Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y3L3

SH3BP1, SH3 domain-binding protein 1, humanhuman

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Length 701 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP1Q9Y3L3 ERP29-203ENST00000546477 1698 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SH3BP1Q9Y3L3 AC010247.2-201ENST00000559786 1955 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SH3BP1Q9Y3L3 SYNM-201ENST00000328642 3960 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SH3BP1Q9Y3L3 TXNDC11-201ENST00000283033 3140 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SH3BP1Q9Y3L3 KRT73-201ENST00000305748 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SH3BP1Q9Y3L3 KCNC1-201ENST00000265969 4295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SH3BP1Q9Y3L3 CPA1-201ENST00000011292 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SH3BP1Q9Y3L3 AC004233.2-201ENST00000573315 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SH3BP1Q9Y3L3 SLCO2B1-205ENST00000525650 2121 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SH3BP1Q9Y3L3 TUBA3E-201ENST00000312988 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SH3BP1Q9Y3L3 SIGLEC11-202ENST00000426971 2479 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SH3BP1Q9Y3L3 ANKRD26-201ENST00000376087 6591 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SH3BP1Q9Y3L3 FAM192A-201ENST00000309137 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SH3BP1Q9Y3L3 TUBBP5-201ENST00000290377 1563 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SH3BP1Q9Y3L3 CLCN7-202ENST00000382745 4720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SH3BP1Q9Y3L3 PARVB-203ENST00000404989 1591 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SH3BP1Q9Y3L3 PARVB-204ENST00000406477 1569 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SH3BP1Q9Y3L3 VGLL4-202ENST00000413604 1554 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SH3BP1Q9Y3L3 NDUFB7-201ENST00000215565 531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SH3BP1Q9Y3L3 ALG5-201ENST00000239891 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SH3BP1Q9Y3L3 NSL1-201ENST00000366976 722 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SH3BP1Q9Y3L3 C1orf68-201ENST00000368775 949 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SH3BP1Q9Y3L3 DBNDD2-208ENST00000372723 1118 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SH3BP1Q9Y3L3 KRTAP10-1-201ENST00000400375 1215 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SH3BP1Q9Y3L3 AL513303.2-201ENST00000413339 536 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SH3BP1Q9Y3L3 TOMM22P5-201ENST00000416399 439 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
SH3BP1Q9Y3L3 AC093151.3-201ENST00000425554 623 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SH3BP1Q9Y3L3 Z98749.2-201ENST00000428294 700 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SH3BP1Q9Y3L3 AC114730.3-201ENST00000435195 584 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SH3BP1Q9Y3L3 ZNF707-203ENST00000442058 562 ntTSL 4 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SH3BP1Q9Y3L3 TTTY23B-201ENST00000442790 549 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
SH3BP1Q9Y3L3 METTL21A-209ENST00000448823 869 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SH3BP1Q9Y3L3 TMEM191A-209ENST00000452055 788 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SH3BP1Q9Y3L3 GPR53P-205ENST00000457298 1084 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
SH3BP1Q9Y3L3 FAM86LP-201ENST00000478302 853 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
SH3BP1Q9Y3L3 AC122138.1-201ENST00000508799 646 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SH3BP1Q9Y3L3 AC006064.3-201ENST00000537921 477 ntTSL 4 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SH3BP1Q9Y3L3 SHBG-212ENST00000575314 1146 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SH3BP1Q9Y3L3 SMIM22-202ENST00000586440 549 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SH3BP1Q9Y3L3 RPP40-207ENST00000618533 1056 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SH3BP1Q9Y3L3 DISC1-209ENST00000439617 7059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SH3BP1Q9Y3L3 ASAH1-223ENST00000636171 2283 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SH3BP1Q9Y3L3 SLC43A2-204ENST00000571650 3261 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SH3BP1Q9Y3L3 CD276-213ENST00000561213 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SH3BP1Q9Y3L3 AFTPH-202ENST00000238856 4040 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SH3BP1Q9Y3L3 DBET-201ENST00000630918 3363 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
SH3BP1Q9Y3L3 TOM1-204ENST00000411850 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SH3BP1Q9Y3L3 YTHDF3-215ENST00000621957 2387 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SH3BP1Q9Y3L3 WDR1-202ENST00000382451 2722 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SH3BP1Q9Y3L3 ARVCF-202ENST00000401994 2700 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SH3BP1Q9Y3L3 PHF14-215ENST00000634607 3407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SH3BP1Q9Y3L3 DAND5-202ENST00000585548 1731 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SH3BP1Q9Y3L3 SH2B3-202ENST00000538307 2062 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SH3BP1Q9Y3L3 PDE4C-202ENST00000355502 5979 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SH3BP1Q9Y3L3 DDHD2-201ENST00000397166 4921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SH3BP1Q9Y3L3 FAM222B-202ENST00000452648 2836 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SH3BP1Q9Y3L3 TBC1D3D-201ENST00000616101 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SH3BP1Q9Y3L3 TBC1D3K-201ENST00000620247 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SH3BP1Q9Y3L3 ATG10-202ENST00000355178 1438 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SH3BP1Q9Y3L3 GRM5-205ENST00000455756 7927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SH3BP1Q9Y3L3 STAT5A-211ENST00000590949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SH3BP1Q9Y3L3 SYBU-204ENST00000408908 2983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SH3BP1Q9Y3L3 EML1-201ENST00000262233 4535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SH3BP1Q9Y3L3 GCK-209ENST00000616242 2260 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SH3BP1Q9Y3L3 MEAF6-201ENST00000296214 1525 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
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SH3BP1Q9Y3L3 AP1M1-202ENST00000429941 1578 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
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SH3BP1Q9Y3L3 MTHFR-217ENST00000641820 1569 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
SH3BP1Q9Y3L3 C15orf62-201ENST00000344320 2370 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
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SH3BP1Q9Y3L3 ZBED1-201ENST00000381218 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
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SH3BP1Q9Y3L3 AKTIP-202ENST00000394657 2426 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SH3BP1Q9Y3L3 TVP23B-201ENST00000307767 2064 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SH3BP1Q9Y3L3 AAAS-217ENST00000550286 1652 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SH3BP1Q9Y3L3 PTPRO-202ENST00000348962 5061 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SH3BP1Q9Y3L3 AL133456.1-201ENST00000415655 577 ntTSL 4 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SH3BP1Q9Y3L3 GALT-202ENST00000450095 1280 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SH3BP1Q9Y3L3 AC013451.1-201ENST00000554552 518 ntTSL 4 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SH3BP1Q9Y3L3 AC016727.1-204ENST00000578974 420 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SH3BP1Q9Y3L3 PIGL-212ENST00000581006 554 ntTSL 4 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SH3BP1Q9Y3L3 TMEM101-204ENST00000587529 965 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SH3BP1Q9Y3L3 PRKCSH-217ENST00000592741 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SH3BP1Q9Y3L3 KXD1-204ENST00000595073 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SH3BP1Q9Y3L3 AC008758.5-201ENST00000595562 617 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SH3BP1Q9Y3L3 AL391069.4-201ENST00000609583 481 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
SH3BP1Q9Y3L3 NDUFB1-207ENST00000617122 417 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SH3BP1Q9Y3L3 PHGDH-223ENST00000641597 2585 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SH3BP1Q9Y3L3 SNAP47-AS1-201ENST00000413347 1708 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SH3BP1Q9Y3L3 ETV4-211ENST00000591713 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SH3BP1Q9Y3L3 LINC00937-207ENST00000544461 3033 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SH3BP1Q9Y3L3 RCAN3-207ENST00000538532 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SH3BP1Q9Y3L3 RREB1-204ENST00000379938 8778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SH3BP1Q9Y3L3 ASAH1-254ENST00000637636 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SH3BP1Q9Y3L3 POM121-203ENST00000434423 3750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SH3BP1Q9Y3L3 NRBP1-201ENST00000233557 2887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SH3BP1Q9Y3L3 CD300LG-206ENST00000588884 1459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SH3BP1Q9Y3L3 MBD1-202ENST00000269471 2980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SH3BP1Q9Y3L3 TLE3-223ENST00000560939 3021 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
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