Protein–RNA interactions for Protein: Q15078

CDK5R1, Cyclin-dependent kinase 5 activator 1, humanhuman

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Length 307 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK5R1Q15078 UBAP1-202ENST00000359544 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
CDK5R1Q15078 FARS2-202ENST00000324331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
CDK5R1Q15078 CMPK1-203ENST00000371873 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
CDK5R1Q15078 OPCML-IT1-201ENST00000533859 2936 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
CDK5R1Q15078 CHIA-201ENST00000343320 1624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
CDK5R1Q15078 PATZ1-203ENST00000351933 3638 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
CDK5R1Q15078 NYAP1-201ENST00000300179 3581 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
CDK5R1Q15078 LINC02395-201ENST00000546821 3157 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
CDK5R1Q15078 IL1RN-203ENST00000361779 1922 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
CDK5R1Q15078 GPANK1-203ENST00000375896 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
CDK5R1Q15078 PLIN3-202ENST00000585479 1535 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
CDK5R1Q15078 CD8A-203ENST00000409511 3048 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
CDK5R1Q15078 PPP2R5C-204ENST00000422945 4481 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
CDK5R1Q15078 RNASEH2B-202ENST00000422660 4830 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
CDK5R1Q15078 LAP3-201ENST00000226299 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
CDK5R1Q15078 APAF1-203ENST00000359972 7029 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
CDK5R1Q15078 AC062028.1-203ENST00000447433 1472 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
CDK5R1Q15078 EEF1AKMT3-201ENST00000300209 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
CDK5R1Q15078 ACIN1-203ENST00000357481 2563 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
CDK5R1Q15078 CTSA-202ENST00000354880 1820 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
CDK5R1Q15078 NDRG2-226ENST00000554104 2146 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
CDK5R1Q15078 MLF1-216ENST00000618075 2116 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
CDK5R1Q15078 GRB2-201ENST00000316615 3181 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
CDK5R1Q15078 CAVIN1-201ENST00000357037 3828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
CDK5R1Q15078 TMCC2-202ENST00000330675 2780 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
CDK5R1Q15078 HSPB7-202ENST00000375718 2415 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
CDK5R1Q15078 UBL7-209ENST00000567435 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
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CDK5R1Q15078 MUTYH-211ENST00000456914 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
CDK5R1Q15078 PIP5K1C-202ENST00000537021 3326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
CDK5R1Q15078 RTEL1-205ENST00000370018 4955 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
CDK5R1Q15078 COG8-206ENST00000306875 4247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
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CDK5R1Q15078 CLTA-201ENST00000242285 1152 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
CDK5R1Q15078 HINT1-201ENST00000304043 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
CDK5R1Q15078 BEX3-201ENST00000361298 921 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
CDK5R1Q15078 BLZF1-202ENST00000367807 1295 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
CDK5R1Q15078 DPM3-203ENST00000368400 409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
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CDK5R1Q15078 HMGN4-201ENST00000377575 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
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CDK5R1Q15078 STAT1-203ENST00000392323 2723 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
CDK5R1Q15078 PWWP2A-201ENST00000307063 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
CDK5R1Q15078 CCNY-201ENST00000265375 4768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
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CDK5R1Q15078 UBE2D4-201ENST00000222402 3974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
CDK5R1Q15078 ZNF586-202ENST00000396150 1977 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
CDK5R1Q15078 C11orf71-202ENST00000623205 1980 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
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CDK5R1Q15078 C20orf166-AS1-203ENST00000475015 2585 ntTSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
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CDK5R1Q15078 PF4-201ENST00000296029 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
CDK5R1Q15078 MIR346-201ENST00000362234 95 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
CDK5R1Q15078 AL671277.1-201ENST00000429656 993 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
CDK5R1Q15078 FDX1P1-201ENST00000449115 551 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
CDK5R1Q15078 RN7SL589P-201ENST00000481268 310 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
CDK5R1Q15078 FXR1-221ENST00000491674 365 ntTSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
CDK5R1Q15078 AP000777.2-201ENST00000539897 501 ntTSL 4 BASIC13.72□□□□□ -0.21
CDK5R1Q15078 AC011247.3-202ENST00000605062 570 ntTSL 4 BASIC13.72□□□□□ -0.21
CDK5R1Q15078 PDE6G-204ENST00000573076 1505 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
CDK5R1Q15078 FAM49B-201ENST00000401979 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
CDK5R1Q15078 DIS3-202ENST00000377780 5232 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
CDK5R1Q15078 EPB41L3-201ENST00000341928 4706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
CDK5R1Q15078 NDOR1-202ENST00000371521 2497 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
CDK5R1Q15078 EHF-210ENST00000531794 1481 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
CDK5R1Q15078 ZFYVE28-201ENST00000290974 4131 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
CDK5R1Q15078 FLI1-205ENST00000527786 4127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
CDK5R1Q15078 SHTN1-204ENST00000392903 2400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
CDK5R1Q15078 GLG1-203ENST00000447066 3626 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
CDK5R1Q15078 COX6B2-201ENST00000326529 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
CDK5R1Q15078 LETMD1-203ENST00000418425 2123 ntTSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
CDK5R1Q15078 COPS3-201ENST00000268717 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
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