Protein–RNA interactions for Protein: P57723

PCBP4, Poly(rC)-binding protein 4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 403 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCBP4P57723 COX6B1-204ENST00000592141 660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
PCBP4P57723 BRI3BPP1-201ENST00000594224 787 ntBASIC15.06■□□□□ 0
PCBP4P57723 LINC01115-203ENST00000606068 577 ntBASIC15.06■□□□□ 0
PCBP4P57723 LINC02351-201ENST00000614728 289 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
PCBP4P57723 C9orf50-202ENST00000619117 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PCBP4P57723 ANKRD24-202ENST00000318934 3906 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
PCBP4P57723 ARHGAP26-202ENST00000378004 9200 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PCBP4P57723 LRRC3-201ENST00000291592 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PCBP4P57723 SSR4P1-203ENST00000599569 2260 ntBASIC15.06■□□□□ 0
PCBP4P57723 NRXN1-229ENST00000628515 3243 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
PCBP4P57723 MMP15-201ENST00000219271 4250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PCBP4P57723 ABHD11-201ENST00000222800 1483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PCBP4P57723 HYAL1-201ENST00000266031 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PCBP4P57723 GCK-203ENST00000395796 2539 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PCBP4P57723 BTBD11-205ENST00000490090 4614 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
PCBP4P57723 UBE2D1-204ENST00000615793 2621 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
PCBP4P57723 SUFU-202ENST00000369902 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PCBP4P57723 CHRDL1-204ENST00000444321 1658 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PCBP4P57723 OXCT1-AS1-201ENST00000508458 1731 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
PCBP4P57723 DHX36-202ENST00000329463 2985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PCBP4P57723 MFSD4A-207ENST00000536357 1841 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
PCBP4P57723 SP2-201ENST00000376741 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PCBP4P57723 HMGA1-204ENST00000401473 1887 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PCBP4P57723 AGTPBP1-201ENST00000337006 4473 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
PCBP4P57723 NFIA-205ENST00000371189 1989 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
PCBP4P57723 MYB-209ENST00000442647 3304 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
PCBP4P57723 NDRG2-209ENST00000397853 2079 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
PCBP4P57723 LCK-206ENST00000373564 2137 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
PCBP4P57723 AC007182.1-201ENST00000455232 2159 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
PCBP4P57723 MGAT1-201ENST00000307826 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
PCBP4P57723 ARHGEF1-204ENST00000378152 2986 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
PCBP4P57723 INTS4P1-202ENST00000587624 2985 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
PCBP4P57723 TREML1-201ENST00000373127 1194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
PCBP4P57723 RPL13A-201ENST00000391857 1181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
PCBP4P57723 PPP1R14B-202ENST00000392210 600 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
PCBP4P57723 TMEM210-201ENST00000413619 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
PCBP4P57723 ZNF564-202ENST00000416136 255 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
PCBP4P57723 AC134915.1-201ENST00000426461 574 ntBASIC15.05■□□□□ -0
PCBP4P57723 KLK4-202ENST00000431178 481 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
PCBP4P57723 SNHG11-212ENST00000449351 954 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
PCBP4P57723 DMKN-216ENST00000458071 510 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
PCBP4P57723 ZNF527-203ENST00000483919 1142 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
PCBP4P57723 RIT1-205ENST00000539040 919 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
PCBP4P57723 LINC02205-201ENST00000559752 239 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
PCBP4P57723 OIP5-AS1-209ENST00000561226 775 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
PCBP4P57723 DYNLRB2-205ENST00000568035 409 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
PCBP4P57723 AC009486.1-201ENST00000569860 813 ntBASIC15.05■□□□□ -0
PCBP4P57723 AP001005.4-201ENST00000572530 387 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
PCBP4P57723 CD300LG-205ENST00000586233 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
PCBP4P57723 FBXL12-211ENST00000591009 1005 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
PCBP4P57723 AC097634.3-201ENST00000613067 820 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
PCBP4P57723 HSF5-201ENST00000323777 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
PCBP4P57723 CIART-203ENST00000369095 1433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
PCBP4P57723 SMYD3-214ENST00000490107 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
PCBP4P57723 PAX6-276ENST00000640684 1557 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
PCBP4P57723 LINC00221-201ENST00000603633 1656 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
PCBP4P57723 NEK11-210ENST00000510769 2149 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
PCBP4P57723 AP000704.1-201ENST00000637940 2182 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
PCBP4P57723 SLC6A2-204ENST00000561820 2268 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
PCBP4P57723 DEPDC5-203ENST00000400242 2395 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
PCBP4P57723 ORAOV1-201ENST00000279147 2478 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
PCBP4P57723 AC022613.1-201ENST00000536835 2530 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
PCBP4P57723 STK39-201ENST00000355999 3820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
PCBP4P57723 UNC13A-205ENST00000551649 6052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
PCBP4P57723 TOMM40-207ENST00000592434 3415 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
PCBP4P57723 SURF4-202ENST00000371989 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PCBP4P57723 PHTF1-201ENST00000357783 2747 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PCBP4P57723 PIEZO1-201ENST00000301015 8072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PCBP4P57723 RBCK1-201ENST00000353660 2511 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PCBP4P57723 CHD1L-203ENST00000369259 2358 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PCBP4P57723 PPT1-215ENST00000641471 2368 ntBASIC15.04■□□□□ -0
PCBP4P57723 PAX3-206ENST00000392070 2258 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PCBP4P57723 SLC3A2-204ENST00000377891 2222 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
PCBP4P57723 AC013268.4-201ENST00000637413 2228 ntBASIC15.04■□□□□ -0
PCBP4P57723 AC105250.1-201ENST00000509378 2057 ntBASIC15.04■□□□□ -0
PCBP4P57723 AP1M2-207ENST00000590923 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PCBP4P57723 GLIDR-204ENST00000638724 1765 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
PCBP4P57723 KRT8-215ENST00000552150 1687 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PCBP4P57723 TP73-213ENST00000604479 1623 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
PCBP4P57723 AMT-232ENST00000636199 1546 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
PCBP4P57723 FAH-201ENST00000261755 1471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
PCBP4P57723 KRT8P37-201ENST00000451609 1420 ntBASIC15.04■□□□□ -0
PCBP4P57723 PSMD8-209ENST00000602911 1330 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PCBP4P57723 B9D2-201ENST00000243578 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PCBP4P57723 LAMA4-203ENST00000368638 1061 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
PCBP4P57723 ELK2AP-201ENST00000392510 1007 ntBASIC15.04■□□□□ -0
PCBP4P57723 CXorf40A-211ENST00000450602 1204 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
PCBP4P57723 AC025183.2-201ENST00000503386 428 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
PCBP4P57723 AC090099.4-201ENST00000527671 1027 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
PCBP4P57723 IFI27L1-210ENST00000556381 804 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
PCBP4P57723 RPL36-203ENST00000577222 874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
PCBP4P57723 TUBB6-213ENST00000591909 1017 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PCBP4P57723 LINC01663-201ENST00000614596 535 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
PCBP4P57723 PPA1-206ENST00000625364 644 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
PCBP4P57723 AC099795.1-202ENST00000640492 759 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
PCBP4P57723 TSC2-201ENST00000219476 6156 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
PCBP4P57723 PEX6-202ENST00000304611 3478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PCBP4P57723 TMEM57-202ENST00000399766 3294 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PCBP4P57723 HAUS3-204ENST00000506763 3166 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
PCBP4P57723 COL4A3BP-204ENST00000405807 2843 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.5 ms