Protein–RNA interactions for Protein: Q8TF64

GIPC3, PDZ domain-containing protein GIPC3, humanhuman

Predictions only

Length 312 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GIPC3Q8TF64 USH1C-207ENST00000527720 2278 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
GIPC3Q8TF64 TTC39A-208ENST00000413473 2718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
GIPC3Q8TF64 C4orf19-201ENST00000284437 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
GIPC3Q8TF64 AC018892.3-201ENST00000623986 2499 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
GIPC3Q8TF64 PPP1R13L-202ENST00000418234 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
GIPC3Q8TF64 ERICH5-201ENST00000318528 1761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
GIPC3Q8TF64 CYP1B1-AS1-201ENST00000413828 1781 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
GIPC3Q8TF64 AC148477.4-201ENST00000613430 1793 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
GIPC3Q8TF64 DCUN1D3-201ENST00000324344 6162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
GIPC3Q8TF64 TMEM184B-202ENST00000361906 3611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
GIPC3Q8TF64 AL139385.1-201ENST00000611744 3272 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
GIPC3Q8TF64 MRPS22-212ENST00000495075 1547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
GIPC3Q8TF64 PTHLH-209ENST00000545234 1544 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
GIPC3Q8TF64 SLC23A1-201ENST00000348729 2299 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
GIPC3Q8TF64 FAM107A-206ENST00000474531 2271 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
GIPC3Q8TF64 SLC27A4-201ENST00000300456 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
GIPC3Q8TF64 AEN-201ENST00000332810 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
GIPC3Q8TF64 FDFT1-223ENST00000615631 2462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
GIPC3Q8TF64 AKNA-206ENST00000374088 5464 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
GIPC3Q8TF64 METTL26-201ENST00000301686 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
GIPC3Q8TF64 METTL26-205ENST00000397666 726 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
GIPC3Q8TF64 ABCG1-205ENST00000398449 2998 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
GIPC3Q8TF64 MECP2-203ENST00000407218 1174 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
GIPC3Q8TF64 LETMD1-203ENST00000418425 2123 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
GIPC3Q8TF64 HNRNPDP1-201ENST00000439535 754 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
GIPC3Q8TF64 FTCD-AS1-201ENST00000446649 500 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
GIPC3Q8TF64 HYAL1-206ENST00000447605 666 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
GIPC3Q8TF64 C1orf109-203ENST00000464085 919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
GIPC3Q8TF64 RNF146-204ENST00000476956 884 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
GIPC3Q8TF64 SMCO4-204ENST00000527149 472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
GIPC3Q8TF64 NAA60-217ENST00000572942 1089 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
GIPC3Q8TF64 AC087741.1-203ENST00000576824 820 ntTSL 3 BASIC14.67□□□□□ -0.06
GIPC3Q8TF64 MIR4313-201ENST00000580760 101 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
GIPC3Q8TF64 INTS4P1-202ENST00000587624 2985 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
GIPC3Q8TF64 TST-204ENST00000622841 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
GIPC3Q8TF64 TP73-AS1-207ENST00000624167 988 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
GIPC3Q8TF64 CCNJ-201ENST00000265992 4115 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
GIPC3Q8TF64 CD300LG-204ENST00000539718 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
GIPC3Q8TF64 ADAMTSL1-207ENST00000380566 2321 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
GIPC3Q8TF64 CLDN19-202ENST00000372539 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
GIPC3Q8TF64 MROH4P-201ENST00000431302 1578 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
GIPC3Q8TF64 SUPT20H-201ENST00000350612 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
GIPC3Q8TF64 MARVELD3-201ENST00000268485 2912 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
GIPC3Q8TF64 INPP5B-204ENST00000373026 3230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
GIPC3Q8TF64 SCUBE1-202ENST00000360835 9808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
GIPC3Q8TF64 FOXP3-203ENST00000376207 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
GIPC3Q8TF64 PML-203ENST00000354026 2885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
GIPC3Q8TF64 WDR45-201ENST00000322995 1444 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
GIPC3Q8TF64 ADAMTS7P1-201ENST00000613213 4793 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
GIPC3Q8TF64 MED19-201ENST00000337672 1637 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
GIPC3Q8TF64 ZFAND6-222ENST00000613266 1729 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
GIPC3Q8TF64 ZNF821-203ENST00000446827 1822 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
GIPC3Q8TF64 MON1B-203ENST00000545553 1814 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
GIPC3Q8TF64 CALR-201ENST00000316448 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
GIPC3Q8TF64 NDUFA11-202ENST00000418389 2406 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
GIPC3Q8TF64 SLC4A11-202ENST00000380059 3229 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
GIPC3Q8TF64 FHDC1-202ENST00000511601 6583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
GIPC3Q8TF64 SH3BP5L-201ENST00000366472 3861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
GIPC3Q8TF64 E2F6-211ENST00000542100 3450 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
GIPC3Q8TF64 THUMPD3-AS1-202ENST00000468186 3253 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
GIPC3Q8TF64 GORASP2-201ENST00000234160 3173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
GIPC3Q8TF64 LRRFIP1-203ENST00000308482 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
GIPC3Q8TF64 IQCE-201ENST00000325979 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
GIPC3Q8TF64 KIAA0895-207ENST00000436884 1952 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
GIPC3Q8TF64 STK33-217ENST00000534493 1895 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
GIPC3Q8TF64 LINC01660-203ENST00000618517 1859 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
GIPC3Q8TF64 DUSP13-203ENST00000372702 1778 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
GIPC3Q8TF64 AC053503.2-201ENST00000420563 1598 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
GIPC3Q8TF64 DOK5-202ENST00000395939 1453 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
GIPC3Q8TF64 AGTPBP1-208ENST00000628899 4222 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
GIPC3Q8TF64 R3HDML-201ENST00000217043 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
GIPC3Q8TF64 AKAP9-205ENST00000394564 1356 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
GIPC3Q8TF64 LIM2-201ENST00000221973 983 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
GIPC3Q8TF64 RPS2P28-201ENST00000314255 741 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
GIPC3Q8TF64 TCEAL3-203ENST00000372628 1221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
GIPC3Q8TF64 CD7-202ENST00000578509 925 ntTSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
GIPC3Q8TF64 AC002398.2-201ENST00000587767 660 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
GIPC3Q8TF64 BCL2L12-206ENST00000598306 510 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
GIPC3Q8TF64 SBK3-202ENST00000612221 1270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
GIPC3Q8TF64 ANO2-212ENST00000612575 1087 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
GIPC3Q8TF64 AC117500.6-201ENST00000624871 588 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
GIPC3Q8TF64 NTN4-201ENST00000343702 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
GIPC3Q8TF64 FAM47E-STBD1-204ENST00000515604 3029 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
GIPC3Q8TF64 ITSN1-212ENST00000399367 5722 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
GIPC3Q8TF64 SOCS5-202ENST00000394861 4058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
GIPC3Q8TF64 AL354714.1-201ENST00000356006 2136 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
GIPC3Q8TF64 PROSER3-202ENST00000396908 2149 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
GIPC3Q8TF64 COX10-AS1-202ENST00000449363 1944 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
GIPC3Q8TF64 MBLAC2-202ENST00000514906 1936 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
GIPC3Q8TF64 GPS1-227ENST00000623761 1943 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
GIPC3Q8TF64 NFATC4-213ENST00000554591 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
GIPC3Q8TF64 COL11A2-203ENST00000374708 6209 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
GIPC3Q8TF64 LGALSL-201ENST00000238875 3926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
GIPC3Q8TF64 AMT-204ENST00000427987 1646 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
GIPC3Q8TF64 AC022400.6-201ENST00000603027 5818 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
GIPC3Q8TF64 ZBTB45P2-201ENST00000452245 1531 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
GIPC3Q8TF64 GDPD2-204ENST00000536730 2171 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
GIPC3Q8TF64 SEPT9-220ENST00000588690 2919 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
GIPC3Q8TF64 FLNA-207ENST00000422373 8486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
GIPC3Q8TF64 SIGLEC9-202ENST00000440804 1960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.3 ms