Protein–RNA interactions for Protein: Q92696

RABGGTA, Geranylgeranyl transferase type-2 subunit alpha, humanhuman

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Length 567 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGGTAQ92696 MTA1-202ENST00000405646 2709 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
RABGGTAQ92696 TSC22D3-201ENST00000315660 2213 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
RABGGTAQ92696 KCNS1-201ENST00000306117 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
RABGGTAQ92696 WSCD1-210ENST00000574946 5884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
RABGGTAQ92696 TIPRL-202ENST00000367833 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
RABGGTAQ92696 PRKD2-206ENST00000595515 3012 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
RABGGTAQ92696 ARHGEF16-203ENST00000378378 3061 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
RABGGTAQ92696 NDOR1-202ENST00000371521 2497 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
RABGGTAQ92696 POR-201ENST00000394893 2532 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
RABGGTAQ92696 VAT1-202ENST00000420567 1069 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
RABGGTAQ92696 HHEX-203ENST00000492654 808 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
RABGGTAQ92696 PAM16-215ENST00000577031 548 ntTSL 4 BASIC17.36■□□□□ 0.37
RABGGTAQ92696 EIF6-209ENST00000621148 1054 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
RABGGTAQ92696 AC004461.2-201ENST00000629517 803 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
RABGGTAQ92696 VLDLR-202ENST00000382099 3240 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
RABGGTAQ92696 BEX4-202ENST00000372695 1328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
RABGGTAQ92696 FKBPL-201ENST00000375156 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
RABGGTAQ92696 ATP6AP2-201ENST00000378438 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
RABGGTAQ92696 SLC17A5-201ENST00000355773 3455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
RABGGTAQ92696 KLF5-201ENST00000377687 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
RABGGTAQ92696 ZNF586-203ENST00000396154 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
RABGGTAQ92696 AC007191.1-201ENST00000623179 2995 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
RABGGTAQ92696 DLX6-202ENST00000518156 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
RABGGTAQ92696 ARPP19-202ENST00000561650 3245 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
RABGGTAQ92696 PNPLA5-201ENST00000216177 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
RABGGTAQ92696 UBXN11-205ENST00000374221 1792 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
RABGGTAQ92696 PEPD-202ENST00000397032 1754 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
RABGGTAQ92696 CDH20-203ENST00000538374 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
RABGGTAQ92696 GTF2H2C-201ENST00000380729 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
RABGGTAQ92696 MMP2-201ENST00000219070 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
RABGGTAQ92696 SPDEF-202ENST00000544425 1866 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
RABGGTAQ92696 CICP4-201ENST00000447359 2812 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
RABGGTAQ92696 ICAM3-201ENST00000160262 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
RABGGTAQ92696 KCNJ14-201ENST00000342291 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
RABGGTAQ92696 MTCL1-203ENST00000400050 6042 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
RABGGTAQ92696 IL9R-202ENST00000369423 2032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
RABGGTAQ92696 GSKIP-201ENST00000438650 2140 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
RABGGTAQ92696 SLC30A5-202ENST00000396591 4360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
RABGGTAQ92696 POLL-206ENST00000370172 2308 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
RABGGTAQ92696 ADD2-208ENST00000430656 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
RABGGTAQ92696 LRRC28-202ENST00000331450 752 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
RABGGTAQ92696 ZSCAN2-203ENST00000334141 993 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
RABGGTAQ92696 CALY-202ENST00000368555 783 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
RABGGTAQ92696 ADIRF-201ENST00000372013 917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
RABGGTAQ92696 GAPDHP21-201ENST00000450301 1010 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
RABGGTAQ92696 RHBDL2-203ENST00000540558 697 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
RABGGTAQ92696 SLC8B1-206ENST00000549069 1058 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
RABGGTAQ92696 IL32-234ENST00000552936 713 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
RABGGTAQ92696 AC027575.2-201ENST00000585258 1295 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
RABGGTAQ92696 ZNF226-211ENST00000588742 447 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
RABGGTAQ92696 CHCHD2P3-201ENST00000603038 451 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
RABGGTAQ92696 MRNIP-225ENST00000610475 810 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
RABGGTAQ92696 SNHG28-203ENST00000621242 708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
RABGGTAQ92696 HOTAIRM1_1.1-201ENST00000622675 125 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
RABGGTAQ92696 DBI-211ENST00000627093 554 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
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RABGGTAQ92696 GLIDR-202ENST00000625350 2588 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
RABGGTAQ92696 AL583722.1-201ENST00000540171 1307 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
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RABGGTAQ92696 GFOD1-203ENST00000379287 8751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
RABGGTAQ92696 CHFR-204ENST00000443047 2990 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
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RABGGTAQ92696 SLC16A3-211ENST00000581287 4830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
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RABGGTAQ92696 CTNND2-214ENST00000511377 4336 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
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RABGGTAQ92696 EYA4-205ENST00000430974 2364 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
RABGGTAQ92696 NEBL-203ENST00000417816 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
RABGGTAQ92696 PTBP1-201ENST00000349038 3155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
RABGGTAQ92696 PTBP1-204ENST00000394601 3185 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
RABGGTAQ92696 PXN-221ENST00000637617 3246 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
RABGGTAQ92696 CAPN2-201ENST00000295006 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
RABGGTAQ92696 DKKL1-201ENST00000221498 1222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
RABGGTAQ92696 FMO5-201ENST00000254090 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
RABGGTAQ92696 MRPL53-201ENST00000258105 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
RABGGTAQ92696 BID-201ENST00000317361 2495 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
RABGGTAQ92696 FIBP-201ENST00000338369 1261 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
RABGGTAQ92696 CUTA-202ENST00000374496 762 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
RABGGTAQ92696 GRAP-202ENST00000395635 834 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
RABGGTAQ92696 R3HDM2P2-201ENST00000401880 2116 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
RABGGTAQ92696 SPDYE17-201ENST00000412399 783 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
RABGGTAQ92696 ETV5-206ENST00000434744 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
RABGGTAQ92696 APOA1-AS-201ENST00000444200 563 ntTSL 4 BASIC17.34■□□□□ 0.37
RABGGTAQ92696 LINC00996-201ENST00000477392 2043 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
RABGGTAQ92696 ZNF786-202ENST00000491431 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
RABGGTAQ92696 HARS2-206ENST00000508522 1562 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
RABGGTAQ92696 DOC2GP-202ENST00000514950 1163 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
RABGGTAQ92696 AL161757.4-201ENST00000554149 621 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
RABGGTAQ92696 CYP4F24P-201ENST00000586049 1580 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
RABGGTAQ92696 MIR4321-201ENST00000592276 80 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
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