Protein–RNA interactions for Protein: Q9NP55

BPIFA1, BPI fold-containing family A member 1, humanhuman

Predictions only

Length 256 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BPIFA1Q9NP55 COLQ-206ENST00000603808 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
BPIFA1Q9NP55 CHMP1A-201ENST00000397901 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
BPIFA1Q9NP55 HYAL2-208ENST00000447092 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
BPIFA1Q9NP55 ZNF302-207ENST00000505365 2955 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
BPIFA1Q9NP55 GCLC-213ENST00000616923 3694 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
BPIFA1Q9NP55 KCNC2-207ENST00000548513 3026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
BPIFA1Q9NP55 TMBIM7P-203ENST00000641617 1718 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
BPIFA1Q9NP55 ZNF687-201ENST00000324048 5378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
BPIFA1Q9NP55 SMARCD2-202ENST00000323347 1935 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
BPIFA1Q9NP55 MKNK2-201ENST00000250896 3774 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
BPIFA1Q9NP55 SIGLEC10-201ENST00000339313 2256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
BPIFA1Q9NP55 CDC42-203ENST00000400259 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
BPIFA1Q9NP55 NOX5-204ENST00000455873 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
BPIFA1Q9NP55 MGME1-201ENST00000377704 1781 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
BPIFA1Q9NP55 MAGEA12-202ENST00000393869 1761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
BPIFA1Q9NP55 CHD4-210ENST00000544040 6514 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
BPIFA1Q9NP55 SYCE1-202ENST00000343131 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
BPIFA1Q9NP55 TSPAN4-201ENST00000346501 882 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
BPIFA1Q9NP55 MORN4-202ENST00000370635 419 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
BPIFA1Q9NP55 AC016735.2-201ENST00000438736 569 ntTSL 4 BASIC15.63■□□□□ 0.09
BPIFA1Q9NP55 SPTLC1P1-201ENST00000447199 261 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
BPIFA1Q9NP55 SLC35B4-204ENST00000470969 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
BPIFA1Q9NP55 SERF1B-208ENST00000515588 792 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
BPIFA1Q9NP55 C11orf98-202ENST00000525675 405 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
BPIFA1Q9NP55 ZNF226-211ENST00000588742 447 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
BPIFA1Q9NP55 ELOF1-205ENST00000589171 743 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
BPIFA1Q9NP55 AL158212.4-201ENST00000624062 1286 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
BPIFA1Q9NP55 AC008761.3-201ENST00000624803 892 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
BPIFA1Q9NP55 ADCY2-201ENST00000338316 6575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
BPIFA1Q9NP55 SLC18A1-207ENST00000519026 1980 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
BPIFA1Q9NP55 NFE2L1-214ENST00000582155 1998 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
BPIFA1Q9NP55 HNF1B-207ENST00000621123 1971 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
BPIFA1Q9NP55 RXRA-202ENST00000481739 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
BPIFA1Q9NP55 C18orf15-201ENST00000623680 2534 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
BPIFA1Q9NP55 UBE2J1-201ENST00000435041 4290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
BPIFA1Q9NP55 NEK7-202ENST00000367385 4149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
BPIFA1Q9NP55 CCDC155-201ENST00000447857 2378 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
BPIFA1Q9NP55 TUB-AS1-201ENST00000506601 2021 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
BPIFA1Q9NP55 CLN8-205ENST00000520991 1305 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
BPIFA1Q9NP55 DIDO1-201ENST00000266070 8574 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
BPIFA1Q9NP55 ITSN1-205ENST00000381291 5437 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
BPIFA1Q9NP55 PAM-206ENST00000438793 5432 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
BPIFA1Q9NP55 MDFIC-202ENST00000393486 4393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
BPIFA1Q9NP55 NUMBL-201ENST00000252891 3561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
BPIFA1Q9NP55 ELMO3-201ENST00000360833 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
BPIFA1Q9NP55 TMUB2-212ENST00000589785 1918 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
BPIFA1Q9NP55 PDE1B-201ENST00000243052 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
BPIFA1Q9NP55 AP000866.1-201ENST00000499143 2886 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
BPIFA1Q9NP55 EXOC3L1-201ENST00000314586 2510 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
BPIFA1Q9NP55 CAST-224ENST00000508830 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
BPIFA1Q9NP55 LMAN1-201ENST00000251047 5521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
BPIFA1Q9NP55 OTUD7A-201ENST00000307050 10770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
BPIFA1Q9NP55 TMA16-201ENST00000358572 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
BPIFA1Q9NP55 SPIB-201ENST00000270632 1443 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
BPIFA1Q9NP55 CHIA-201ENST00000343320 1624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
BPIFA1Q9NP55 LINC00996-201ENST00000477392 2043 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
BPIFA1Q9NP55 SIN3B-202ENST00000379803 5129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
BPIFA1Q9NP55 KIF3A-202ENST00000378746 6325 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
BPIFA1Q9NP55 HS2ST1-201ENST00000370550 6736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
BPIFA1Q9NP55 AFAP1-201ENST00000358461 7516 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
BPIFA1Q9NP55 VCX-201ENST00000341408 677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
BPIFA1Q9NP55 CSNK2B-203ENST00000375882 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
BPIFA1Q9NP55 LYPLAL1-AS1-201ENST00000441331 724 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
BPIFA1Q9NP55 VCX3B-204ENST00000453306 868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
BPIFA1Q9NP55 AC106795.3-201ENST00000511650 547 ntTSL 4 BASIC15.62■□□□□ 0.09
BPIFA1Q9NP55 TAPBPL-205ENST00000544021 772 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
BPIFA1Q9NP55 AC108134.3-202ENST00000571404 1207 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
BPIFA1Q9NP55 PTPRS-208ENST00000590509 893 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
BPIFA1Q9NP55 LINC01703-202ENST00000602806 595 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
BPIFA1Q9NP55 AC004233.3-201ENST00000607794 1269 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
BPIFA1Q9NP55 PCDHGC3-204ENST00000617222 731 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
BPIFA1Q9NP55 NPAS2-201ENST00000335681 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
BPIFA1Q9NP55 CLK3P2-201ENST00000427566 1453 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
BPIFA1Q9NP55 AC138969.3-201ENST00000546612 1459 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
BPIFA1Q9NP55 AC138932.2-201ENST00000548268 1459 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
BPIFA1Q9NP55 AC126755.4-201ENST00000549796 1459 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
BPIFA1Q9NP55 SMC4-204ENST00000462787 5033 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
BPIFA1Q9NP55 ACTL8-201ENST00000375406 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
BPIFA1Q9NP55 STK33-217ENST00000534493 1895 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
BPIFA1Q9NP55 DCUN1D4-203ENST00000451288 4269 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
BPIFA1Q9NP55 UCP2-201ENST00000310473 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
BPIFA1Q9NP55 ZNF7-218ENST00000544249 2125 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
BPIFA1Q9NP55 GPS1-227ENST00000623761 1943 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
BPIFA1Q9NP55 ZSCAN32-205ENST00000439568 1746 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
BPIFA1Q9NP55 SNRPN-201ENST00000346403 1304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
BPIFA1Q9NP55 CNOT10-202ENST00000331889 2573 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
BPIFA1Q9NP55 IL12RB2-201ENST00000262345 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
BPIFA1Q9NP55 STIP1-201ENST00000305218 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
BPIFA1Q9NP55 DNASE2-201ENST00000222219 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
BPIFA1Q9NP55 LFNG-202ENST00000338732 1968 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
BPIFA1Q9NP55 FAM153B-220ENST00000515817 1966 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
BPIFA1Q9NP55 AC112693.3-201ENST00000624819 1983 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
BPIFA1Q9NP55 MLKL-201ENST00000306247 1781 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
BPIFA1Q9NP55 GLIDR-204ENST00000638724 1765 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
BPIFA1Q9NP55 DEPTOR-203ENST00000523492 1397 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
BPIFA1Q9NP55 RERG-209ENST00000546331 1383 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
BPIFA1Q9NP55 PRKAG3-206ENST00000529249 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
BPIFA1Q9NP55 MAPK7-204ENST00000395604 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
BPIFA1Q9NP55 MLPH-203ENST00000409373 2031 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
BPIFA1Q9NP55 CNN1-210ENST00000592923 1848 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.8 ms