Protein–RNA interactions for Protein: B0YJ81

HACD1, Very-long-chain (3R)-3-hydroxyacyl-CoA dehydratase 1, humanhuman

Predictions only

Length 288 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HACD1B0YJ81 ETV2-204ENST00000403402 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
HACD1B0YJ81 CLCN2-201ENST00000265593 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
HACD1B0YJ81 RCAN3-202ENST00000374395 6802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
HACD1B0YJ81 ZCCHC18-203ENST00000537356 2907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
HACD1B0YJ81 SYNRG-222ENST00000614941 3406 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
HACD1B0YJ81 UPF3B-202ENST00000345865 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
HACD1B0YJ81 LENG8-208ENST00000610347 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
HACD1B0YJ81 RDM1-227ENST00000619876 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
HACD1B0YJ81 TJP2-212ENST00000636438 4689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
HACD1B0YJ81 AC026688.2-201ENST00000518984 1734 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
HACD1B0YJ81 PACSIN2-201ENST00000263246 3249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
HACD1B0YJ81 DISC1-209ENST00000439617 7059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
HACD1B0YJ81 CYP4F22-201ENST00000269703 2641 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
HACD1B0YJ81 YY1AP1-201ENST00000295566 2626 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
HACD1B0YJ81 TARBP2-203ENST00000456234 1368 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
HACD1B0YJ81 AC005885.1-204ENST00000637885 2885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
HACD1B0YJ81 FMR1-203ENST00000370470 1774 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
HACD1B0YJ81 HCST-201ENST00000246551 613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
HACD1B0YJ81 TFF2-201ENST00000291526 737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
HACD1B0YJ81 PKIG-203ENST00000372887 769 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
HACD1B0YJ81 FKBP1B-201ENST00000380986 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
HACD1B0YJ81 TMEM37-202ENST00000409826 794 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
HACD1B0YJ81 DIRC3-201ENST00000423123 552 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.91■□□□□ 0.14
HACD1B0YJ81 TSSK5P-201ENST00000423978 907 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
HACD1B0YJ81 AC009477.1-201ENST00000452936 217 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
HACD1B0YJ81 PFN2-205ENST00000461868 613 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
HACD1B0YJ81 MSC-AS1-206ENST00000519751 596 ntTSL 4 BASIC15.91■□□□□ 0.14
HACD1B0YJ81 PSMD7-204ENST00000567958 692 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
HACD1B0YJ81 AC020558.1-201ENST00000583662 425 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
HACD1B0YJ81 RPL23AP53-203ENST00000606975 736 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
HACD1B0YJ81 EBAG9-209ENST00000614147 1179 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
HACD1B0YJ81 GSN-215ENST00000545652 2428 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
HACD1B0YJ81 BUD13-201ENST00000260210 2196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
HACD1B0YJ81 PTGES3L-AARSD1-204ENST00000421990 2150 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
HACD1B0YJ81 COLQ-206ENST00000603808 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
HACD1B0YJ81 MDM2-209ENST00000393412 1404 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
HACD1B0YJ81 OXA1L-203ENST00000412791 1440 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
HACD1B0YJ81 MTFMT-201ENST00000220058 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
HACD1B0YJ81 ERRFI1-201ENST00000377482 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
HACD1B0YJ81 NRCAM-217ENST00000613830 3025 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
HACD1B0YJ81 FGR-202ENST00000374004 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
HACD1B0YJ81 IGHA1-202ENST00000641837 1310 ntAPPRIS P5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
HACD1B0YJ81 DPP6-203ENST00000404039 4798 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
HACD1B0YJ81 NACAD-202ENST00000490531 4780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
HACD1B0YJ81 PEX11B-201ENST00000369306 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
HACD1B0YJ81 GABARAPL1-218ENST00000546017 2294 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
HACD1B0YJ81 MICALL1-201ENST00000215957 4710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
HACD1B0YJ81 XRRA1-202ENST00000340360 5681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
HACD1B0YJ81 TMC6-216ENST00000590602 5268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
HACD1B0YJ81 KYAT1-202ENST00000320665 1623 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
HACD1B0YJ81 IFT52-201ENST00000373030 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
HACD1B0YJ81 ADAMTSL1-207ENST00000380566 2321 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
HACD1B0YJ81 PDGFA-203ENST00000402802 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
HACD1B0YJ81 CD19-201ENST00000324662 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
HACD1B0YJ81 LAP3-201ENST00000226299 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
HACD1B0YJ81 BET1L-201ENST00000325147 2916 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
HACD1B0YJ81 CHRDL1-204ENST00000444321 1658 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
HACD1B0YJ81 DDIAS-203ENST00000525361 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
HACD1B0YJ81 TPBG-202ENST00000535040 3392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
HACD1B0YJ81 CCDC182-201ENST00000299415 832 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
HACD1B0YJ81 AC073349.1-201ENST00000340779 1062 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
HACD1B0YJ81 HLA-DRB6-201ENST00000411500 1235 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
HACD1B0YJ81 AL365255.1-202ENST00000413887 363 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
HACD1B0YJ81 RCAN3-204ENST00000425530 997 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
HACD1B0YJ81 RNASE10-202ENST00000430083 1172 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
HACD1B0YJ81 AC008278.1-201ENST00000431117 568 ntTSL 4 BASIC15.9■□□□□ 0.14
HACD1B0YJ81 APOA1-AS-201ENST00000444200 563 ntTSL 4 BASIC15.9■□□□□ 0.14
HACD1B0YJ81 NSUN5P1-208ENST00000473960 500 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
HACD1B0YJ81 TSC22D3-213ENST00000506081 956 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
HACD1B0YJ81 AC020659.2-201ENST00000510176 585 ntTSL 4 BASIC15.9■□□□□ 0.14
HACD1B0YJ81 IGHV3-42-201ENST00000520410 361 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
HACD1B0YJ81 AP006621.2-201ENST00000533938 284 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
HACD1B0YJ81 RAB35-202ENST00000534951 939 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
HACD1B0YJ81 TRAPPC2L-206ENST00000564365 1060 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
HACD1B0YJ81 PCDHGC3-204ENST00000617222 731 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
HACD1B0YJ81 AC004461.2-201ENST00000629517 803 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
HACD1B0YJ81 RCAN3-211ENST00000630217 658 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
HACD1B0YJ81 AC247036.4-201ENST00000632099 353 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
HACD1B0YJ81 TAF6-209ENST00000452041 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
HACD1B0YJ81 TLE3-223ENST00000560939 3021 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
HACD1B0YJ81 PTPRU-201ENST00000345512 4470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
HACD1B0YJ81 DPP9-210ENST00000597849 2025 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
HACD1B0YJ81 PXN-207ENST00000536957 4112 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
HACD1B0YJ81 LHCGR-202ENST00000401907 1477 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
HACD1B0YJ81 MGMT-201ENST00000306010 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
HACD1B0YJ81 UBAC2-AS1-201ENST00000426037 1771 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
HACD1B0YJ81 AP1S3-206ENST00000443700 1785 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
HACD1B0YJ81 ZNF79-201ENST00000342483 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
HACD1B0YJ81 AKAP1-201ENST00000314126 2380 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
HACD1B0YJ81 SLC52A3-201ENST00000217254 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
HACD1B0YJ81 GOLGA2P7-202ENST00000400817 2850 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
HACD1B0YJ81 DYNLL2-201ENST00000579991 6805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
HACD1B0YJ81 MBD1-207ENST00000398488 1512 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
HACD1B0YJ81 CNN1-202ENST00000535659 1527 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
HACD1B0YJ81 WDR61-201ENST00000267973 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
HACD1B0YJ81 TGFBR2-201ENST00000295754 4621 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
HACD1B0YJ81 ZNF713-202ENST00000429591 4339 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
HACD1B0YJ81 NOS1AP-205ENST00000493151 5559 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
HACD1B0YJ81 DNAAF5-201ENST00000297440 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
HACD1B0YJ81 ABCB9-216ENST00000542678 6051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.6 ms