457.1-201ENST00000401024 814 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
VAT1Q99536 PCAT6-201ENST00000417262 748 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
VAT1Q99536 BASP1P1-201ENST00000430708 665 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
VAT1Q99536 FOLR3-201ENST00000442948 805 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
VAT1Q99536 C11orf98-202ENST00000525675 405 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
VAT1Q99536 AC108134.3-202ENST00000571404 1207 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
VAT1Q99536 AC004834.1-204ENST00000640670 1055 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
VAT1Q99536 ZNF19-208ENST00000565637 2612 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
VAT1Q99536 CCDC90B-213ENST00000529611 1986 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
VAT1Q99536 INPP5D-201ENST00000359570 5274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
VAT1Q99536 EPHX2-209ENST00000521780 2038 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
VAT1Q99536 CNOT8-204ENST00000517876 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
VAT1Q99536 PGC-202ENST00000373025 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
VAT1Q99536 IRF9-203ENST00000557894 1391 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
VAT1Q99536 AGAP7P-201ENST00000582299 2062 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
VAT1Q99536 TXNDC2-206ENST00000611534 2066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
VAT1Q99536 NR2E3-203ENST00000621098 2064 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
VAT1Q99536 AGAP14-201ENST00000624701 2060 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
VAT1Q99536 TAP2-205ENST00000620123 5676 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
VAT1Q99536 ZNF586-203ENST00000396154 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
VAT1Q99536 SEMA3B-212ENST00000616701 2958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
VAT1Q99536 PRR5-203ENST00000403581 2279 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
VAT1Q99536 TM6SF2-201ENST00000389363 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
VAT1Q99536 TSC1-202ENST00000403810 1507 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
VAT1Q99536 AC012414.7-201ENST00000621235 1507 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
VAT1Q99536 ADD2-208ENST00000430656 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
VAT1Q99536 TRIM62-204ENST00000543586 1638 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
VAT1Q99536 AGFG1-202ENST00000373671 1669 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
VAT1Q99536 TCP11-206ENST00000412155 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
VAT1Q99536 C1orf228-219ENST00000535358 1685 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
VAT1Q99536 DBET-201ENST00000630918 3363 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
VAT1Q99536 STMN1-203ENST00000399728 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
VAT1Q99536 DIRAS2-201ENST00000375765 4386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
VAT1Q99536 PLAGL1-208ENST00000437412 2640 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
VAT1Q99536 AC138904.3-201ENST00000635780 2681 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
VAT1Q99536 NSUN5P1-206ENST00000457988 1836 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
VAT1Q99536 MYLK2-201ENST00000375985 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
VAT1Q99536 CICP11-201ENST00000434745 2827 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
VAT1Q99536 SLC12A5-209ENST00000616201 2955 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
VAT1Q99536 ATG9A-205ENST00000409618 4025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
VAT1Q99536 YY1AP1-210ENST00000368339 3073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
VAT1Q99536 SYDE1-204ENST00000600440 3058 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
VAT1Q99536 MED26-201ENST00000263390 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
VAT1Q99536 LAP3-211ENST00000618908 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
VAT1Q99536 HTR3A-203ENST00000375498 2235 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
VAT1Q99536 SH3BP2-207ENST00000503393 9158 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
VAT1Q99536 MKNK2-201ENST00000250896 3774 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
VAT1Q99536 FLYWCH2-201ENST00000293981 915 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
VAT1Q99536 HIST2H3D-201ENST00000331491 411 ntAPPRIS P1 BASIC15.82■□□□□ 0.12
VAT1Q99536 C1orf43-203ENST00000368516 872 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
VAT1Q99536 HIST2H3PS2-201ENST00000392948 411 ntAPPRIS P1 BASIC15.82■□□□□ 0.12
VAT1Q99536 LINC01534-201ENST00000425254 815 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
VAT1Q99536 TMEM176B-205ENST00000450753 1006 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
VAT1Q99536 RHOA-206ENST00000454011 889 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
VAT1Q99536 AL512638.1-201ENST00000457493 794 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
VAT1Q99536 AC092183.1-201ENST00000469884 875 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
VAT1Q99536 IL32-211ENST00000525643 1272 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
VAT1Q99536 IL32-213ENST00000528163 950 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
VAT1Q99536 AP006621.2-201ENST00000533938 284 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
VAT1Q99536 PXN-AS1-204ENST00000542265 854 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
VAT1Q99536 ARL6IP1-202ENST00000546206 1107 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
VAT1Q99536 IL32-231ENST00000551513 791 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
VAT1Q99536 SRD5A3P1-201ENST00000603021 949 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
VAT1Q99536 GPR39-203ENST00000622084 900 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
VAT1Q99536 MIER1-208ENST00000401041 2552 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
VAT1Q99536 HNRNPH3-202ENST00000354695 1332 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
VAT1Q99536 LINC01301-205ENST00000531654 1347 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
VAT1Q99536 TRIM46-203ENST00000368383 2666 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
VAT1Q99536 ZFPL1-201ENST00000294258 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
VAT1Q99536 TARBP2-203ENST00000456234 1368 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
VAT1Q99536 CALM3-212ENST00000599839 1355 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
VAT1Q99536 MCFD2-201ENST00000319466 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
VAT1Q99536 ATP6V0E1-203ENST00000519374 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
VAT1Q99536 MAPK7-204ENST00000395604 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
VAT1Q99536 TUBBP5-201ENST00000290377 1563 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
VAT1Q99536 GRB2-202ENST00000316804 3248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
VAT1Q99536 TYSND1-202ENST00000335494 3397 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
VAT1Q99536 ZNF767P-201ENST00000463567 3520 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
VAT1Q99536 JRK-210ENST00000614134 8932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
VAT1Q99536 CDH7-203ENST00000536984 3766 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
VAT1Q99536 CCAR2-202ENST00000389279 3980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
VAT1Q99536 UGT8-201ENST00000310836 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
VAT1Q99536 RAB3IL1-201ENST00000301773 2125 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
VAT1Q99536 DEGS1-201ENST00000323699 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
VAT1Q99536 PAQR6-204ENST00000356983 2143 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
VAT1Q99536 CD5L-201ENST00000368174 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
VAT1Q99536 EPS8L2-218ENST00000530636 2469 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
VAT1Q99536 C16orf54-201ENST00000329410 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
VAT1Q99536 ANKRD26P3-201ENST00000454044 2748 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
VAT1Q99536 PBX3-204ENST00000373489 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
VAT1Q99536 SUSD4-204ENST00000366878 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
VAT1Q99536 NPHP4-211ENST00000622020 3004 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
VAT1Q99536 DISC1-209ENST00000439617 7059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
VAT1Q99536 TMTC1-206ENST00000551659 4228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
VAT1Q99536 PCDHA4-203ENST00000530339 5251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
VAT1Q99536 TFAP2C-201ENST00000201031 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
VAT1Q99536 TIMP3-201ENST00000266085 4603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.9 ms