Protein–RNA interactions for Protein: Q15843

NEDD8, NEDD8, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEDD8Q15843 GPR84-201ENST00000267015 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
NEDD8Q15843 CTCFL-205ENST00000423479 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
NEDD8Q15843 RAP1GAP-211ENST00000495204 2489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
NEDD8Q15843 NPFFR1-201ENST00000277942 8921 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.31□□□□□ -0.12
NEDD8Q15843 GPER1-203ENST00000397092 2971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.31□□□□□ -0.12
NEDD8Q15843 MARK4-201ENST00000262891 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
NEDD8Q15843 POU6F1-208ENST00000550824 2664 ntTSL 5 BASIC14.3□□□□□ -0.12
NEDD8Q15843 ELK4-202ENST00000357992 10239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
NEDD8Q15843 AC060234.2-201ENST00000428825 1610 ntTSL 5 BASIC14.3□□□□□ -0.12
NEDD8Q15843 MAPKAPK5-207ENST00000551404 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.3□□□□□ -0.12
NEDD8Q15843 RIN3-201ENST00000216487 3859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
NEDD8Q15843 RGS20-201ENST00000276500 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
NEDD8Q15843 GIT1-211ENST00000581348 2827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.3□□□□□ -0.12
NEDD8Q15843 FKBP9-201ENST00000242209 3462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
NEDD8Q15843 AL662899.1-201ENST00000461287 2332 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.3□□□□□ -0.12
NEDD8Q15843 ZKSCAN7-202ENST00000341840 1757 ntTSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
NEDD8Q15843 AC093668.2-201ENST00000481893 3569 ntTSL 2 BASIC14.3□□□□□ -0.12
NEDD8Q15843 AC105052.1-201ENST00000519541 3569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.3□□□□□ -0.12
NEDD8Q15843 PPP5D1-201ENST00000414155 1882 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC14.3□□□□□ -0.12
NEDD8Q15843 FAM90A1-203ENST00000538603 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
NEDD8Q15843 PYDC1-201ENST00000302964 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
NEDD8Q15843 RABL2A-202ENST00000393165 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
NEDD8Q15843 ABHD11-203ENST00000395147 812 ntTSL 3 BASIC14.3□□□□□ -0.12
NEDD8Q15843 AC114763.1-202ENST00000414911 867 ntTSL 3 BASIC14.3□□□□□ -0.12
NEDD8Q15843 DMKN-212ENST00000443640 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.3□□□□□ -0.12
NEDD8Q15843 AC092647.4-201ENST00000457211 535 ntBASIC14.3□□□□□ -0.12
NEDD8Q15843 TAGLN-206ENST00000530649 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
NEDD8Q15843 LY6L-201ENST00000562505 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.3□□□□□ -0.12
NEDD8Q15843 GZMM-202ENST00000592501 941 ntTSL 3 BASIC14.3□□□□□ -0.12
NEDD8Q15843 TUBB4A-209ENST00000598006 565 ntTSL 2 BASIC14.3□□□□□ -0.12
NEDD8Q15843 NDUFV2-AS1-203ENST00000608008 779 ntBASIC14.3□□□□□ -0.12
NEDD8Q15843 RBL1-201ENST00000344359 3225 ntTSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
NEDD8Q15843 TMEM140-201ENST00000275767 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
NEDD8Q15843 ZNF587-203ENST00000423137 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
NEDD8Q15843 PCDHGB8P-201ENST00000502926 1973 ntBASIC14.3□□□□□ -0.12
NEDD8Q15843 MGLL-201ENST00000265052 4642 ntTSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
NEDD8Q15843 PCDHGA3-203ENST00000619750 2695 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.3□□□□□ -0.12
NEDD8Q15843 RSBN1-201ENST00000261441 6621 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.3□□□□□ -0.12
NEDD8Q15843 COBL-205ENST00000441453 3785 ntTSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
NEDD8Q15843 NDUFV1-202ENST00000415352 1512 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.3□□□□□ -0.12
NEDD8Q15843 NSUN5P1-202ENST00000421140 1535 ntBASIC14.3□□□□□ -0.12
NEDD8Q15843 SHOX2-202ENST00000425436 1513 ntTSL 5 BASIC14.3□□□□□ -0.12
NEDD8Q15843 NSUN5P2-203ENST00000457352 1529 ntBASIC14.3□□□□□ -0.12
NEDD8Q15843 SGSH-203ENST00000570923 1546 ntTSL 2 BASIC14.3□□□□□ -0.12
NEDD8Q15843 AC018529.2-202ENST00000611482 3087 ntBASIC14.3□□□□□ -0.12
NEDD8Q15843 RAB3IP-204ENST00000378815 2386 ntTSL 2 BASIC14.3□□□□□ -0.12
NEDD8Q15843 VIPR1-202ENST00000433647 3161 ntTSL 2 BASIC14.3□□□□□ -0.12
NEDD8Q15843 SFSWAP-210ENST00000541286 3219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
NEDD8Q15843 ZNF683-201ENST00000349618 1610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
NEDD8Q15843 POLN-210ENST00000511885 3253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.3□□□□□ -0.12
NEDD8Q15843 RCAN2-203ENST00000371374 3327 ntTSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
NEDD8Q15843 RNF44-201ENST00000274811 4155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
NEDD8Q15843 LSS-211ENST00000522411 2523 ntTSL 2 BASIC14.3□□□□□ -0.12
NEDD8Q15843 SCARF1-201ENST00000263071 3443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
NEDD8Q15843 CLDN6-202ENST00000396925 1739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.29□□□□□ -0.12
NEDD8Q15843 FBXO34-201ENST00000313833 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
NEDD8Q15843 LINC02538-201ENST00000609107 4569 ntTSL 2 BASIC14.29□□□□□ -0.12
NEDD8Q15843 LRRC6-213ENST00000620350 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
NEDD8Q15843 CYP4F11-202ENST00000326742 2877 ntTSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
NEDD8Q15843 AC068888.1-207ENST00000546793 2863 ntTSL 2 BASIC14.29□□□□□ -0.12
NEDD8Q15843 TMEM200A-204ENST00000617887 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.29□□□□□ -0.12
NEDD8Q15843 MCRS1-211ENST00000550165 1936 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.29□□□□□ -0.12
NEDD8Q15843 AP5Z1-201ENST00000348624 2901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.29□□□□□ -0.12
NEDD8Q15843 MYLK-201ENST00000346322 5892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.29□□□□□ -0.12
NEDD8Q15843 SHOX-201ENST00000334060 1951 ntTSL 5 BASIC14.29□□□□□ -0.12
NEDD8Q15843 XRCC1-202ENST00000543982 1994 ntTSL 2 BASIC14.29□□□□□ -0.12
NEDD8Q15843 AC092535.1-201ENST00000417557 2165 ntTSL 2 BASIC14.29□□□□□ -0.12
NEDD8Q15843 SRP54-202ENST00000546080 2187 ntTSL 2 BASIC14.29□□□□□ -0.12
NEDD8Q15843 PPARGC1B-203ENST00000394320 4803 ntTSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
NEDD8Q15843 RER1-207ENST00000488353 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
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NEDD8Q15843 GGCT-202ENST00000275428 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
NEDD8Q15843 SGF29-201ENST00000317058 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
NEDD8Q15843 AURKAIP1-202ENST00000338338 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
NEDD8Q15843 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC14.29□□□□□ -0.12
NEDD8Q15843 LINC01128-207ENST00000449005 874 ntTSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
NEDD8Q15843 CDKN2AIPNL-202ENST00000458198 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
NEDD8Q15843 SLC30A5-203ENST00000502979 681 ntTSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
NEDD8Q15843 AC127526.4-201ENST00000527970 983 ntTSL 3 BASIC14.29□□□□□ -0.12
NEDD8Q15843 DCTPP1-205ENST00000568973 878 ntTSL 2 BASIC14.29□□□□□ -0.12
NEDD8Q15843 Z69720.1-201ENST00000601483 472 ntBASIC14.29□□□□□ -0.12
NEDD8Q15843 AC021097.1-201ENST00000607902 574 ntBASIC14.29□□□□□ -0.12
NEDD8Q15843 AL590627.2-201ENST00000637510 144 ntTSL 5 BASIC14.29□□□□□ -0.12
NEDD8Q15843 AL022326.1-202ENST00000641533 845 ntBASIC14.29□□□□□ -0.12
NEDD8Q15843 TMEM143-201ENST00000293261 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
NEDD8Q15843 FUK-202ENST00000378912 3925 ntTSL 2 BASIC14.29□□□□□ -0.12
NEDD8Q15843 HNRNPLL-205ENST00000409636 3980 ntTSL 2 BASIC14.29□□□□□ -0.12
NEDD8Q15843 RP1L1-202ENST00000382483 7973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
NEDD8Q15843 GLYCTK-201ENST00000305690 1371 ntTSL 5 BASIC14.29□□□□□ -0.12
NEDD8Q15843 KIFC3-202ENST00000421376 3128 ntTSL 2 BASIC14.29□□□□□ -0.12
NEDD8Q15843 CCDC88A-201ENST00000263630 9667 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
NEDD8Q15843 RASGEF1A-202ENST00000374459 3264 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.29□□□□□ -0.12
NEDD8Q15843 NR1H3-221ENST00000481889 1704 ntTSL 5 BASIC14.29□□□□□ -0.12
NEDD8Q15843 PRSS16-203ENST00000421826 1949 ntTSL 2 BASIC14.29□□□□□ -0.12
NEDD8Q15843 EIF2B3-210ENST00000620860 1923 ntTSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
NEDD8Q15843 AGPAT1-201ENST00000336984 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
NEDD8Q15843 RAPH1-213ENST00000630330 4134 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.29□□□□□ -0.12
NEDD8Q15843 CDH1-213ENST00000612417 2068 ntTSL 5 BASIC14.29□□□□□ -0.12
NEDD8Q15843 KCNJ11-204ENST00000528731 2146 ntTSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
NEDD8Q15843 XG-201ENST00000381174 2315 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
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