Protein–RNA interactions for Protein: A6NKF2

ARID3C, AT-rich interactive domain-containing protein 3C, humanhuman

Predictions only

Length 412 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARID3CA6NKF2 MSI2-204ENST00000442934 1624 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
ARID3CA6NKF2 PRDM8-201ENST00000339711 4095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
ARID3CA6NKF2 GOLGA6L2-201ENST00000312015 1379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
ARID3CA6NKF2 RFWD2-204ENST00000367669 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
ARID3CA6NKF2 TIPRL-202ENST00000367833 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
ARID3CA6NKF2 LAP3-201ENST00000226299 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
ARID3CA6NKF2 ELN-207ENST00000380562 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
ARID3CA6NKF2 CHRNA4-201ENST00000370263 5577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
ARID3CA6NKF2 KRT8P14-201ENST00000414254 1442 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
ARID3CA6NKF2 CAP2-206ENST00000489374 1430 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
ARID3CA6NKF2 JMJD4-206ENST00000615711 2591 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
ARID3CA6NKF2 CACNA1A-253ENST00000637927 6847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
ARID3CA6NKF2 EHF-212ENST00000533754 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
ARID3CA6NKF2 BBS5-202ENST00000392663 3107 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
ARID3CA6NKF2 MAEA-202ENST00000303400 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
ARID3CA6NKF2 SST-201ENST00000287641 618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
ARID3CA6NKF2 RPP40-201ENST00000319533 1088 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
ARID3CA6NKF2 ERCC1-203ENST00000340192 949 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
ARID3CA6NKF2 UFM1-202ENST00000379649 846 ntTSL 4 BASIC24.01■■□□□ 1.43
ARID3CA6NKF2 IYD-204ENST00000392255 1180 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
ARID3CA6NKF2 GATD1-203ENST00000397472 790 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
ARID3CA6NKF2 LYPLAL1-AS1-201ENST00000441331 724 ntTSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
ARID3CA6NKF2 MSRA-203ENST00000441698 788 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
ARID3CA6NKF2 ARMCX3-AS1-201ENST00000454228 490 ntTSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
ARID3CA6NKF2 AC021723.1-201ENST00000486306 515 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
ARID3CA6NKF2 AC005740.2-201ENST00000511085 419 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
ARID3CA6NKF2 NCK2-206ENST00000522586 490 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
ARID3CA6NKF2 EID1-202ENST00000560490 584 ntTSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
ARID3CA6NKF2 AC106820.3-201ENST00000561653 397 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
ARID3CA6NKF2 AP007216.2-201ENST00000562094 299 ntTSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
ARID3CA6NKF2 AP000346.4-201ENST00000614827 381 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
ARID3CA6NKF2 AC092506.1-204ENST00000634888 1066 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
ARID3CA6NKF2 TOM1-210ENST00000449058 2389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
ARID3CA6NKF2 COLEC11-201ENST00000236693 1381 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
ARID3CA6NKF2 GFAP-233ENST00000639277 1783 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
ARID3CA6NKF2 FGF1-201ENST00000337706 1469 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
ARID3CA6NKF2 AC069281.2-201ENST00000485071 4401 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
ARID3CA6NKF2 AC110813.1-201ENST00000507934 2209 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
ARID3CA6NKF2 NRCAM-217ENST00000613830 3025 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
ARID3CA6NKF2 FES-207ENST00000444422 2266 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
ARID3CA6NKF2 MCM4-201ENST00000262105 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
ARID3CA6NKF2 GSDMA-203ENST00000635792 1546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
ARID3CA6NKF2 TMEM119-201ENST00000392806 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
ARID3CA6NKF2 ARHGAP22-205ENST00000417912 2352 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
ARID3CA6NKF2 TLE4-206ENST00000376552 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
ARID3CA6NKF2 GLUD2-201ENST00000328078 2493 ntAPPRIS P1 BASIC24■■□□□ 1.43
ARID3CA6NKF2 MARCH1-203ENST00000503008 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
ARID3CA6NKF2 CLRN1-203ENST00000328863 738 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
ARID3CA6NKF2 CXorf40A-201ENST00000359293 974 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
ARID3CA6NKF2 CD8B-204ENST00000393759 1096 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
ARID3CA6NKF2 ARL16-201ENST00000397498 1227 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
ARID3CA6NKF2 PSMB5-203ENST00000425762 900 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
ARID3CA6NKF2 AC104073.2-201ENST00000453737 312 ntBASIC24■■□□□ 1.43
ARID3CA6NKF2 WSPAR-201ENST00000513561 683 ntTSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
ARID3CA6NKF2 SDR39U1-212ENST00000555365 976 ntTSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
ARID3CA6NKF2 SRD5A3-AS1-211ENST00000599135 737 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
ARID3CA6NKF2 ARL16-214ENST00000621051 1181 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
ARID3CA6NKF2 HNF1B-202ENST00000614313 1819 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
ARID3CA6NKF2 BCL2L13-206ENST00000399782 1381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
ARID3CA6NKF2 ZFP91-201ENST00000316059 5220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
ARID3CA6NKF2 ADGRB2-202ENST00000373658 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
ARID3CA6NKF2 TAL1-201ENST00000294339 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
ARID3CA6NKF2 COL4A1-204ENST00000543140 2547 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
ARID3CA6NKF2 NFATC2-205ENST00000609507 2662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
ARID3CA6NKF2 IRS2-201ENST00000375856 8138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
ARID3CA6NKF2 C14orf93-202ENST00000341470 2221 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
ARID3CA6NKF2 ZAP70-201ENST00000264972 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
ARID3CA6NKF2 CTSA-202ENST00000354880 1820 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
ARID3CA6NKF2 EEFSEC-202ENST00000483457 1859 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
ARID3CA6NKF2 TMEM256-201ENST00000302422 486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
ARID3CA6NKF2 VCX3B-201ENST00000381029 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
ARID3CA6NKF2 RPL17P11-201ENST00000417593 544 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
ARID3CA6NKF2 AC099552.2-201ENST00000418523 456 ntTSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
ARID3CA6NKF2 CDRT15-201ENST00000420162 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
ARID3CA6NKF2 AL354877.1-201ENST00000424412 413 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
ARID3CA6NKF2 PAX5-211ENST00000522003 1019 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
ARID3CA6NKF2 TALDO1-203ENST00000528097 1231 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
ARID3CA6NKF2 MIR4683-201ENST00000579659 81 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
ARID3CA6NKF2 AC026740.1-201ENST00000607068 791 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
ARID3CA6NKF2 LINC00969-254ENST00000625358 962 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
ARID3CA6NKF2 LATS1-202ENST00000392273 2567 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
ARID3CA6NKF2 ICAM2-201ENST00000412356 1334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
ARID3CA6NKF2 ZNF48-205ENST00000613509 3339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
ARID3CA6NKF2 TKT-202ENST00000423516 2075 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
ARID3CA6NKF2 TRMT44-201ENST00000389737 2799 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
ARID3CA6NKF2 ASXL1-202ENST00000375687 7031 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
ARID3CA6NKF2 FOSB-209ENST00000590335 2170 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
ARID3CA6NKF2 ENC1-207ENST00000618628 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
ARID3CA6NKF2 SMARCD1-202ENST00000394963 3658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
ARID3CA6NKF2 FAM53A-207ENST00000489363 2776 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
ARID3CA6NKF2 SYVN1-202ENST00000307289 2841 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
ARID3CA6NKF2 VIPR2-201ENST00000262178 3944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
ARID3CA6NKF2 ROR2-202ENST00000375715 2993 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
ARID3CA6NKF2 CCDC40-202ENST00000374876 2010 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
ARID3CA6NKF2 RASGRP2-201ENST00000354024 2310 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
ARID3CA6NKF2 MEST-202ENST00000341441 2443 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
ARID3CA6NKF2 DCHS2-201ENST00000339452 5064 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
ARID3CA6NKF2 WDR54-201ENST00000348227 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
ARID3CA6NKF2 DPM3-202ENST00000368399 517 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
ARID3CA6NKF2 AL121901.1-201ENST00000419613 366 ntTSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.1 ms