Protein–RNA interactions for Protein: O14967

CLGN, Calmegin, humanhuman

Predictions only

Length 610 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLGNO14967 HSP90B1-210ENST00000614327 1338 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CLGNO14967 ENOSF1-202ENST00000340116 1658 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CLGNO14967 PHF23-202ENST00000454255 1662 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CLGNO14967 PLEKHO2-202ENST00000616065 3569 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CLGNO14967 C9orf47-201ENST00000334490 4829 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CLGNO14967 CAMSAP1-203ENST00000409386 5730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CLGNO14967 SP100-205ENST00000409824 1802 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CLGNO14967 NAA60-203ENST00000414063 2619 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CLGNO14967 CCT2-202ENST00000543146 2189 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CLGNO14967 PTBP1-221ENST00000635647 3691 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CLGNO14967 AC018442.1-201ENST00000421439 2061 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
CLGNO14967 PCDHB13-201ENST00000341948 5061 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CLGNO14967 SMAP1-201ENST00000316999 2403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CLGNO14967 C22orf39-201ENST00000333059 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CLGNO14967 TBC1D7-202ENST00000356436 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CLGNO14967 CTRC-202ENST00000375949 898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CLGNO14967 TBC1D7-204ENST00000379300 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CLGNO14967 HNRNPA1P28-201ENST00000424481 961 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
CLGNO14967 SLC22A18-206ENST00000449793 1225 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CLGNO14967 CMPK1-205ENST00000471289 816 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CLGNO14967 GSTK1-207ENST00000479303 1185 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CLGNO14967 CFL1-202ENST00000524553 860 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CLGNO14967 PDPK2P-202ENST00000562415 1191 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
CLGNO14967 NME4-212ENST00000621774 904 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CLGNO14967 DDOST-206ENST00000602624 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CLGNO14967 AFDN-203ENST00000366806 5962 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CLGNO14967 SEZ6L-209ENST00000529632 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CLGNO14967 PSMA8-202ENST00000343848 1675 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CLGNO14967 SLC6A2-204ENST00000561820 2268 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CLGNO14967 NCKAP5L-201ENST00000335999 4900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CLGNO14967 DDN-201ENST00000421952 3749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CLGNO14967 COL4A1-204ENST00000543140 2547 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CLGNO14967 BEND3P1-201ENST00000421591 1944 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
CLGNO14967 CCDC130-204ENST00000586600 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CLGNO14967 CLN3-216ENST00000565316 1318 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CLGNO14967 NR4A2-210ENST00000429376 1571 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CLGNO14967 CFAP74-209ENST00000493964 5247 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CLGNO14967 SEMA4C-201ENST00000305476 3545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CLGNO14967 ZNF219-202ENST00000421093 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CLGNO14967 TBR1-201ENST00000389554 4009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CLGNO14967 GAK-201ENST00000314167 4442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CLGNO14967 IL3RA-202ENST00000381469 1476 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CLGNO14967 LINC02167-203ENST00000566900 1489 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CLGNO14967 FBXW9-201ENST00000393261 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CLGNO14967 SH2D6-202ENST00000389938 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CLGNO14967 USP49-203ENST00000394253 9034 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CLGNO14967 SYT9-201ENST00000318881 3955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CLGNO14967 AXL-201ENST00000301178 4737 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CLGNO14967 AC098591.1-201ENST00000381811 1613 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CLGNO14967 SPATA7-203ENST00000393545 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CLGNO14967 CMKLR1-204ENST00000550402 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CLGNO14967 U82695.1-201ENST00000635752 1889 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
CLGNO14967 PCM1-202ENST00000327578 8287 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CLGNO14967 MAPT-213ENST00000571987 2277 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CLGNO14967 PHF8-202ENST00000338154 6062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CLGNO14967 NQO2-201ENST00000338130 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CLGNO14967 KIF25-202ENST00000354419 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CLGNO14967 RHOXF1P3-203ENST00000640298 2668 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CLGNO14967 RPP38-203ENST00000378202 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CLGNO14967 AC002056.1-201ENST00000395613 760 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
CLGNO14967 DANCR-201ENST00000411630 904 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CLGNO14967 AC139887.2-202ENST00000507446 534 ntTSL 4 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CLGNO14967 AC025162.1-201ENST00000554022 565 ntTSL 4 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CLGNO14967 AL078644.1-201ENST00000609881 752 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
CLGNO14967 UBE3D-208ENST00000626828 114 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CLGNO14967 SAFB-205ENST00000588852 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CLGNO14967 ATXN2L-202ENST00000336783 4367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CLGNO14967 HYAL3-207ENST00000621157 1696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CLGNO14967 PRR30-202ENST00000432962 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CLGNO14967 ANAPC13-206ENST00000514612 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CLGNO14967 TUBB8-201ENST00000561967 1413 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CLGNO14967 ABCA2-201ENST00000265662 8154 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CLGNO14967 SPATA6-204ENST00000396199 4964 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CLGNO14967 SYN1-201ENST00000295987 3299 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CLGNO14967 ABCG1-201ENST00000343687 3037 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CLGNO14967 ARHGAP5-205ENST00000433497 3047 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CLGNO14967 TMEM189-203ENST00000371656 1973 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CLGNO14967 PCDHGB7-202ENST00000612073 2785 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CLGNO14967 TSPAN4-208ENST00000409531 1339 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CLGNO14967 CYP27B1-201ENST00000228606 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CLGNO14967 WDR20-205ENST00000424963 2695 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CLGNO14967 TRPV4-201ENST00000261740 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CLGNO14967 AC112229.3-201ENST00000603767 3202 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CLGNO14967 AC013271.1-201ENST00000640669 3202 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CLGNO14967 CICP16-201ENST00000502609 2813 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
CLGNO14967 MAGED2-207ENST00000396224 2026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CLGNO14967 EIF2B4-206ENST00000451130 1633 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CLGNO14967 KIF18B-203ENST00000590129 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CLGNO14967 RPS6KA4-202ENST00000528057 3121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CLGNO14967 HNRNPU-226ENST00000640218 6858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CLGNO14967 BRPF3-201ENST00000339717 4820 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CLGNO14967 LINC00116-201ENST00000414416 2051 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CLGNO14967 TTLL3-213ENST00000430793 2097 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CLGNO14967 CHAF1A-201ENST00000301280 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CLGNO14967 BX324167.2-201ENST00000623717 3316 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
CLGNO14967 PPFIA4-202ENST00000295706 6395 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CLGNO14967 AJ239322.1-201ENST00000419362 2209 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CLGNO14967 RSPH9-201ENST00000372163 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CLGNO14967 FGFBP2-201ENST00000259989 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CLGNO14967 NCKIPSD-201ENST00000294129 2989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.2 ms