Protein–RNA interactions for Protein: Q12951

FOXI1, Forkhead box protein I1, humanhuman

Predictions only

Length 378 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXI1Q12951 PIPOX-201ENST00000323372 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
FOXI1Q12951 CFAP52-202ENST00000396219 1912 ntTSL 2 BASIC11.01□□□□□ -0.65
FOXI1Q12951 MEFV-201ENST00000219596 3499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
FOXI1Q12951 ERP29-203ENST00000546477 1698 ntTSL 3 BASIC11.01□□□□□ -0.65
FOXI1Q12951 BCL2L12-202ENST00000246785 1431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
FOXI1Q12951 CGN-201ENST00000271636 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
FOXI1Q12951 FAM156A-221ENST00000622447 3757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
FOXI1Q12951 STARD8-202ENST00000374597 4820 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
FOXI1Q12951 PSMD13-212ENST00000532097 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
FOXI1Q12951 CCP110-201ENST00000381396 5446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
FOXI1Q12951 GTF2IRD1-202ENST00000424337 3077 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
FOXI1Q12951 CDC42-203ENST00000400259 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
FOXI1Q12951 ZNF208-205ENST00000601773 2027 ntTSL 2 BASIC11.01□□□□□ -0.65
FOXI1Q12951 SLC22A7-202ENST00000372585 2555 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
FOXI1Q12951 RMDN3-201ENST00000260385 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
FOXI1Q12951 ARAP1-203ENST00000393605 4778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
FOXI1Q12951 SLC1A7-206ENST00000620347 2873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
FOXI1Q12951 NEFH-201ENST00000310624 3783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
FOXI1Q12951 TRPV4-202ENST00000418703 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
FOXI1Q12951 CBX7-201ENST00000216133 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
FOXI1Q12951 CTSG-201ENST00000216336 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
FOXI1Q12951 GHSR-201ENST00000241256 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
FOXI1Q12951 NDUFA3-201ENST00000303553 379 ntTSL 2 BASIC11.01□□□□□ -0.65
FOXI1Q12951 PHPT1-202ENST00000371661 985 ntTSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
FOXI1Q12951 SUMO1-201ENST00000392244 831 ntTSL 2 BASIC11.01□□□□□ -0.65
FOXI1Q12951 MCFD2-203ENST00000409147 671 ntTSL 2 BASIC11.01□□□□□ -0.65
FOXI1Q12951 SUMO1-209ENST00000409712 761 ntTSL 2 BASIC11.01□□□□□ -0.65
FOXI1Q12951 IGLL3P-201ENST00000412472 434 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
FOXI1Q12951 AL354836.1-201ENST00000414042 681 ntTSL 2 BASIC11.01□□□□□ -0.65
FOXI1Q12951 NPM2-204ENST00000518119 1190 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
FOXI1Q12951 CARHSP1-205ENST00000562843 843 ntTSL 2 BASIC11.01□□□□□ -0.65
FOXI1Q12951 AC217774.2-201ENST00000580347 560 ntTSL 4 BASIC11.01□□□□□ -0.65
FOXI1Q12951 MPPED2-202ENST00000448418 5591 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
FOXI1Q12951 DUOXA1-216ENST00000613425 1867 ntTSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
FOXI1Q12951 NTN4-201ENST00000343702 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
FOXI1Q12951 PSEN2-203ENST00000422240 1947 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC11.01□□□□□ -0.65
FOXI1Q12951 CCDC130-204ENST00000586600 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
FOXI1Q12951 HYAL1-209ENST00000618175 2225 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
FOXI1Q12951 ENDOV-204ENST00000518137 2815 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.01□□□□□ -0.65
FOXI1Q12951 KCNT1-212ENST00000628528 7057 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.01□□□□□ -0.65
FOXI1Q12951 CUX1-214ENST00000550008 4350 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
FOXI1Q12951 MANBA-202ENST00000505239 2577 ntTSL 2 BASIC11.01□□□□□ -0.65
FOXI1Q12951 TRMT1-217ENST00000592062 2579 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
FOXI1Q12951 NOL4L-210ENST00000616976 1376 ntTSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
FOXI1Q12951 GTPBP8-208ENST00000619116 1378 ntTSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
FOXI1Q12951 CYP4F3-201ENST00000221307 5050 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
FOXI1Q12951 TMEM231-207ENST00000568377 2920 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
FOXI1Q12951 AFAP1L1-205ENST00000515000 2319 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
FOXI1Q12951 ADPRHL1-204ENST00000612156 9759 ntTSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
FOXI1Q12951 CLPTM1L-216ENST00000630539 2032 ntTSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
FOXI1Q12951 DCUN1D4-202ENST00000381441 4207 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
FOXI1Q12951 APH1A-203ENST00000369109 1713 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
FOXI1Q12951 SLC22A5-203ENST00000435065 1746 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
FOXI1Q12951 FAM49B-224ENST00000522941 1700 ntTSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
FOXI1Q12951 AC069224.1-201ENST00000566372 1715 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
FOXI1Q12951 POMT1-204ENST00000402686 3038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
FOXI1Q12951 KCNMA1-202ENST00000286628 6233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
FOXI1Q12951 ATG9A-205ENST00000409618 4025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
FOXI1Q12951 RAC2-201ENST00000249071 1482 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
FOXI1Q12951 ATP2B3-204ENST00000370186 6742 ntTSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
FOXI1Q12951 FAM13B-201ENST00000033079 5465 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
FOXI1Q12951 AC112504.1-201ENST00000623415 1841 ntBASIC11□□□□□ -0.65
FOXI1Q12951 C22orf34-201ENST00000343999 2816 ntTSL 2 BASIC11□□□□□ -0.65
FOXI1Q12951 CLCN7-203ENST00000448525 4151 ntTSL 2 BASIC11□□□□□ -0.65
FOXI1Q12951 ERN2-202ENST00000457008 3169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
FOXI1Q12951 CIAPIN1-201ENST00000394391 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
FOXI1Q12951 EBLN3P-202ENST00000625445 4520 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
FOXI1Q12951 CEP131-202ENST00000374782 3505 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
FOXI1Q12951 NR3C1-201ENST00000231509 3556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
FOXI1Q12951 NRROS-201ENST00000328557 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
FOXI1Q12951 SPOCK3-202ENST00000357545 2936 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
FOXI1Q12951 BMP4-201ENST00000245451 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
FOXI1Q12951 OTP-201ENST00000306422 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
FOXI1Q12951 INPP5J-204ENST00000402238 1564 ntTSL 2 BASIC11□□□□□ -0.65
FOXI1Q12951 LARP4-219ENST00000614335 1949 ntTSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
FOXI1Q12951 CCDC88A-201ENST00000263630 9667 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
FOXI1Q12951 C6orf120-201ENST00000332290 2667 ntAPPRIS P1 BASIC11□□□□□ -0.65
FOXI1Q12951 USP28-214ENST00000545540 3431 ntTSL 2 BASIC11□□□□□ -0.65
FOXI1Q12951 TOMM40-207ENST00000592434 3415 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11□□□□□ -0.65
FOXI1Q12951 DMAC2-210ENST00000592922 1622 ntTSL 2 BASIC11□□□□□ -0.65
FOXI1Q12951 SPRY2-201ENST00000377102 2708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
FOXI1Q12951 ICOSLG-201ENST00000344330 1009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
FOXI1Q12951 TMEM234-202ENST00000344461 721 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
FOXI1Q12951 PDLIM4-202ENST00000379018 1006 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
FOXI1Q12951 HCG4B-203ENST00000450128 991 ntBASIC11□□□□□ -0.65
FOXI1Q12951 ACP6-203ENST00000487562 1258 ntTSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
FOXI1Q12951 STK32A-AS1-201ENST00000504297 863 ntTSL 3 BASIC11□□□□□ -0.65
FOXI1Q12951 REEP2-206ENST00000506158 1021 ntTSL 2 BASIC11□□□□□ -0.65
FOXI1Q12951 MRNIP-205ENST00000518235 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11□□□□□ -0.65
FOXI1Q12951 IL32-212ENST00000526464 1198 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC11□□□□□ -0.65
FOXI1Q12951 IL32-217ENST00000530538 674 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC11□□□□□ -0.65
FOXI1Q12951 RPL28-209ENST00000560055 670 ntTSL 3 BASIC11□□□□□ -0.65
FOXI1Q12951 AC096734.2-201ENST00000562054 433 ntBASIC11□□□□□ -0.65
FOXI1Q12951 AP001005.1-201ENST00000571755 1248 ntBASIC11□□□□□ -0.65
FOXI1Q12951 LITAF-211ENST00000572255 516 ntTSL 4 BASIC11□□□□□ -0.65
FOXI1Q12951 LITAF-215ENST00000574763 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11□□□□□ -0.65
FOXI1Q12951 AC002398.2-201ENST00000587767 660 ntTSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
FOXI1Q12951 HEXIM2-207ENST00000592695 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
FOXI1Q12951 AC010507.1-201ENST00000633895 436 ntBASIC11□□□□□ -0.65
FOXI1Q12951 PCDH10-203ENST00000618019 4574 ntAPPRIS ALT2 BASIC11□□□□□ -0.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.2 ms