Protein–RNA interactions for Protein: Q15768

EFNB3, Ephrin-B3, humanhuman

Predictions only

Length 340 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFNB3Q15768 AL022328.1-201ENST00000610050 478 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
EFNB3Q15768 LINC01759-203ENST00000635271 888 ntTSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
EFNB3Q15768 AC004834.1-204ENST00000640670 1055 ntTSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
EFNB3Q15768 PRMT2-202ENST00000334494 1334 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
EFNB3Q15768 TEAD2-203ENST00000539846 1444 ntTSL 2 BASIC13.27□□□□□ -0.29
EFNB3Q15768 LONRF3-203ENST00000422289 2898 ntTSL 2 BASIC13.27□□□□□ -0.29
EFNB3Q15768 SURF4-207ENST00000545297 2863 ntTSL 2 BASIC13.27□□□□□ -0.29
EFNB3Q15768 C9orf172-201ENST00000436881 4387 ntAPPRIS P1 BASIC13.27□□□□□ -0.29
EFNB3Q15768 HNF1B-201ENST00000613727 1546 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
EFNB3Q15768 ZCCHC17-206ENST00000616393 1534 ntTSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
EFNB3Q15768 SIK3-201ENST00000375300 6213 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.27□□□□□ -0.29
EFNB3Q15768 TBC1D26-206ENST00000579428 1583 ntTSL 2 BASIC13.27□□□□□ -0.29
EFNB3Q15768 ARFGAP1-210ENST00000519273 3176 ntTSL 2 BASIC13.27□□□□□ -0.29
EFNB3Q15768 MSI2-201ENST00000284073 6364 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
EFNB3Q15768 CHIA-201ENST00000343320 1624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
EFNB3Q15768 KLHDC2-206ENST00000554589 1641 ntTSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
EFNB3Q15768 LILRB5-202ENST00000345866 1864 ntTSL 2 BASIC13.27□□□□□ -0.29
EFNB3Q15768 CCR7-203ENST00000579344 1874 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
EFNB3Q15768 NR4A3-204ENST00000618101 5706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
EFNB3Q15768 CACNA1A-240ENST00000637432 7809 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
EFNB3Q15768 PITPNA-201ENST00000313486 3912 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
EFNB3Q15768 RAP1GDS1-203ENST00000380158 2085 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
EFNB3Q15768 APLP1-202ENST00000537454 2266 ntTSL 2 BASIC13.27□□□□□ -0.29
EFNB3Q15768 RASGRP2-201ENST00000354024 2310 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
EFNB3Q15768 DAGLB-204ENST00000436575 2385 ntTSL 2 BASIC13.27□□□□□ -0.29
EFNB3Q15768 MBD4-203ENST00000429544 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
EFNB3Q15768 ANKS6-202ENST00000375019 2586 ntTSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
EFNB3Q15768 KIFC1-211ENST00000428849 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
EFNB3Q15768 TMEM19-201ENST00000266673 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
EFNB3Q15768 NRXN1-204ENST00000401669 5870 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
EFNB3Q15768 GOLM1-203ENST00000388712 3046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
EFNB3Q15768 PPP1R16B-201ENST00000299824 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
EFNB3Q15768 CHID1-201ENST00000323578 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
EFNB3Q15768 PCDH10-201ENST00000264360 8489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
EFNB3Q15768 TSPOAP1-202ENST00000343736 5947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
EFNB3Q15768 MAP2K5-201ENST00000178640 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
EFNB3Q15768 ABHD3-201ENST00000289119 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
EFNB3Q15768 EIF4A1-201ENST00000293831 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
EFNB3Q15768 NPHP3-201ENST00000337331 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
EFNB3Q15768 ARFIP1-202ENST00000356064 1302 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
EFNB3Q15768 MBP-203ENST00000359645 1255 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
EFNB3Q15768 STYXL1-203ENST00000359697 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
EFNB3Q15768 MGEA5-203ENST00000370094 3314 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
EFNB3Q15768 UCHL3-201ENST00000377595 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
EFNB3Q15768 AMT-202ENST00000395338 1831 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
EFNB3Q15768 PDE1C-202ENST00000396182 2420 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
EFNB3Q15768 AC141586.1-201ENST00000399702 2748 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
EFNB3Q15768 DGCR6-202ENST00000413981 1039 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
EFNB3Q15768 SHOX2-202ENST00000425436 1513 ntTSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
EFNB3Q15768 MST1L-201ENST00000442552 2185 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
EFNB3Q15768 SNHG11-212ENST00000449351 954 ntTSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
EFNB3Q15768 CCDC136-212ENST00000487361 2268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
EFNB3Q15768 FAM172A-204ENST00000505869 1387 ntTSL 2 BASIC13.26□□□□□ -0.29
EFNB3Q15768 AC012531.3-201ENST00000513209 777 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.26□□□□□ -0.29
EFNB3Q15768 HBS1L-208ENST00000525067 582 ntTSL 3 BASIC13.26□□□□□ -0.29
EFNB3Q15768 ST8SIA2-202ENST00000539113 1089 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
EFNB3Q15768 NEO1-207ENST00000560262 4315 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
EFNB3Q15768 GCHFR-206ENST00000561160 572 ntTSL 3 BASIC13.26□□□□□ -0.29
EFNB3Q15768 MAP4K1-208ENST00000589130 2654 ntTSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
EFNB3Q15768 AC008770.3-201ENST00000590798 1562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.26□□□□□ -0.29
EFNB3Q15768 AL512343.1-201ENST00000605837 169 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
EFNB3Q15768 MUC1-228ENST00000620103 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
EFNB3Q15768 GPR39-203ENST00000622084 900 ntTSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
EFNB3Q15768 AC018665.1-201ENST00000622927 1362 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
EFNB3Q15768 AC005252.2-201ENST00000624630 1141 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
EFNB3Q15768 MYRIP-202ENST00000396217 4877 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
EFNB3Q15768 CCNY-202ENST00000339497 4630 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
EFNB3Q15768 RAB40B-206ENST00000571995 3859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
EFNB3Q15768 MYCBPAP-203ENST00000436259 3102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
EFNB3Q15768 JRK-203ENST00000571961 2687 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
EFNB3Q15768 RBFOX1-212ENST00000550418 4775 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
EFNB3Q15768 AP000253.1-201ENST00000449339 2233 ntTSL 3 BASIC13.25□□□□□ -0.29
EFNB3Q15768 NELFA-203ENST00000411638 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
EFNB3Q15768 GPRIN1-201ENST00000303991 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
EFNB3Q15768 TKT-202ENST00000423516 2075 ntTSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
EFNB3Q15768 ZNF143-213ENST00000530463 2022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
EFNB3Q15768 DGAT1-206ENST00000528718 3711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
EFNB3Q15768 SQSTM1-213ENST00000510187 1714 ntTSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
EFNB3Q15768 TNIP1-217ENST00000523200 1743 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
EFNB3Q15768 AP1M1-211ENST00000590756 1705 ntTSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
EFNB3Q15768 TMEM184A-201ENST00000297477 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
EFNB3Q15768 C21orf33-202ENST00000348499 1506 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
EFNB3Q15768 ARL8B-201ENST00000256496 3005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
EFNB3Q15768 ZP3-201ENST00000336517 1483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
EFNB3Q15768 CD2BP2-203ENST00000569466 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
EFNB3Q15768 COL4A3BP-204ENST00000405807 2843 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
EFNB3Q15768 RAD23B-201ENST00000358015 4119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
EFNB3Q15768 SLC25A36-201ENST00000324194 1301 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
EFNB3Q15768 SNHG20-204ENST00000566583 1338 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
EFNB3Q15768 SOD1-201ENST00000270142 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
EFNB3Q15768 TEX12-201ENST00000280358 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
EFNB3Q15768 POLR2J-201ENST00000292614 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
EFNB3Q15768 RHCE-205ENST00000349438 1235 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
EFNB3Q15768 NAA10-201ENST00000370009 837 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
EFNB3Q15768 NAA10-203ENST00000370015 1002 ntTSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
EFNB3Q15768 ARRB2-203ENST00000381488 1236 ntTSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
EFNB3Q15768 PGF-202ENST00000405431 666 ntTSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
EFNB3Q15768 BAATP1-201ENST00000412284 1225 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
EFNB3Q15768 AC022210.1-201ENST00000449856 793 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
EFNB3Q15768 AL353747.3-201ENST00000454185 579 ntTSL 3 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.2 ms