Protein–RNA interactions for Protein: B4DJY2

TMEM233, Transmembrane protein 233, humanhuman

Predictions only

Length 109 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM233B4DJY2 CTSA-202ENST00000354880 1820 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
TMEM233B4DJY2 FOXRED1-213ENST00000532125 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
TMEM233B4DJY2 IDH2-201ENST00000330062 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TMEM233B4DJY2 PATZ1-203ENST00000351933 3638 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TMEM233B4DJY2 PDE1B-207ENST00000550620 2150 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TMEM233B4DJY2 TRMT1-203ENST00000437766 2263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TMEM233B4DJY2 FUCA2-201ENST00000002165 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TMEM233B4DJY2 RPS6KL1-210ENST00000555647 3309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TMEM233B4DJY2 CLCN1-201ENST00000343257 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TMEM233B4DJY2 SIGLEC8-203ENST00000430817 1528 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TMEM233B4DJY2 LIMS1-202ENST00000338045 1876 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TMEM233B4DJY2 HMGA1-204ENST00000401473 1887 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TMEM233B4DJY2 CACTIN-203ENST00000429344 3612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TMEM233B4DJY2 ARHGEF7-204ENST00000375736 5032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TMEM233B4DJY2 MAP3K4-202ENST00000366919 5397 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TMEM233B4DJY2 PAX8-AS1-204ENST00000436293 2687 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TMEM233B4DJY2 LINC01107-201ENST00000446979 1975 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TMEM233B4DJY2 P2RX5-TAX1BP3-201ENST00000550383 5905 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TMEM233B4DJY2 CGREF1-201ENST00000260595 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TMEM233B4DJY2 TEX30-205ENST00000376029 959 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TMEM233B4DJY2 EVA1A-203ENST00000410010 696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TMEM233B4DJY2 SNHG11-207ENST00000434729 1058 ntTSL 4 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TMEM233B4DJY2 AL034550.1-201ENST00000442179 986 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TMEM233B4DJY2 LINC02055-207ENST00000524346 706 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TMEM233B4DJY2 SUOX-214ENST00000551841 906 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TMEM233B4DJY2 AP3S2-204ENST00000558011 738 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TMEM233B4DJY2 LINC00473-203ENST00000581850 929 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TMEM233B4DJY2 RAD51-201ENST00000267868 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TMEM233B4DJY2 AKTIP-202ENST00000394657 2426 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TMEM233B4DJY2 INTS4P1-203ENST00000641008 3683 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
TMEM233B4DJY2 NAA60-229ENST00000575076 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TMEM233B4DJY2 FNDC8-201ENST00000158009 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TMEM233B4DJY2 AP003397.1-201ENST00000525706 1387 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TMEM233B4DJY2 PNLDC1-202ENST00000392167 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TMEM233B4DJY2 CELF4-221ENST00000601019 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TMEM233B4DJY2 SUCO-210ENST00000616058 5495 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TMEM233B4DJY2 ITPR3-201ENST00000374316 9870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TMEM233B4DJY2 BCS1L-212ENST00000439945 1483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TMEM233B4DJY2 SIKE1-203ENST00000369528 5506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TMEM233B4DJY2 FAM49B-201ENST00000401979 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TMEM233B4DJY2 WSCD1-208ENST00000573634 1573 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TMEM233B4DJY2 CHRNA7-217ENST00000636603 2012 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TMEM233B4DJY2 C15orf52-206ENST00000559313 3022 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TMEM233B4DJY2 GCLM-204ENST00000615724 3008 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TMEM233B4DJY2 HTR3E-202ENST00000415389 2139 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TMEM233B4DJY2 AP000845.1-201ENST00000581677 2131 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
TMEM233B4DJY2 IARS2-201ENST00000366922 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TMEM233B4DJY2 RSPRY1-202ENST00000537866 3586 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TMEM233B4DJY2 AC015656.1-201ENST00000624209 3578 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
TMEM233B4DJY2 FUS-201ENST00000254108 5119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TMEM233B4DJY2 HOXB4-201ENST00000332503 3757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TMEM233B4DJY2 RHD-207ENST00000454452 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TMEM233B4DJY2 DHRS4L2-205ENST00000543805 1334 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
TMEM233B4DJY2 ROBO1-209ENST00000495273 5600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TMEM233B4DJY2 TSPAN14-210ENST00000616406 2436 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
TMEM233B4DJY2 INPP5D-201ENST00000359570 5274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TMEM233B4DJY2 TNFSF13-201ENST00000338784 1971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TMEM233B4DJY2 REXO1L2P-201ENST00000425429 2069 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
TMEM233B4DJY2 AC068946.1-202ENST00000318673 2745 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
TMEM233B4DJY2 PHRF1-203ENST00000416188 5227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TMEM233B4DJY2 SHANK3-201ENST00000262795 7091 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
TMEM233B4DJY2 MIOS-201ENST00000340080 3453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TMEM233B4DJY2 FBN2-205ENST00000508989 4987 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
TMEM233B4DJY2 C2orf68-202ENST00000409734 1722 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
TMEM233B4DJY2 FECH-201ENST00000262093 3853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TMEM233B4DJY2 TIFA-201ENST00000361717 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TMEM233B4DJY2 CD19-201ENST00000324662 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TMEM233B4DJY2 MAEL-202ENST00000367872 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TMEM233B4DJY2 HSDL1-201ENST00000219439 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TMEM233B4DJY2 TNXB-208ENST00000611016 6083 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
TMEM233B4DJY2 ZUFSP-201ENST00000368573 1225 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
TMEM233B4DJY2 RNF186-201ENST00000375121 1250 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
TMEM233B4DJY2 AC026396.1-201ENST00000419388 421 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
TMEM233B4DJY2 C21orf33-205ENST00000427803 1077 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
TMEM233B4DJY2 AC022201.2-201ENST00000445084 287 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
TMEM233B4DJY2 CUTA-210ENST00000488034 769 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
TMEM233B4DJY2 AC093904.3-201ENST00000492300 368 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
TMEM233B4DJY2 GMDS-AS1-205ENST00000529893 900 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
TMEM233B4DJY2 AC018653.3-201ENST00000544657 749 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
TMEM233B4DJY2 AC105021.1-202ENST00000570572 669 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
TMEM233B4DJY2 FXYD1-208ENST00000589209 428 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
TMEM233B4DJY2 AC010326.2-201ENST00000602124 1020 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
TMEM233B4DJY2 FXYD1-211ENST00000612146 690 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
TMEM233B4DJY2 MAP7-207ENST00000616617 4326 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
TMEM233B4DJY2 SOCS5-202ENST00000394861 4058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TMEM233B4DJY2 WDR1-203ENST00000382452 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TMEM233B4DJY2 PPP2R5C-204ENST00000422945 4481 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
TMEM233B4DJY2 NRG2-209ENST00000541337 3723 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
TMEM233B4DJY2 PCDHA4-203ENST00000530339 5251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TMEM233B4DJY2 PRMT2-202ENST00000334494 1334 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TMEM233B4DJY2 IDH3B-201ENST00000380843 1545 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TMEM233B4DJY2 CFLAR-205ENST00000342795 1613 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TMEM233B4DJY2 MINK1-201ENST00000347992 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TMEM233B4DJY2 ZSCAN32-205ENST00000439568 1746 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TMEM233B4DJY2 C1orf159-202ENST00000379320 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TMEM233B4DJY2 LINC00476-204ENST00000429781 2825 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TMEM233B4DJY2 ANKRD35-201ENST00000355594 3342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TMEM233B4DJY2 CASC3-201ENST00000264645 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TMEM233B4DJY2 TUSC3-201ENST00000382020 3683 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TMEM233B4DJY2 ASIC4-201ENST00000347842 2684 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.7 ms