Protein–RNA interactions for Protein: Q587I9

SFT2D3, Vesicle transport protein SFT2C, humanhuman

Predictions only

Length 215 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SFT2D3Q587I9 PLD3-204ENST00000409281 2115 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SFT2D3Q587I9 HTR3E-202ENST00000415389 2139 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SFT2D3Q587I9 PSMA8-203ENST00000415576 1280 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SFT2D3Q587I9 TMEM120A-201ENST00000417509 1444 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SFT2D3Q587I9 DBH-AS1-201ENST00000425189 2139 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SFT2D3Q587I9 CDH23-AS1-201ENST00000428918 378 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SFT2D3Q587I9 HMGN1P19-201ENST00000436976 333 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
SFT2D3Q587I9 SHF-202ENST00000458022 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SFT2D3Q587I9 SSNA1-204ENST00000464553 723 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SFT2D3Q587I9 PAEP-208ENST00000479141 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SFT2D3Q587I9 DUSP13-210ENST00000491677 1770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SFT2D3Q587I9 BEST1-205ENST00000526988 1263 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SFT2D3Q587I9 LONP1-202ENST00000540670 3002 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SFT2D3Q587I9 WDR25-203ENST00000542471 1214 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SFT2D3Q587I9 AC068831.3-201ENST00000553321 1858 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SFT2D3Q587I9 GSKIP-205ENST00000555181 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SFT2D3Q587I9 AC051619.7-201ENST00000568314 623 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
SFT2D3Q587I9 AC018529.1-201ENST00000613063 361 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
SFT2D3Q587I9 AJ011931.1-201ENST00000618749 2492 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
SFT2D3Q587I9 AL138694.1-201ENST00000637731 1689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SFT2D3Q587I9 AC067930.6-201ENST00000623257 4947 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
SFT2D3Q587I9 TRIM72-201ENST00000322122 8500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SFT2D3Q587I9 VARS2-211ENST00000541562 3566 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SFT2D3Q587I9 HSDL1-201ENST00000219439 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SFT2D3Q587I9 ADAM15-202ENST00000355956 2877 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SFT2D3Q587I9 MEG9-201ENST00000429368 2638 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SFT2D3Q587I9 CAMKK2-203ENST00000347034 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SFT2D3Q587I9 CRYBG2-210ENST00000527815 2523 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SFT2D3Q587I9 ODF2-202ENST00000372791 2375 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SFT2D3Q587I9 RTKN-202ENST00000272430 2142 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SFT2D3Q587I9 AL354714.1-201ENST00000356006 2136 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SFT2D3Q587I9 MAGEA8-204ENST00000535454 2112 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SFT2D3Q587I9 OS9-207ENST00000439210 1946 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SFT2D3Q587I9 SPOCK2-202ENST00000373109 5445 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SFT2D3Q587I9 PHF19-203ENST00000419155 3525 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SFT2D3Q587I9 FBXW9-201ENST00000393261 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SFT2D3Q587I9 SLC39A6-202ENST00000440549 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SFT2D3Q587I9 TAB1-201ENST00000216160 3237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SFT2D3Q587I9 AC010327.5-201ENST00000586923 3061 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
SFT2D3Q587I9 LINC02495-201ENST00000508601 4167 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SFT2D3Q587I9 LDOC1-201ENST00000370526 1381 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SFT2D3Q587I9 WDR45-240ENST00000635003 1376 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SFT2D3Q587I9 TIMM50-220ENST00000607714 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SFT2D3Q587I9 GPAT3-201ENST00000264409 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SFT2D3Q587I9 SH3BP4-203ENST00000409212 5231 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SFT2D3Q587I9 GNAQ-201ENST00000286548 6539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SFT2D3Q587I9 COQ7-209ENST00000569127 2575 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SFT2D3Q587I9 RPL21-203ENST00000319826 806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SFT2D3Q587I9 LINC00313-201ENST00000332440 579 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SFT2D3Q587I9 ERAS-201ENST00000338270 1266 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SFT2D3Q587I9 C6orf99-202ENST00000367073 769 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SFT2D3Q587I9 POLR3GL-202ENST00000369314 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SFT2D3Q587I9 TNNC2-201ENST00000372555 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SFT2D3Q587I9 UBE2F-202ENST00000409332 1138 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SFT2D3Q587I9 AC107890.1-201ENST00000422478 521 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
SFT2D3Q587I9 AC026202.2-201ENST00000439325 672 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SFT2D3Q587I9 AC078942.1-201ENST00000448698 589 ntTSL 4 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SFT2D3Q587I9 LINC01481-203ENST00000549651 883 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SFT2D3Q587I9 DUX4L27-201ENST00000554796 1261 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
SFT2D3Q587I9 DDX50-206ENST00000610822 2510 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SFT2D3Q587I9 ARHGEF26-203ENST00000465817 2353 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SFT2D3Q587I9 IL17RD-208ENST00000640796 2345 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SFT2D3Q587I9 AC092127.1-201ENST00000567093 3455 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
SFT2D3Q587I9 CEP131-208ENST00000575907 3444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SFT2D3Q587I9 C1R-201ENST00000535233 2211 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SFT2D3Q587I9 GFOD1-203ENST00000379287 8751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SFT2D3Q587I9 DAB2IP-201ENST00000259371 5469 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SFT2D3Q587I9 PCDHA6-203ENST00000529310 5374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SFT2D3Q587I9 HTR7-203ENST00000371719 3033 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SFT2D3Q587I9 SYNRG-225ENST00000619541 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SFT2D3Q587I9 MAP3K12-205ENST00000547488 2807 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SFT2D3Q587I9 KCND3-201ENST00000302127 2659 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SFT2D3Q587I9 TOMM70-201ENST00000284320 4409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SFT2D3Q587I9 TONSL-203ENST00000613741 1713 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SFT2D3Q587I9 AC005622.1-201ENST00000636801 1703 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
SFT2D3Q587I9 MSI2-204ENST00000442934 1624 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SFT2D3Q587I9 ISG20L2-202ENST00000368219 2310 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SFT2D3Q587I9 CNTNAP3P2-201ENST00000617175 3861 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
SFT2D3Q587I9 CAMKV-217ENST00000620470 1485 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SFT2D3Q587I9 DDX59-206ENST00000447706 2900 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SFT2D3Q587I9 AMHR2-202ENST00000379791 1437 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SFT2D3Q587I9 TIA1-206ENST00000445587 1440 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SFT2D3Q587I9 CNOT10-201ENST00000328834 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SFT2D3Q587I9 C3orf62-201ENST00000343010 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SFT2D3Q587I9 ZFPL1-201ENST00000294258 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SFT2D3Q587I9 LLGL2-209ENST00000578363 1393 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SFT2D3Q587I9 TFE3-201ENST00000315869 3415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SFT2D3Q587I9 ZNF663P-201ENST00000400371 2722 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SFT2D3Q587I9 TBPL2-201ENST00000247219 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SFT2D3Q587I9 CDT1-201ENST00000301019 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SFT2D3Q587I9 CPSF6-203ENST00000456847 1915 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SFT2D3Q587I9 SLC25A21-AS1-201ENST00000556667 1924 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
SFT2D3Q587I9 AC093525.2-201ENST00000564543 1944 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SFT2D3Q587I9 ZNF524-201ENST00000301073 1102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SFT2D3Q587I9 S100A14-204ENST00000368702 1218 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SFT2D3Q587I9 C6orf52-202ENST00000379586 430 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SFT2D3Q587I9 MIR770-201ENST00000390219 98 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
SFT2D3Q587I9 BAD-202ENST00000394531 631 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SFT2D3Q587I9 PPP6R2P1-201ENST00000450880 1275 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
SFT2D3Q587I9 S100A14-206ENST00000476873 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 69.3 ms