Protein–RNA interactions for Protein: Q9HAW4

CLSPN, Claspin, humanhuman

Predictions only

Length 1,339 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLSPNQ9HAW4 AP2A2-201ENST00000332231 4656 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CLSPNQ9HAW4 SNHG11-201ENST00000359074 1031 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CLSPNQ9HAW4 RHOG-203ENST00000396979 1289 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CLSPNQ9HAW4 PFN2-205ENST00000461868 613 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CLSPNQ9HAW4 AC027369.6-201ENST00000525520 931 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
CLSPNQ9HAW4 RHOG-204ENST00000533217 886 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CLSPNQ9HAW4 RNASEK-207ENST00000552842 595 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CLSPNQ9HAW4 AC044860.1-202ENST00000559481 777 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
CLSPNQ9HAW4 AC004461.2-201ENST00000629517 803 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
CLSPNQ9HAW4 AL359644.1-202ENST00000637541 571 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CLSPNQ9HAW4 SPG21-203ENST00000433215 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CLSPNQ9HAW4 PHF10-205ENST00000612128 4395 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CLSPNQ9HAW4 CALM3-212ENST00000599839 1355 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CLSPNQ9HAW4 AC090286.1-201ENST00000354432 1489 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CLSPNQ9HAW4 SKOR1-201ENST00000341418 3332 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CLSPNQ9HAW4 PIMREG-205ENST00000572447 1948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CLSPNQ9HAW4 MAPK7-204ENST00000395604 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CLSPNQ9HAW4 AJ011931.1-201ENST00000618749 2492 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
CLSPNQ9HAW4 ITGA7-202ENST00000347027 4084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CLSPNQ9HAW4 ZNF397-201ENST00000261333 1419 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CLSPNQ9HAW4 MBD1-207ENST00000398488 1512 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CLSPNQ9HAW4 PSMD2-201ENST00000310118 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CLSPNQ9HAW4 HDAC5-201ENST00000225983 5326 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CLSPNQ9HAW4 RREB1-204ENST00000379938 8778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CLSPNQ9HAW4 ZNF789-211ENST00000493485 556 ntTSL 4 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CLSPNQ9HAW4 AC108449.3-201ENST00000560714 585 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CLSPNQ9HAW4 OIP5-AS1-209ENST00000561226 775 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CLSPNQ9HAW4 CKMT1A-208ENST00000626814 1073 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CLSPNQ9HAW4 TM4SF19-AS1-203ENST00000452051 1829 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CLSPNQ9HAW4 SLC26A10-201ENST00000320442 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CLSPNQ9HAW4 SHMT2-202ENST00000414700 2006 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CLSPNQ9HAW4 ZBTB45P1-201ENST00000452761 1456 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
CLSPNQ9HAW4 GOLIM4-201ENST00000309027 2100 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CLSPNQ9HAW4 ZNF563-201ENST00000293725 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CLSPNQ9HAW4 ZXDC-202ENST00000389709 3405 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CLSPNQ9HAW4 LINC00691-201ENST00000432505 2232 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CLSPNQ9HAW4 SSH3-203ENST00000376757 2990 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CLSPNQ9HAW4 LINC00221-201ENST00000603633 1656 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CLSPNQ9HAW4 LINC02268-202ENST00000515444 1328 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.23
CLSPNQ9HAW4 PRRG3-205ENST00000538575 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.23
CLSPNQ9HAW4 MDM2-209ENST00000393412 1404 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.23
CLSPNQ9HAW4 OXA1L-203ENST00000412791 1440 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.23
CLSPNQ9HAW4 NR1H3-211ENST00000441012 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CLSPNQ9HAW4 CPT2-201ENST00000371486 3094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CLSPNQ9HAW4 DIDO1-201ENST00000266070 8574 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CLSPNQ9HAW4 ATP6V1H-202ENST00000359530 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CLSPNQ9HAW4 GNAQ-201ENST00000286548 6539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CLSPNQ9HAW4 PICALM-204ENST00000526033 3613 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CLSPNQ9HAW4 USE1-201ENST00000263897 843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CLSPNQ9HAW4 C16orf92-201ENST00000300575 895 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CLSPNQ9HAW4 VMA21-202ENST00000370361 693 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CLSPNQ9HAW4 AGER-204ENST00000375067 1250 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CLSPNQ9HAW4 YAE1D1-202ENST00000432096 968 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CLSPNQ9HAW4 LINC02437-201ENST00000505053 911 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CLSPNQ9HAW4 FAU-205ENST00000527548 538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CLSPNQ9HAW4 AC108134.3-202ENST00000571404 1207 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CLSPNQ9HAW4 WDR88-203ENST00000592765 651 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CLSPNQ9HAW4 RPL23AP53-203ENST00000606975 736 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CLSPNQ9HAW4 AC244153.1-202ENST00000617855 482 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CLSPNQ9HAW4 FAM92A-219ENST00000620645 1014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CLSPNQ9HAW4 OTUB1-206ENST00000535715 1391 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CLSPNQ9HAW4 KNSTRN-202ENST00000416151 1899 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CLSPNQ9HAW4 HELZ2-202ENST00000427522 7827 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CLSPNQ9HAW4 LMF2-201ENST00000216080 2658 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CLSPNQ9HAW4 UNC119B-201ENST00000344651 4404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CLSPNQ9HAW4 GRAMD4-203ENST00000408031 2834 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CLSPNQ9HAW4 MLF1-216ENST00000618075 2116 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CLSPNQ9HAW4 ATP6V1B1-202ENST00000412314 1805 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CLSPNQ9HAW4 TMEM222-211ENST00000611517 1613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CLSPNQ9HAW4 CNN1-202ENST00000535659 1527 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CLSPNQ9HAW4 RNASE1-202ENST00000397967 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CLSPNQ9HAW4 AC138517.2-201ENST00000637503 2594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CLSPNQ9HAW4 FGR-202ENST00000374004 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CLSPNQ9HAW4 COL2A1-202ENST00000380518 5071 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CLSPNQ9HAW4 CFAP53-201ENST00000398545 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CLSPNQ9HAW4 SLC26A11-203ENST00000546047 2807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CLSPNQ9HAW4 RHNO1-202ENST00000461997 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CLSPNQ9HAW4 KRT85-201ENST00000257901 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CLSPNQ9HAW4 RWDD3-201ENST00000263893 1078 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CLSPNQ9HAW4 NKAIN2-201ENST00000368416 1106 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CLSPNQ9HAW4 FAM86GP-201ENST00000448322 971 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
CLSPNQ9HAW4 MZF1-202ENST00000594108 1110 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CLSPNQ9HAW4 AC093028.1-201ENST00000622998 982 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
CLSPNQ9HAW4 ALAS2-201ENST00000330807 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CLSPNQ9HAW4 FAM86B1-216ENST00000533852 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CLSPNQ9HAW4 SAP130-203ENST00000357702 4173 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CLSPNQ9HAW4 BRCC3-201ENST00000330045 2496 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CLSPNQ9HAW4 PIKFYVE-202ENST00000308862 1640 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CLSPNQ9HAW4 AC004223.3-201ENST00000593039 1638 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CLSPNQ9HAW4 CTIF-201ENST00000256413 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CLSPNQ9HAW4 HID1-202ENST00000425042 3271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CLSPNQ9HAW4 SLC22A7-203ENST00000372589 2549 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CLSPNQ9HAW4 ZFP28-201ENST00000301318 4096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CLSPNQ9HAW4 LINC02138-201ENST00000378340 1326 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CLSPNQ9HAW4 TOM1-201ENST00000382034 1300 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CLSPNQ9HAW4 BCL11A-203ENST00000358510 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CLSPNQ9HAW4 CCHCR1-208ENST00000451521 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CLSPNQ9HAW4 PAK4-205ENST00000593690 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CLSPNQ9HAW4 DHFR-201ENST00000439211 3917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CLSPNQ9HAW4 EVC2-202ENST00000344408 4390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.9 ms