Protein–RNA interactions for Protein: Q5TDP6

LGSN, Lengsin, humanhuman

Predictions only

Length 509 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LGSNQ5TDP6 UNC5C-203ENST00000506749 2220 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
LGSNQ5TDP6 GPR137C-201ENST00000321662 3888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
LGSNQ5TDP6 USP38-202ENST00000510377 4135 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
LGSNQ5TDP6 ZNF385A-205ENST00000546970 2494 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
LGSNQ5TDP6 NUP93-201ENST00000308159 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
LGSNQ5TDP6 AL669918.1-201ENST00000452392 2705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
LGSNQ5TDP6 TCP10-210ENST00000617120 2182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
LGSNQ5TDP6 NSL1-203ENST00000366978 1344 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
LGSNQ5TDP6 ACTL7B-201ENST00000374667 2379 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
LGSNQ5TDP6 THUMPD3-210ENST00000515662 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
LGSNQ5TDP6 FOXRED2-201ENST00000216187 3933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
LGSNQ5TDP6 PVR-203ENST00000403059 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
LGSNQ5TDP6 EXOSC4-201ENST00000316052 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
LGSNQ5TDP6 MUC1-204ENST00000343256 648 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
LGSNQ5TDP6 BLZF1-202ENST00000367807 1295 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
LGSNQ5TDP6 CLIC1-208ENST00000375784 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
LGSNQ5TDP6 GUK1-210ENST00000391865 990 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
LGSNQ5TDP6 HNRNPA1P28-201ENST00000424481 961 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
LGSNQ5TDP6 PQLC2L-205ENST00000461040 563 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
LGSNQ5TDP6 AC009078.2-202ENST00000463353 338 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
LGSNQ5TDP6 RAB7A-204ENST00000483906 533 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
LGSNQ5TDP6 ZEB1-AS1-206ENST00000606250 573 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
LGSNQ5TDP6 CKMT1B-215ENST00000627381 1074 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
LGSNQ5TDP6 TUSC3-204ENST00000506802 1546 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
LGSNQ5TDP6 NFIC-202ENST00000395111 1755 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
LGSNQ5TDP6 RPTOR-203ENST00000570891 2286 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
LGSNQ5TDP6 ZEB2-225ENST00000558170 4012 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
LGSNQ5TDP6 ZKSCAN2-201ENST00000328086 7523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
LGSNQ5TDP6 NIPAL3-204ENST00000374399 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
LGSNQ5TDP6 RAPSN-202ENST00000352508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
LGSNQ5TDP6 MZF1-201ENST00000215057 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
LGSNQ5TDP6 MLPH-204ENST00000410032 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
LGSNQ5TDP6 ZMYM3-206ENST00000373988 6021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
LGSNQ5TDP6 ITPRIPL1-205ENST00000536814 1947 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
LGSNQ5TDP6 APBB1-218ENST00000608655 1920 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
LGSNQ5TDP6 TTC7A-202ENST00000394850 4306 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
LGSNQ5TDP6 MCHR2-201ENST00000281806 2368 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
LGSNQ5TDP6 DUOXA1-216ENST00000613425 1867 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
LGSNQ5TDP6 LINC00552-201ENST00000625151 2579 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
LGSNQ5TDP6 INSIG1-201ENST00000340368 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
LGSNQ5TDP6 TMEM169-204ENST00000437356 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
LGSNQ5TDP6 TMEM117-201ENST00000266534 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
LGSNQ5TDP6 ZNF18-201ENST00000322748 2767 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
LGSNQ5TDP6 FECH-202ENST00000382873 2526 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
LGSNQ5TDP6 OSBP2-209ENST00000438716 2747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
LGSNQ5TDP6 TRAF1-201ENST00000373887 6324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
LGSNQ5TDP6 TAF11-201ENST00000361288 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
LGSNQ5TDP6 C5orf30-202ENST00000510890 2933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
LGSNQ5TDP6 AJ011931.1-201ENST00000618749 2492 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
LGSNQ5TDP6 TPD52-201ENST00000379096 4041 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
LGSNQ5TDP6 AGPAT3-205ENST00000398063 5767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
LGSNQ5TDP6 NPM1-201ENST00000296930 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
LGSNQ5TDP6 SNHG18-201ENST00000508179 1799 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
LGSNQ5TDP6 PRRT2-207ENST00000572820 2403 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
LGSNQ5TDP6 SYT17-201ENST00000355377 3081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
LGSNQ5TDP6 EVC2-201ENST00000310917 4828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
LGSNQ5TDP6 SIGLEC8-203ENST00000430817 1528 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
LGSNQ5TDP6 SGCE-205ENST00000437425 1508 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
LGSNQ5TDP6 MBD1-211ENST00000585595 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
LGSNQ5TDP6 PERM1-201ENST00000341290 3035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
LGSNQ5TDP6 ISCA2-201ENST00000298818 851 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
LGSNQ5TDP6 TSPY2-201ENST00000320701 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
LGSNQ5TDP6 DPM3-203ENST00000368400 409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
LGSNQ5TDP6 TSPY2-203ENST00000429039 779 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
LGSNQ5TDP6 AC007967.2-201ENST00000432613 625 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
LGSNQ5TDP6 AL133375.1-201ENST00000500590 980 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
LGSNQ5TDP6 HNRNPUP1-201ENST00000554987 333 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
LGSNQ5TDP6 MAX-210ENST00000555419 765 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
LGSNQ5TDP6 NDUFAB1-205ENST00000570319 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
LGSNQ5TDP6 NAA38-207ENST00000576861 556 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
LGSNQ5TDP6 MIEN1-205ENST00000577810 806 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
LGSNQ5TDP6 AC074135.2-201ENST00000600896 510 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
LGSNQ5TDP6 CYB561-203ENST00000392976 3151 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
LGSNQ5TDP6 BORCS8-203ENST00000477565 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
LGSNQ5TDP6 KREMEN1-201ENST00000327813 2719 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
LGSNQ5TDP6 OSBPL5-210ENST00000525498 2733 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
LGSNQ5TDP6 PRRG1-203ENST00000463135 1663 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
LGSNQ5TDP6 TGFB1I1-203ENST00000394863 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
LGSNQ5TDP6 TRAF7-201ENST00000326181 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
LGSNQ5TDP6 PIDD1-202ENST00000411829 2886 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
LGSNQ5TDP6 CHID1-215ENST00000528581 1431 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
LGSNQ5TDP6 POLR1D-207ENST00000621089 1606 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
LGSNQ5TDP6 ATP5B-201ENST00000262030 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
LGSNQ5TDP6 DDIAS-203ENST00000525361 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
LGSNQ5TDP6 CAMK2D-211ENST00000511664 2210 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
LGSNQ5TDP6 CAVIN1-201ENST00000357037 3828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
LGSNQ5TDP6 UBE2D4-201ENST00000222402 3974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
LGSNQ5TDP6 BRF1-211ENST00000547530 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
LGSNQ5TDP6 IMPDH1-203ENST00000354269 2580 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
LGSNQ5TDP6 PSMD14-201ENST00000409682 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
LGSNQ5TDP6 ATE1-203ENST00000369043 4900 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
LGSNQ5TDP6 HMGN1-204ENST00000380749 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
LGSNQ5TDP6 MOCS1-201ENST00000340692 2747 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
LGSNQ5TDP6 TMEM30B-202ENST00000555868 4471 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
LGSNQ5TDP6 TSC22D1-211ENST00000501704 4026 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
LGSNQ5TDP6 IRF3-217ENST00000597198 1741 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
LGSNQ5TDP6 CD40-207ENST00000620709 1522 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
LGSNQ5TDP6 AC079336.5-201ENST00000581360 2480 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
LGSNQ5TDP6 MTRF1L-201ENST00000367230 3431 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
LGSNQ5TDP6 YTHDC1-202ENST00000355665 3244 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.9 ms