Protein–RNA interactions for Protein: Q12829

RAB40B, Ras-related protein Rab-40B, humanhuman

Predictions only

Length 278 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB40BQ12829 MAPT-204ENST00000344290 6816 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
RAB40BQ12829 MFSD2B-202ENST00000406420 1528 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
RAB40BQ12829 PLIN3-202ENST00000585479 1535 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
RAB40BQ12829 LPAR5-201ENST00000329858 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
RAB40BQ12829 MIRLET7BHG-203ENST00000435439 2264 ntTSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
RAB40BQ12829 NELFA-202ENST00000382882 3343 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
RAB40BQ12829 YME1L1-202ENST00000375972 2517 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
RAB40BQ12829 GGT1-202ENST00000400380 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
RAB40BQ12829 STMN1-203ENST00000399728 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
RAB40BQ12829 C15orf52-206ENST00000559313 3022 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
RAB40BQ12829 KCP-203ENST00000610776 5108 ntTSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
RAB40BQ12829 TAF5-201ENST00000369839 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
RAB40BQ12829 CEP170B-204ENST00000556508 6683 ntTSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
RAB40BQ12829 TCOF1-201ENST00000323668 4832 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
RAB40BQ12829 ESRP2-202ENST00000473183 3793 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
RAB40BQ12829 DSE-202ENST00000359564 4037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
RAB40BQ12829 TKT-201ENST00000296289 1931 ntTSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
RAB40BQ12829 JARID2-201ENST00000341776 5755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
RAB40BQ12829 WFIKKN2-202ENST00000426127 2193 ntTSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
RAB40BQ12829 TFE3-201ENST00000315869 3415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
RAB40BQ12829 FUCA2-201ENST00000002165 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
RAB40BQ12829 MUTYH-206ENST00000372115 1888 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
RAB40BQ12829 EIF5A-206ENST00000571955 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
RAB40BQ12829 OR2V1-205ENST00000642036 2609 ntAPPRIS P1 BASIC13.97□□□□□ -0.17
RAB40BQ12829 NIPA1-201ENST00000337435 6567 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
RAB40BQ12829 FAM122A-201ENST00000394264 4575 ntAPPRIS P1 BASIC13.97□□□□□ -0.17
RAB40BQ12829 CASC2-203ENST00000435944 3270 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
RAB40BQ12829 MAN1B1-202ENST00000371589 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
RAB40BQ12829 AKAP8P1-201ENST00000434743 1349 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
RAB40BQ12829 ITSN1-210ENST00000399353 3913 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
RAB40BQ12829 STAT1-203ENST00000392323 2723 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.97□□□□□ -0.17
RAB40BQ12829 AC005840.4-201ENST00000541242 2494 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
RAB40BQ12829 ZNF831-201ENST00000371030 9401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
RAB40BQ12829 AC142381.1-201ENST00000426099 345 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
RAB40BQ12829 EMBP1-201ENST00000458200 901 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
RAB40BQ12829 SLC50A1-209ENST00000484157 886 ntTSL 3 BASIC13.97□□□□□ -0.17
RAB40BQ12829 UNC93B7-201ENST00000509439 705 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
RAB40BQ12829 AC079776.4-201ENST00000511039 504 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
RAB40BQ12829 RNA5SP415-201ENST00000517246 115 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
RAB40BQ12829 AC112191.1-201ENST00000523689 701 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
RAB40BQ12829 AHSA1-202ENST00000535854 1173 ntTSL 2 BASIC13.97□□□□□ -0.17
RAB40BQ12829 TMEM5-AS1-201ENST00000546214 563 ntTSL 4 BASIC13.97□□□□□ -0.17
RAB40BQ12829 AL512357.1-201ENST00000557687 518 ntTSL 4 BASIC13.97□□□□□ -0.17
RAB40BQ12829 MAP1LC3B-207ENST00000565788 625 ntTSL 2 BASIC13.97□□□□□ -0.17
RAB40BQ12829 PRSS8-206ENST00000568261 1214 ntTSL 2 BASIC13.97□□□□□ -0.17
RAB40BQ12829 RPL19-204ENST00000579260 1051 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.97□□□□□ -0.17
RAB40BQ12829 OR5AH1P-202ENST00000597822 431 ntTSL 3 BASIC13.97□□□□□ -0.17
RAB40BQ12829 SLC9A3-AS1-205ENST00000606319 477 ntTSL 3 BASIC13.97□□□□□ -0.17
RAB40BQ12829 TSPY4-205ENST00000640033 663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
RAB40BQ12829 UBTF-201ENST00000302904 4997 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.97□□□□□ -0.17
RAB40BQ12829 LGALS8-203ENST00000341872 2437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
RAB40BQ12829 CENPT-235ENST00000626059 1737 ntTSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
RAB40BQ12829 CCNB1-201ENST00000256442 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
RAB40BQ12829 UNQ6494-202ENST00000617436 2163 ntTSL 2 BASIC13.97□□□□□ -0.17
RAB40BQ12829 SOGA3-201ENST00000465909 3756 ntTSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
RAB40BQ12829 KLHDC7A-201ENST00000400664 5145 ntAPPRIS P1 BASIC13.97□□□□□ -0.17
RAB40BQ12829 IL9R-201ENST00000244174 1944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
RAB40BQ12829 TMCO3-207ENST00000474393 2843 ntTSL 2 BASIC13.97□□□□□ -0.17
RAB40BQ12829 CUX1-214ENST00000550008 4350 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
RAB40BQ12829 ANKLE1-201ENST00000394458 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
RAB40BQ12829 USP47-207ENST00000527733 4525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
RAB40BQ12829 ZBTB7C-213ENST00000588982 4949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
RAB40BQ12829 SRSF8-201ENST00000587424 4028 ntAPPRIS P1 BASIC13.97□□□□□ -0.17
RAB40BQ12829 TUBB4B-201ENST00000340384 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
RAB40BQ12829 PCDHA7-201ENST00000356878 2922 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.97□□□□□ -0.17
RAB40BQ12829 SV2A-201ENST00000369145 2903 ntTSL 2 BASIC13.97□□□□□ -0.17
RAB40BQ12829 MRGPRX3-201ENST00000396275 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
RAB40BQ12829 TRIM62-204ENST00000543586 1638 ntTSL 2 BASIC13.97□□□□□ -0.17
RAB40BQ12829 TPO-201ENST00000329066 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
RAB40BQ12829 CTSA-202ENST00000354880 1820 ntTSL 2 BASIC13.97□□□□□ -0.17
RAB40BQ12829 NAALADL1-204ENST00000358658 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
RAB40BQ12829 ZNF70-201ENST00000341976 6924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
RAB40BQ12829 KCNT1-208ENST00000488444 3696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
RAB40BQ12829 SEPT9-228ENST00000590294 2816 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
RAB40BQ12829 ANOS1-201ENST00000262648 6314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
RAB40BQ12829 CYP4X1-201ENST00000371901 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
RAB40BQ12829 ASTN2-206ENST00000361477 4001 ntTSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
RAB40BQ12829 FBLIM1-201ENST00000332305 1530 ntTSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
RAB40BQ12829 UBE2G1-204ENST00000572484 1514 ntTSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
RAB40BQ12829 DDX19B-203ENST00000393657 1717 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
RAB40BQ12829 SMARCA4-214ENST00000589677 5181 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
RAB40BQ12829 BEND3P1-201ENST00000421591 1944 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
RAB40BQ12829 AC113367.3-201ENST00000508316 1912 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
RAB40BQ12829 MLF1-216ENST00000618075 2116 ntTSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
RAB40BQ12829 LTBP3-221ENST00000532932 3327 ntTSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
RAB40BQ12829 CGN-201ENST00000271636 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
RAB40BQ12829 PUS1-202ENST00000376649 4094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
RAB40BQ12829 C19orf57-201ENST00000346736 2489 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
RAB40BQ12829 TPM3-208ENST00000341485 2063 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
RAB40BQ12829 BPIFB2-201ENST00000170150 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
RAB40BQ12829 NUP50-201ENST00000347635 5233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
RAB40BQ12829 CYB5R1-201ENST00000367249 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
RAB40BQ12829 MUTYH-211ENST00000456914 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
RAB40BQ12829 TAGLN3-202ENST00000393917 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
RAB40BQ12829 GHSR-201ENST00000241256 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
RAB40BQ12829 INS-201ENST00000250971 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
RAB40BQ12829 THAP3-202ENST00000307896 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
RAB40BQ12829 CHCHD1-201ENST00000372833 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
RAB40BQ12829 DRAP1-202ENST00000376991 819 ntTSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
RAB40BQ12829 GUK1-210ENST00000391865 990 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.3 ms