Protein–RNA interactions for Protein: Q13748

TUBA3C, Tubulin alpha-3C/D chain, humanhuman

Predictions only

Length 450 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TUBA3CQ13748 PTBP1-204ENST00000394601 3185 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
TUBA3CQ13748 IRF3-217ENST00000597198 1741 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
TUBA3CQ13748 CLDND1-222ENST00000510545 2124 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
TUBA3CQ13748 AC009053.1-201ENST00000566802 2320 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
TUBA3CQ13748 CHD4-210ENST00000544040 6514 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
TUBA3CQ13748 MRPL16-201ENST00000300151 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
TUBA3CQ13748 LCE1E-201ENST00000368770 1180 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
TUBA3CQ13748 C1QA-201ENST00000374642 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
TUBA3CQ13748 IGHV3-23-201ENST00000390609 432 ntAPPRIS P1 BASIC14.98□□□□□ -0.01
TUBA3CQ13748 SNCA-205ENST00000394991 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
TUBA3CQ13748 AC008443.3-201ENST00000412295 549 ntTSL 4 BASIC14.98□□□□□ -0.01
TUBA3CQ13748 RPL37AP1-201ENST00000412502 279 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
TUBA3CQ13748 AC104135.1-201ENST00000418001 763 ntTSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
TUBA3CQ13748 RCAN3-204ENST00000425530 997 ntTSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
TUBA3CQ13748 TMEM120A-203ENST00000439537 1161 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
TUBA3CQ13748 PIGZ-204ENST00000443835 675 ntTSL 4 BASIC14.98□□□□□ -0.01
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TUBA3CQ13748 TCP11L1-201ENST00000334274 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
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TUBA3CQ13748 TAF1C-216ENST00000566732 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
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TUBA3CQ13748 ACOT7-204ENST00000377855 1614 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
TUBA3CQ13748 GALNTL6-205ENST00000511251 2905 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
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TUBA3CQ13748 ZBED1-201ENST00000381218 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
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TUBA3CQ13748 ACOX3-203ENST00000503233 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
TUBA3CQ13748 LINC01144-201ENST00000626198 1710 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
TUBA3CQ13748 XPO6-201ENST00000304658 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
TUBA3CQ13748 TVP23C-210ENST00000584811 2989 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
TUBA3CQ13748 PCGF3-213ENST00000620529 1899 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
TUBA3CQ13748 TTC29-208ENST00000513335 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
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TUBA3CQ13748 KLK3-202ENST00000360617 1664 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
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TUBA3CQ13748 GPR108-202ENST00000430424 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
TUBA3CQ13748 AZI2-205ENST00000420543 1366 ntTSL 3 BASIC14.97□□□□□ -0.01
TUBA3CQ13748 DXO-203ENST00000375356 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
TUBA3CQ13748 WBP4-201ENST00000379487 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
TUBA3CQ13748 TMEM51-202ENST00000376014 1843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
TUBA3CQ13748 RAF1-205ENST00000442415 3085 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
TUBA3CQ13748 DIAPH2-204ENST00000373054 3376 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
TUBA3CQ13748 AL928654.2-201ENST00000551271 2279 ntTSL 3 BASIC14.96□□□□□ -0.01
TUBA3CQ13748 GLIDR-202ENST00000625350 2588 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
TUBA3CQ13748 LMX1B-204ENST00000561065 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
TUBA3CQ13748 JPH4-201ENST00000356300 4278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
TUBA3CQ13748 MFSD13A-201ENST00000238936 2852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
TUBA3CQ13748 MRPS21-201ENST00000581066 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
TUBA3CQ13748 SLC35A2-204ENST00000376521 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
TUBA3CQ13748 LOX-206ENST00000639739 1626 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
TUBA3CQ13748 SNED1-202ENST00000342631 1930 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
TUBA3CQ13748 ANKRD20A5P-207ENST00000581935 2089 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
TUBA3CQ13748 PRKAG3-206ENST00000529249 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
TUBA3CQ13748 SLC4A9-203ENST00000506545 2838 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
TUBA3CQ13748 PPP1R26-202ENST00000401470 4769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
TUBA3CQ13748 REEP3-201ENST00000373758 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
TUBA3CQ13748 LMAN1-201ENST00000251047 5521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
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