Protein–RNA interactions for Protein: P43026

GDF5, Growth/differentiation factor 5, humanhuman

Predictions only

Length 501 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GDF5P43026 TNR-201ENST00000263525 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
GDF5P43026 RGPD5-202ENST00000272454 2907 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
GDF5P43026 RCOR3-203ENST00000419091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
GDF5P43026 ZNF7-218ENST00000544249 2125 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
GDF5P43026 PPOX-201ENST00000352210 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
GDF5P43026 IQCF3-205ENST00000456080 1685 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
GDF5P43026 FKBP5-201ENST00000357266 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
GDF5P43026 FURIN-207ENST00000618099 4345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
GDF5P43026 PRMT2-202ENST00000334494 1334 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
GDF5P43026 AL583722.1-201ENST00000540171 1307 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
GDF5P43026 OTUD3-201ENST00000375120 6397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
GDF5P43026 KAT5-202ENST00000352980 2059 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
GDF5P43026 TUBA3E-201ENST00000312988 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
GDF5P43026 LSM6-201ENST00000296581 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
GDF5P43026 BDKRB2-201ENST00000539359 1600 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
GDF5P43026 KCP-208ENST00000620378 4515 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
GDF5P43026 SPHK2-202ENST00000340932 2492 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
GDF5P43026 PMP22-209ENST00000612492 1822 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
GDF5P43026 PTPRH-201ENST00000263434 3343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
GDF5P43026 GTF2IRD1-203ENST00000455841 3315 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
GDF5P43026 AC005885.1-204ENST00000637885 2885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
GDF5P43026 MOSPD3-201ENST00000223054 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
GDF5P43026 CCL25-201ENST00000253451 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
GDF5P43026 USE1-201ENST00000263897 843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
GDF5P43026 JTB-201ENST00000271843 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
GDF5P43026 DUPD1-201ENST00000338487 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
GDF5P43026 NKAIN2-201ENST00000368416 1106 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
GDF5P43026 AC093702.1-201ENST00000423433 367 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
GDF5P43026 LINC01160-201ENST00000441004 768 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
GDF5P43026 LYPLAL1-AS1-201ENST00000441331 724 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
GDF5P43026 PAX5-207ENST00000446742 885 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
GDF5P43026 RPS27L-204ENST00000455271 923 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
GDF5P43026 TMEM101-204ENST00000587529 965 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
GDF5P43026 AC005746.1-201ENST00000589244 672 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
GDF5P43026 AC243773.2-203ENST00000612281 640 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
GDF5P43026 PCSK6-221ENST00000632686 1210 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
GDF5P43026 AC007326.5-201ENST00000640084 1382 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
GDF5P43026 TPBG-202ENST00000535040 3392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
GDF5P43026 DLGAP1-214ENST00000539435 2402 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
GDF5P43026 IRF2BP2-202ENST00000366610 4615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
GDF5P43026 CAPZB-204ENST00000375144 1568 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
GDF5P43026 CBS-204ENST00000398165 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
GDF5P43026 GPM6A-210ENST00000506894 2614 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
GDF5P43026 DDX1-201ENST00000233084 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
GDF5P43026 RRBP1-204ENST00000377813 5041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
GDF5P43026 SLC2A4-204ENST00000571308 1768 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
GDF5P43026 NEBL-203ENST00000417816 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
GDF5P43026 WDTC1-202ENST00000361771 4275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
GDF5P43026 ERRFI1-201ENST00000377482 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
GDF5P43026 FAM153B-220ENST00000515817 1966 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
GDF5P43026 AGAP7P-201ENST00000582299 2062 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
GDF5P43026 PI16-203ENST00000611814 2083 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
GDF5P43026 AGAP14-201ENST00000624701 2060 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
GDF5P43026 TJAP1-207ENST00000436109 2572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
GDF5P43026 PLEKHA8-205ENST00000449726 7835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
GDF5P43026 TMEM127-201ENST00000258439 6266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
GDF5P43026 ATG4B-205ENST00000404914 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
GDF5P43026 PAM-206ENST00000438793 5432 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
GDF5P43026 FKBP6-202ENST00000413573 1507 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
GDF5P43026 SLC22A6-204ENST00000458333 1521 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
GDF5P43026 AC003986.2-201ENST00000419944 1711 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
GDF5P43026 PAQR6-204ENST00000356983 2143 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
GDF5P43026 POR-201ENST00000394893 2532 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
GDF5P43026 RBFOX3-211ENST00000583458 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
GDF5P43026 SLC24A3-201ENST00000328041 3929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
GDF5P43026 SPOCK2-202ENST00000373109 5445 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
GDF5P43026 PARP10-201ENST00000313028 3497 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
GDF5P43026 ZFP41-203ENST00000520584 3284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
GDF5P43026 RAF1-205ENST00000442415 3085 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
GDF5P43026 MFF-204ENST00000353339 2186 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
GDF5P43026 HMGA1-202ENST00000347617 1773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
GDF5P43026 NT5C3A-204ENST00000405342 1759 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
GDF5P43026 CCDC68-204ENST00000591504 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
GDF5P43026 HSD17B10-203ENST00000375304 916 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
GDF5P43026 AL365255.1-202ENST00000413887 363 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
GDF5P43026 AC091729.2-201ENST00000415656 302 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
GDF5P43026 AC015922.1-201ENST00000421102 1152 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
GDF5P43026 MIPEPP3-202ENST00000424756 347 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
GDF5P43026 AL034550.1-201ENST00000442179 986 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
GDF5P43026 AC007364.1-201ENST00000449714 1022 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
GDF5P43026 NECTIN3-AS1-204ENST00000476301 568 ntTSL 4 BASIC15.17■□□□□ 0.02
GDF5P43026 AC020659.2-201ENST00000510176 585 ntTSL 4 BASIC15.17■□□□□ 0.02
GDF5P43026 SDHAP3-202ENST00000515467 728 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
GDF5P43026 TRAF3IP2-AS1-208ENST00000525151 609 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
GDF5P43026 MTFR1L-218ENST00000526894 733 ntTSL 4 BASIC15.17■□□□□ 0.02
GDF5P43026 MAPKAPK5-203ENST00000547305 494 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
GDF5P43026 AL161757.4-201ENST00000554149 621 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
GDF5P43026 AC074044.1-201ENST00000609673 707 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
GDF5P43026 AC106028.4-201ENST00000614509 607 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
GDF5P43026 RAB34-223ENST00000636154 730 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
GDF5P43026 MX1-210ENST00000455164 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
GDF5P43026 FUS-201ENST00000254108 5119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
GDF5P43026 NAALADL1-203ENST00000356632 2118 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
GDF5P43026 TVP23C-203ENST00000428082 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
GDF5P43026 ZNF821-203ENST00000446827 1822 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
GDF5P43026 TMC6-216ENST00000590602 5268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
GDF5P43026 TMEM169-204ENST00000437356 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
GDF5P43026 RAD51C-215ENST00000583539 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
GDF5P43026 PAK4-205ENST00000593690 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
GDF5P43026 ZNF687-201ENST00000324048 5378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.9 ms