Protein–RNA interactions for Protein: Q6NSW7

NANOGP8, Putative homeobox protein NANOGP8, humanhuman

Predictions only

Length 305 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NANOGP8Q6NSW7 AL671277.1-201ENST00000429656 993 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
NANOGP8Q6NSW7 PRSS42-201ENST00000429665 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
NANOGP8Q6NSW7 PQLC2L-205ENST00000461040 563 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.84□□□□□ -0.03
NANOGP8Q6NSW7 RAB7A-204ENST00000483906 533 ntTSL 3 BASIC14.84□□□□□ -0.03
NANOGP8Q6NSW7 NECAP2-208ENST00000504551 768 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
NANOGP8Q6NSW7 TMEM5-AS1-201ENST00000546214 563 ntTSL 4 BASIC14.84□□□□□ -0.03
NANOGP8Q6NSW7 CROCC-201ENST00000375541 6656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
NANOGP8Q6NSW7 C16orf52-202ENST00000542527 4360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
NANOGP8Q6NSW7 CAMKK2-209ENST00000446440 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
NANOGP8Q6NSW7 CPD-201ENST00000225719 9394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
NANOGP8Q6NSW7 RCSD1-202ENST00000367854 3135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
NANOGP8Q6NSW7 SCRN1-205ENST00000425819 1552 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
NANOGP8Q6NSW7 AC084364.1-201ENST00000551967 1556 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
NANOGP8Q6NSW7 BCKDHA-201ENST00000269980 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
NANOGP8Q6NSW7 AL354714.1-201ENST00000356006 2136 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
NANOGP8Q6NSW7 OPCML-IT1-201ENST00000533859 2936 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
NANOGP8Q6NSW7 SCAP-206ENST00000428413 3749 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
NANOGP8Q6NSW7 COBL-203ENST00000395542 5339 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
NANOGP8Q6NSW7 KCND3-201ENST00000302127 2659 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
NANOGP8Q6NSW7 MYO15B-237ENST00000642007 4893 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
NANOGP8Q6NSW7 HVCN1-202ENST00000356742 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
NANOGP8Q6NSW7 CLPTM1-202ENST00000541297 2732 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
NANOGP8Q6NSW7 OS9-207ENST00000439210 1946 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
NANOGP8Q6NSW7 PIP5K1C-202ENST00000537021 3326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
NANOGP8Q6NSW7 DUS4L-201ENST00000265720 2220 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
NANOGP8Q6NSW7 MAPT-213ENST00000571987 2277 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.03
NANOGP8Q6NSW7 PRRG2-201ENST00000246794 1404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.03
NANOGP8Q6NSW7 RBFA-202ENST00000306735 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
NANOGP8Q6NSW7 DNAJC14-203ENST00000357606 3416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.03
NANOGP8Q6NSW7 HNF4G-201ENST00000354370 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
NANOGP8Q6NSW7 CENPT-235ENST00000626059 1737 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.03
NANOGP8Q6NSW7 ANO10-213ENST00000451430 2019 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.03
NANOGP8Q6NSW7 CHRNA7-217ENST00000636603 2012 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.03
NANOGP8Q6NSW7 GRN-201ENST00000053867 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
NANOGP8Q6NSW7 GPR84-201ENST00000267015 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
NANOGP8Q6NSW7 PXYLP1-201ENST00000286353 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
NANOGP8Q6NSW7 TIFA-201ENST00000361717 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
NANOGP8Q6NSW7 TJP3-202ENST00000541714 3350 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
NANOGP8Q6NSW7 NEDD4-202ENST00000435532 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
NANOGP8Q6NSW7 COL6A2-201ENST00000300527 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
NANOGP8Q6NSW7 RNF182-208ENST00000544682 3495 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.83□□□□□ -0.04
NANOGP8Q6NSW7 CCNL1-201ENST00000295925 549 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
NANOGP8Q6NSW7 ITGA9-AS1-201ENST00000366441 895 ntTSL 3 BASIC14.83□□□□□ -0.04
NANOGP8Q6NSW7 HLA-H-201ENST00000383620 1096 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
NANOGP8Q6NSW7 MCFD2-203ENST00000409147 671 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
NANOGP8Q6NSW7 EVA1A-203ENST00000410010 696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
NANOGP8Q6NSW7 AL355306.1-201ENST00000415580 579 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
NANOGP8Q6NSW7 AL158071.2-201ENST00000423380 815 ntTSL 3 BASIC14.83□□□□□ -0.04
NANOGP8Q6NSW7 PRAP1-202ENST00000463201 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
NANOGP8Q6NSW7 STK32A-AS1-201ENST00000504297 863 ntTSL 3 BASIC14.83□□□□□ -0.04
NANOGP8Q6NSW7 AP000777.2-201ENST00000539897 501 ntTSL 4 BASIC14.83□□□□□ -0.04
NANOGP8Q6NSW7 SLC25A6P4-201ENST00000586535 553 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
NANOGP8Q6NSW7 MTX1-207ENST00000609421 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
NANOGP8Q6NSW7 AC020934.3-201ENST00000639810 348 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.83□□□□□ -0.04
NANOGP8Q6NSW7 THTPA-201ENST00000288014 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
NANOGP8Q6NSW7 SLC25A21-AS1-201ENST00000556667 1924 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
NANOGP8Q6NSW7 GGA1-206ENST00000406772 3205 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
NANOGP8Q6NSW7 PCCB-218ENST00000490504 1613 ntTSL 3 BASIC14.83□□□□□ -0.04
NANOGP8Q6NSW7 TMPRSS6-202ENST00000381792 3260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
NANOGP8Q6NSW7 KIAA0930-203ENST00000391627 2623 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
NANOGP8Q6NSW7 ALDH4A1-206ENST00000538839 2957 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
NANOGP8Q6NSW7 KCNC2-208ENST00000549446 5625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
NANOGP8Q6NSW7 HLA-A-201ENST00000376802 1334 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
NANOGP8Q6NSW7 TCP11-206ENST00000412155 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
NANOGP8Q6NSW7 ARHGEF26-203ENST00000465817 2353 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
NANOGP8Q6NSW7 STAT1-203ENST00000392323 2723 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
NANOGP8Q6NSW7 PLA2G4B-202ENST00000458483 2734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
NANOGP8Q6NSW7 PTGFRN-201ENST00000393203 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
NANOGP8Q6NSW7 CACNA1A-202ENST00000573710 7569 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
NANOGP8Q6NSW7 DNAJC22-201ENST00000395069 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
NANOGP8Q6NSW7 ZNF451-201ENST00000357489 4998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
NANOGP8Q6NSW7 CHID1-215ENST00000528581 1431 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
NANOGP8Q6NSW7 SLC1A7-206ENST00000620347 2873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
NANOGP8Q6NSW7 DDX50-206ENST00000610822 2510 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
NANOGP8Q6NSW7 NSUN5P1-206ENST00000457988 1836 ntTSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
NANOGP8Q6NSW7 SLC38A9-202ENST00000396865 2927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
NANOGP8Q6NSW7 LSMEM2-201ENST00000316436 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
NANOGP8Q6NSW7 TAGLN3-202ENST00000393917 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
NANOGP8Q6NSW7 GREM1-202ENST00000560830 2648 ntTSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
NANOGP8Q6NSW7 ALOX15-201ENST00000293761 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
NANOGP8Q6NSW7 CYB5D2-201ENST00000301391 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
NANOGP8Q6NSW7 HSDL1-201ENST00000219439 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
NANOGP8Q6NSW7 DPEP1-201ENST00000261615 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
NANOGP8Q6NSW7 DMAP1-201ENST00000315913 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
NANOGP8Q6NSW7 POLR1D-207ENST00000621089 1606 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
NANOGP8Q6NSW7 PGBD5-201ENST00000391860 10961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
NANOGP8Q6NSW7 PRSS30P-201ENST00000390681 2881 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
NANOGP8Q6NSW7 ABCC1-201ENST00000399408 6594 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
NANOGP8Q6NSW7 ABCC1-202ENST00000399410 6552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
NANOGP8Q6NSW7 SF3B4-201ENST00000271628 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
NANOGP8Q6NSW7 CLTA-201ENST00000242285 1152 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
NANOGP8Q6NSW7 C6orf226-201ENST00000408925 552 ntAPPRIS P1 BASIC14.82□□□□□ -0.04
NANOGP8Q6NSW7 AZGP1P1-201ENST00000411909 902 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
NANOGP8Q6NSW7 AL390729.1-201ENST00000456651 587 ntTSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
NANOGP8Q6NSW7 AL662844.1-201ENST00000546340 181 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
NANOGP8Q6NSW7 AC243965.1-201ENST00000557595 781 ntTSL 3 BASIC14.82□□□□□ -0.04
NANOGP8Q6NSW7 LRRC28-210ENST00000558879 581 ntTSL 4 BASIC14.82□□□□□ -0.04
NANOGP8Q6NSW7 BEAN1-203ENST00000561796 1078 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
NANOGP8Q6NSW7 AP000842.3-202ENST00000569238 1080 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
NANOGP8Q6NSW7 PFN1-203ENST00000574872 1173 ntTSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.5 ms