Protein–RNA interactions for Protein: P18433

PTPRA, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase alpha, humanhuman

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Length 802 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRAP18433 CLEC18A-203ENST00000449317 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
PTPRAP18433 TMEM119-201ENST00000392806 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
PTPRAP18433 YTHDF3-215ENST00000621957 2387 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
PTPRAP18433 RPA3-201ENST00000223129 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
PTPRAP18433 CCDC140-201ENST00000295226 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
PTPRAP18433 MAMSTR-201ENST00000318083 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
PTPRAP18433 VPS54-201ENST00000272322 3463 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
PTPRAP18433 PTPRU-202ENST00000373779 5579 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
PTPRAP18433 DMRTC2-201ENST00000269945 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
PTPRAP18433 MAP3K20-203ENST00000409176 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
PTPRAP18433 DIMT1-201ENST00000199320 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
PTPRAP18433 SRP14-201ENST00000267884 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
PTPRAP18433 WDR54-201ENST00000348227 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
PTPRAP18433 NREP-204ENST00000419114 704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
PTPRAP18433 TCEAL4-208ENST00000472484 1273 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
PTPRAP18433 PCOLCE2-208ENST00000485766 1088 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
PTPRAP18433 MESTP3-201ENST00000503460 968 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
PTPRAP18433 AC097103.2-206ENST00000514729 588 ntTSL 4 BASIC17.77■□□□□ 0.44
PTPRAP18433 AC067930.5-201ENST00000531730 1173 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
PTPRAP18433 AC126696.1-201ENST00000561567 756 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
PTPRAP18433 AC025259.3-202ENST00000564363 687 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
PTPRAP18433 ZNF74-202ENST00000400451 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
PTPRAP18433 VPS26A-201ENST00000263559 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
PTPRAP18433 PCDHA13-202ENST00000409494 4884 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
PTPRAP18433 ZYG11A-202ENST00000371532 3942 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
PTPRAP18433 MAGEA4-205ENST00000393920 1721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
PTPRAP18433 MCF2L-208ENST00000397030 6580 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
PTPRAP18433 AL139099.2-201ENST00000555043 2469 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.43
PTPRAP18433 ARID5A-203ENST00000454558 3079 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
PTPRAP18433 PLCG1-202ENST00000373271 7395 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
PTPRAP18433 REPS2-201ENST00000303843 7771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
PTPRAP18433 UBR3-203ENST00000418381 7951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
PTPRAP18433 GPSM3-207ENST00000375043 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
PTPRAP18433 AC107871.1-202ENST00000562767 3389 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
PTPRAP18433 TIPRL-202ENST00000367833 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
PTPRAP18433 NPRL3-211ENST00000611875 2881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
PTPRAP18433 PDXK-202ENST00000327574 2583 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
PTPRAP18433 METTL6-201ENST00000383789 1413 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
PTPRAP18433 CHAT-212ENST00000640822 1412 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
PTPRAP18433 AC024909.3-201ENST00000611513 2257 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
PTPRAP18433 DKFZp779M0652-201ENST00000378779 649 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
PTPRAP18433 AC104457.1-201ENST00000401024 814 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
PTPRAP18433 BX324167.1-201ENST00000451118 805 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
PTPRAP18433 AC113192.2-201ENST00000525320 308 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
PTPRAP18433 RCE1-204ENST00000525356 1270 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
PTPRAP18433 TMBIM4-205ENST00000535812 766 ntTSL 4 BASIC17.76■□□□□ 0.43
PTPRAP18433 AP003419.2-201ENST00000543494 711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
PTPRAP18433 MAX-211ENST00000555667 574 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
PTPRAP18433 TMBIM4-212ENST00000556010 610 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
PTPRAP18433 RN7SL774P-201ENST00000577467 290 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
PTPRAP18433 SLC1A6-208ENST00000598504 2987 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
PTPRAP18433 ELOA3C-201ENST00000620688 1218 ntAPPRIS P1 BASIC17.76■□□□□ 0.43
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PTPRAP18433 DRG2-201ENST00000225729 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
PTPRAP18433 GINS2-201ENST00000253462 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
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PTPRAP18433 FGFR2-215ENST00000457416 3061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
PTPRAP18433 GEMIN7-201ENST00000270257 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
PTPRAP18433 SLC3A2-204ENST00000377891 2222 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
PTPRAP18433 AC092127.1-201ENST00000567093 3455 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
PTPRAP18433 LINC01168-201ENST00000461291 5254 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
PTPRAP18433 SCRIB-203ENST00000377533 5108 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
PTPRAP18433 SLC27A1-201ENST00000252595 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
PTPRAP18433 KRT32-201ENST00000225899 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
PTPRAP18433 SEC23A-203ENST00000545328 2734 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
PTPRAP18433 SLC35C2-202ENST00000317734 2175 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
PTPRAP18433 IFT140-203ENST00000426508 5270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
PTPRAP18433 CISH-201ENST00000348721 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
PTPRAP18433 PCSK4-201ENST00000300954 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
PTPRAP18433 ADCY9-201ENST00000294016 7725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
PTPRAP18433 CHIA-206ENST00000430615 1320 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
PTPRAP18433 FAM120AOS-201ENST00000375412 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
PTPRAP18433 PTPN12-201ENST00000248594 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
PTPRAP18433 SULT1A2-204ENST00000533150 1991 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
PTPRAP18433 RARA-206ENST00000425707 3041 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
PTPRAP18433 SIRT1-201ENST00000212015 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
PTPRAP18433 TCEAL4-209ENST00000472745 1571 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
PTPRAP18433 ASAP3-212ENST00000618240 2226 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
PTPRAP18433 REXO1L5P-201ENST00000622260 2098 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
PTPRAP18433 ADGRA1-202ENST00000392607 4283 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
PTPRAP18433 OAS1-202ENST00000445409 1684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
PTPRAP18433 CISH-202ENST00000443053 2167 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
PTPRAP18433 ILF3-203ENST00000449870 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
PTPRAP18433 DPM3-202ENST00000368399 517 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
PTPRAP18433 RAB1A-201ENST00000398529 1198 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
PTPRAP18433 PENK-202ENST00000451791 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
PTPRAP18433 AC245884.6-201ENST00000515672 1067 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
PTPRAP18433 AC022217.1-201ENST00000521069 738 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
PTPRAP18433 SPAG5-AS1-203ENST00000554154 491 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
PTPRAP18433 C15orf40-211ENST00000565712 559 ntTSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
PTPRAP18433 RUNX1-207ENST00000437180 5967 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
PTPRAP18433 RBFOX2-201ENST00000262829 1538 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
PTPRAP18433 CCDC40-202ENST00000374876 2010 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
PTPRAP18433 AR-209ENST00000613054 3532 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
PTPRAP18433 KRT8P29-201ENST00000420409 1371 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
PTPRAP18433 PKD1P1-201ENST00000458669 6805 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
PTPRAP18433 RUBCNL-203ENST00000378787 2731 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
PTPRAP18433 H2AFV-201ENST00000222690 3804 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
PTPRAP18433 PCGF3-201ENST00000362003 5685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
PTPRAP18433 SELENOV-201ENST00000335426 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
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