Protein–RNA interactions for Protein: Q92908

GATA6, Transcription factor GATA-6, humanhuman

Predictions only

Length 595 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GATA6Q92908 GABARAPL1-205ENST00000539170 1700 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
GATA6Q92908 LOH12CR2-201ENST00000381800 1540 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
GATA6Q92908 LIPE-AS1-201ENST00000457234 1501 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
GATA6Q92908 AC006449.6-201ENST00000612330 2296 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
GATA6Q92908 CTSW-201ENST00000307886 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
GATA6Q92908 TEAD3-204ENST00000639578 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
GATA6Q92908 PERM1-201ENST00000341290 3035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
GATA6Q92908 WASHC2C-209ENST00000540872 4519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
GATA6Q92908 GPD2-201ENST00000310454 6041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
GATA6Q92908 CLCN1-201ENST00000343257 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
GATA6Q92908 DCAF5-201ENST00000341516 5953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
GATA6Q92908 SHISA5-219ENST00000612611 1677 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
GATA6Q92908 GABRD-218ENST00000640949 1684 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
GATA6Q92908 MSH5-203ENST00000375750 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
GATA6Q92908 MBNL1-201ENST00000282486 6422 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
GATA6Q92908 MUC1-228ENST00000620103 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
GATA6Q92908 EMC4-201ENST00000249209 852 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
GATA6Q92908 CSHL1-203ENST00000346606 659 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
GATA6Q92908 WWOX-201ENST00000355860 710 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
GATA6Q92908 GBGT1-202ENST00000372038 847 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
GATA6Q92908 MFAP2-201ENST00000375534 970 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
GATA6Q92908 MS4A13-201ENST00000378185 808 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
GATA6Q92908 P3H2-AS1-201ENST00000412203 730 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
GATA6Q92908 AC127070.2-201ENST00000424075 555 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
GATA6Q92908 AL606534.2-205ENST00000437691 346 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
GATA6Q92908 AC114501.2-201ENST00000439631 535 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
GATA6Q92908 HSPB7-207ENST00000487046 844 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
GATA6Q92908 CNOT8-214ENST00000520671 923 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
GATA6Q92908 AC006064.3-201ENST00000537921 477 ntTSL 4 BASIC15.74■□□□□ 0.11
GATA6Q92908 AC123567.1-201ENST00000548294 1261 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
GATA6Q92908 AC044860.1-202ENST00000559481 777 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
GATA6Q92908 AC009133.2-201ENST00000566537 547 ntTSL 4 BASIC15.74■□□□□ 0.11
GATA6Q92908 AC012615.4-201ENST00000586694 607 ntTSL 4 BASIC15.74■□□□□ 0.11
GATA6Q92908 LAMTOR5-208ENST00000614544 846 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
GATA6Q92908 AC244517.4-201ENST00000624549 580 ntTSL 4 BASIC15.74■□□□□ 0.11
GATA6Q92908 MOCS1-205ENST00000373195 2852 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
GATA6Q92908 NEIL2-201ENST00000284503 2671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
GATA6Q92908 BCAT2-209ENST00000599246 1449 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
GATA6Q92908 TYSND1-202ENST00000335494 3397 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
GATA6Q92908 SPATA7-203ENST00000393545 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
GATA6Q92908 SLC26A11-203ENST00000546047 2807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
GATA6Q92908 ACOT12-201ENST00000307624 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
GATA6Q92908 VPS9D1-201ENST00000389386 2748 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
GATA6Q92908 UBE2G2-202ENST00000345496 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
GATA6Q92908 LIPE-AS1-205ENST00000594688 2383 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
GATA6Q92908 MCF2L-203ENST00000375604 6445 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
GATA6Q92908 TAOK3-201ENST00000392533 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
GATA6Q92908 TINF2-202ENST00000399423 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
GATA6Q92908 CYP21A2-221ENST00000418967 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
GATA6Q92908 CHAF1A-201ENST00000301280 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
GATA6Q92908 RSPO1-204ENST00000615459 2331 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
GATA6Q92908 AC005840.4-201ENST00000541242 2494 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
GATA6Q92908 GLS2-201ENST00000311966 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
GATA6Q92908 TSPAN3-201ENST00000267970 6467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
GATA6Q92908 BICDL1-201ENST00000397558 3055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
GATA6Q92908 GPAT2-202ENST00000434632 3061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
GATA6Q92908 ADGRB2-203ENST00000398538 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
GATA6Q92908 PDE8B-202ENST00000333194 2572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
GATA6Q92908 PRMT9-201ENST00000322396 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
GATA6Q92908 NMU-201ENST00000264218 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
GATA6Q92908 VAPA-201ENST00000340541 1227 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
GATA6Q92908 MEP1AP4-201ENST00000423244 1087 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
GATA6Q92908 TEX48-201ENST00000436752 708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
GATA6Q92908 AC084864.1-201ENST00000496217 305 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
GATA6Q92908 TMEM33-208ENST00000513702 1092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
GATA6Q92908 RAB35-202ENST00000534951 939 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
GATA6Q92908 AGER-214ENST00000538695 487 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
GATA6Q92908 AL512361.1-201ENST00000554200 418 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
GATA6Q92908 ACYP1-206ENST00000555694 565 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
GATA6Q92908 COG4-212ENST00000564653 590 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
GATA6Q92908 AC133550.2-201ENST00000567731 544 ntTSL 4 BASIC15.73■□□□□ 0.11
GATA6Q92908 AC105021.1-202ENST00000570572 669 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
GATA6Q92908 AC027601.2-201ENST00000571085 805 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
GATA6Q92908 LINC01975-201ENST00000571890 549 ntTSL 4 BASIC15.73■□□□□ 0.11
GATA6Q92908 NFATC3-222ENST00000575270 3824 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
GATA6Q92908 NOP53-AS1-201ENST00000602048 540 ntTSL 4 BASIC15.73■□□□□ 0.11
GATA6Q92908 TEX48-202ENST00000612244 662 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
GATA6Q92908 5S_rRNA.22-201ENST00000614916 106 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
GATA6Q92908 AGER-215ENST00000620802 737 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
GATA6Q92908 NFIC-201ENST00000341919 1573 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
GATA6Q92908 HBP1-201ENST00000222574 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
GATA6Q92908 TMCO3-207ENST00000474393 2843 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
GATA6Q92908 SAFB-205ENST00000588852 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
GATA6Q92908 RNF34-202ENST00000392464 1722 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
GATA6Q92908 ARPC1B-211ENST00000451682 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
GATA6Q92908 CDH24-202ENST00000397359 3552 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
GATA6Q92908 PRKRIP1-201ENST00000397912 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
GATA6Q92908 PDE1B-207ENST00000550620 2150 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
GATA6Q92908 ITGB2-206ENST00000397852 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
GATA6Q92908 CTBP1-AS2-205ENST00000578730 2757 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
GATA6Q92908 CEP63-212ENST00000513612 2903 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
GATA6Q92908 AC004706.4-201ENST00000634965 3537 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
GATA6Q92908 MARVELD3-204ENST00000565261 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
GATA6Q92908 FBLIM1-206ENST00000441801 1543 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
GATA6Q92908 GPS1-228ENST00000624957 1825 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
GATA6Q92908 LINC02447-202ENST00000501888 2146 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
GATA6Q92908 LINC02212-201ENST00000515243 2130 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
GATA6Q92908 ACOX3-203ENST00000503233 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
GATA6Q92908 EEF1AKMT3-201ENST00000300209 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
GATA6Q92908 RPS6KL1-210ENST00000555647 3309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 67 ms