Protein–RNA interactions for Protein: Q99963

SH3GL3, Endophilin-A3, humanhuman

Predictions only

Length 347 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3GL3Q99963 AC005324.3-201ENST00000455584 5514 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
SH3GL3Q99963 GPN3-202ENST00000537466 1491 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SH3GL3Q99963 ST6GAL2-204ENST00000409382 7275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SH3GL3Q99963 ACTRT2-201ENST00000378404 1421 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
SH3GL3Q99963 HYAL3-205ENST00000450982 1402 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SH3GL3Q99963 ADAMTS10-201ENST00000270328 4194 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
SH3GL3Q99963 SLC2A11-203ENST00000345044 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SH3GL3Q99963 MICA-209ENST00000449934 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SH3GL3Q99963 HTR3A-203ENST00000375498 2235 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SH3GL3Q99963 CCDC144B-202ENST00000445752 2197 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
SH3GL3Q99963 ARAP1-203ENST00000393605 4778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SH3GL3Q99963 NDUFB9-201ENST00000276689 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SH3GL3Q99963 BAG1-202ENST00000379704 1128 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SH3GL3Q99963 REV1-202ENST00000393445 4686 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SH3GL3Q99963 MPG-203ENST00000397817 1039 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
SH3GL3Q99963 AC018712.1-201ENST00000455767 687 ntBASIC15.03■□□□□ -0
SH3GL3Q99963 IDH3B-206ENST00000474315 1279 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SH3GL3Q99963 AMACR-208ENST00000512079 858 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SH3GL3Q99963 ABO-202ENST00000538324 1147 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
SH3GL3Q99963 ATP5G2-204ENST00000549164 745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
SH3GL3Q99963 TUBB3-205ENST00000554336 903 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
SH3GL3Q99963 IER2-202ENST00000587885 1291 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
SH3GL3Q99963 AC006557.2-201ENST00000592985 1240 ntBASIC15.03■□□□□ -0
SH3GL3Q99963 ATP5G2-209ENST00000602871 668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
SH3GL3Q99963 SMIM20-205ENST00000614775 1190 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
SH3GL3Q99963 KCNT1-212ENST00000628528 7057 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
SH3GL3Q99963 B3GALNT1-203ENST00000392781 3606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SH3GL3Q99963 GRID2IP-203ENST00000457091 3636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
SH3GL3Q99963 WRAP73-202ENST00000378322 1998 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SH3GL3Q99963 PELP1-202ENST00000436683 3524 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
SH3GL3Q99963 DMTN-220ENST00000523266 2735 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
SH3GL3Q99963 SPPL2B-209ENST00000613503 3456 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SH3GL3Q99963 MAEL-202ENST00000367872 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SH3GL3Q99963 DNM1P41-201ENST00000623634 3350 ntBASIC15.03■□□□□ -0
SH3GL3Q99963 TOX3-201ENST00000219746 3233 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
SH3GL3Q99963 PPEF2-207ENST00000621010 1797 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SH3GL3Q99963 CHEK1-202ENST00000427383 1670 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SH3GL3Q99963 DMRTC2-204ENST00000596827 1675 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
SH3GL3Q99963 CPSF7-202ENST00000394888 3650 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
SH3GL3Q99963 SMARCD1-202ENST00000394963 3658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SH3GL3Q99963 TMPO-202ENST00000266732 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SH3GL3Q99963 RNF145-202ENST00000424310 3613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SH3GL3Q99963 CA9-201ENST00000378357 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SH3GL3Q99963 AMIGO3-201ENST00000320431 2862 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
SH3GL3Q99963 BAIAP2-202ENST00000321300 2879 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SH3GL3Q99963 IMPDH1-201ENST00000338791 2881 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
SH3GL3Q99963 TVP23C-CDRT4-203ENST00000522212 2833 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
SH3GL3Q99963 GCKR-201ENST00000264717 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
SH3GL3Q99963 CDIPT-209ENST00000569956 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
SH3GL3Q99963 PIM2-201ENST00000376509 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
SH3GL3Q99963 DLX1-203ENST00000361725 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
SH3GL3Q99963 GOLIM4-202ENST00000470487 4373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
SH3GL3Q99963 CCDC40-202ENST00000374876 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
SH3GL3Q99963 SNX19-201ENST00000265909 6535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
SH3GL3Q99963 RDX-218ENST00000544551 4117 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
SH3GL3Q99963 NBPF26-208ENST00000620612 4602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
SH3GL3Q99963 CLN6-202ENST00000538696 1343 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
SH3GL3Q99963 PARN-202ENST00000420015 2360 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
SH3GL3Q99963 GLUL-203ENST00000339526 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
SH3GL3Q99963 ZMIZ1-AS1-203ENST00000456353 2878 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
SH3GL3Q99963 CD1E-213ENST00000444681 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
SH3GL3Q99963 TMEM237-213ENST00000621467 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
SH3GL3Q99963 DHDH-201ENST00000221403 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
SH3GL3Q99963 TRIM36-203ENST00000379618 693 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
SH3GL3Q99963 PTCHD3P3-201ENST00000403073 906 ntBASIC15.02■□□□□ -0
SH3GL3Q99963 ELK2BP-201ENST00000415014 1224 ntBASIC15.02■□□□□ -0
SH3GL3Q99963 LINC01972-201ENST00000422271 553 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
SH3GL3Q99963 RMDN1-202ENST00000430676 1106 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
SH3GL3Q99963 DHRS12-203ENST00000444610 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
SH3GL3Q99963 ARTN-206ENST00000472435 402 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
SH3GL3Q99963 TSPAN4-214ENST00000525201 834 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
SH3GL3Q99963 FAU-209ENST00000531743 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
SH3GL3Q99963 AC135586.2-201ENST00000537262 567 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.02■□□□□ -0
SH3GL3Q99963 AL450267.1-201ENST00000557174 520 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
SH3GL3Q99963 DHRS4-205ENST00000558263 1089 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
SH3GL3Q99963 DHRS4L2-207ENST00000558753 556 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
SH3GL3Q99963 AC009061.1-201ENST00000567261 475 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
SH3GL3Q99963 SMIM22-210ENST00000615471 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
SH3GL3Q99963 ITGB8-201ENST00000222573 8751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
SH3GL3Q99963 CSNK1D-202ENST00000314028 3712 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
SH3GL3Q99963 SGK2-204ENST00000373100 2225 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
SH3GL3Q99963 MEST-206ENST00000416162 2158 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
SH3GL3Q99963 COLQ-206ENST00000603808 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
SH3GL3Q99963 BMP1-203ENST00000354870 3989 ntTSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
SH3GL3Q99963 MPHOSPH10-205ENST00000498451 2068 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
SH3GL3Q99963 TSC2-203ENST00000382538 5264 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.02□□□□□ -0.01
SH3GL3Q99963 SEC14L3-204ENST00000403066 2474 ntTSL 2 BASIC15.02□□□□□ -0.01
SH3GL3Q99963 MLPH-203ENST00000409373 2031 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
SH3GL3Q99963 CSPG4-201ENST00000308508 8290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
SH3GL3Q99963 CAMKV-209ENST00000477224 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
SH3GL3Q99963 RADIL-201ENST00000399583 3689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
SH3GL3Q99963 PPP1R3D-201ENST00000370996 3630 ntAPPRIS P1 BASIC15.02□□□□□ -0.01
SH3GL3Q99963 HTR3A-202ENST00000355556 2331 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
SH3GL3Q99963 INHA-201ENST00000243786 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
SH3GL3Q99963 TAF8-203ENST00000372982 1805 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
SH3GL3Q99963 LINC01657-201ENST00000457217 1809 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
SH3GL3Q99963 LAP3-201ENST00000226299 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
SH3GL3Q99963 AC243591.1-201ENST00000452967 1364 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
SH3GL3Q99963 CARHSP1-218ENST00000614449 2931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
SH3GL3Q99963 STEAP3-204ENST00000409811 2103 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.1 ms