Protein–RNA interactions for Protein: Q8TAT5

NEIL3, Endonuclease 8-like 3, humanhuman

Predictions only

Length 605 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEIL3Q8TAT5 CENPT-202ENST00000440851 2200 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
NEIL3Q8TAT5 SYTL3-205ENST00000611299 2896 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
NEIL3Q8TAT5 CRTC2-202ENST00000368630 1635 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
NEIL3Q8TAT5 AC004805.1-201ENST00000577662 1616 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
NEIL3Q8TAT5 ROR2-202ENST00000375715 2993 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
NEIL3Q8TAT5 SCAP-215ENST00000545718 2950 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
NEIL3Q8TAT5 SLC2A14-202ENST00000396589 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
NEIL3Q8TAT5 ARHGEF7-204ENST00000375736 5032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
NEIL3Q8TAT5 INPP5D-201ENST00000359570 5274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
NEIL3Q8TAT5 HMOX2-204ENST00000414777 1752 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
NEIL3Q8TAT5 GGT6-201ENST00000301395 2534 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
NEIL3Q8TAT5 AL591845.1-201ENST00000373137 1838 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
NEIL3Q8TAT5 CBX7-201ENST00000216133 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
NEIL3Q8TAT5 ATP2A3-204ENST00000397035 4182 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
NEIL3Q8TAT5 TDRP-205ENST00000613071 3421 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.55□□□□□ -0.08
NEIL3Q8TAT5 SARM1-208ENST00000585482 10309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
NEIL3Q8TAT5 DKFZP434H168-201ENST00000567381 1905 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
NEIL3Q8TAT5 AC009242.1-201ENST00000634300 2706 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
NEIL3Q8TAT5 SH2D6-202ENST00000389938 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
NEIL3Q8TAT5 LENG8-209ENST00000616932 2825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
NEIL3Q8TAT5 FADS1-201ENST00000350997 4525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
NEIL3Q8TAT5 CCDC182-201ENST00000299415 832 ntAPPRIS P1 BASIC14.55□□□□□ -0.08
NEIL3Q8TAT5 LRRC28-202ENST00000331450 752 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
NEIL3Q8TAT5 HRCT1-201ENST00000354323 950 ntAPPRIS P1 BASIC14.55□□□□□ -0.08
NEIL3Q8TAT5 PKIG-202ENST00000372886 1180 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
NEIL3Q8TAT5 RNF186-201ENST00000375121 1250 ntAPPRIS P1 BASIC14.55□□□□□ -0.08
NEIL3Q8TAT5 PIN1P1-201ENST00000412108 996 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
NEIL3Q8TAT5 AC139713.2-206ENST00000499587 566 ntTSL 4 BASIC14.55□□□□□ -0.08
NEIL3Q8TAT5 BRK1-201ENST00000530758 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
NEIL3Q8TAT5 CHMP4A-204ENST00000530996 967 ntTSL 3 BASIC14.55□□□□□ -0.08
NEIL3Q8TAT5 ARL6IP1-202ENST00000546206 1107 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
NEIL3Q8TAT5 AURKB-214ENST00000585124 1227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
NEIL3Q8TAT5 ELOF1-205ENST00000589171 743 ntTSL 3 BASIC14.55□□□□□ -0.08
NEIL3Q8TAT5 LINC00207-204ENST00000605505 666 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
NEIL3Q8TAT5 AC004233.3-201ENST00000607794 1269 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
NEIL3Q8TAT5 MIR6069-201ENST00000620069 79 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
NEIL3Q8TAT5 AL033527.5-202ENST00000641632 1098 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
NEIL3Q8TAT5 SYT17-201ENST00000355377 3081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
NEIL3Q8TAT5 ACP2-201ENST00000256997 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
NEIL3Q8TAT5 WNT16-201ENST00000222462 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
NEIL3Q8TAT5 MBD1-224ENST00000591416 4905 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
NEIL3Q8TAT5 ACOX3-203ENST00000503233 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
NEIL3Q8TAT5 YPEL1-201ENST00000339468 4329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
NEIL3Q8TAT5 DHODH-201ENST00000219240 2426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
NEIL3Q8TAT5 SEMA5B-201ENST00000195173 4523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
NEIL3Q8TAT5 NFATC1-207ENST00000545796 3558 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
NEIL3Q8TAT5 GPM6A-210ENST00000506894 2614 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
NEIL3Q8TAT5 EDN3-201ENST00000311585 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
NEIL3Q8TAT5 FLI1-207ENST00000534087 3859 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
NEIL3Q8TAT5 MED16-207ENST00000589119 2772 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
NEIL3Q8TAT5 KIAA0368-201ENST00000259335 7391 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
NEIL3Q8TAT5 CCDC105-201ENST00000292574 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
NEIL3Q8TAT5 CAMKK2-211ENST00000538733 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
NEIL3Q8TAT5 RNF25-201ENST00000295704 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
NEIL3Q8TAT5 SNAP47-213ENST00000617596 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
NEIL3Q8TAT5 KIAA0895-207ENST00000436884 1952 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
NEIL3Q8TAT5 FAF1-202ENST00000396153 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
NEIL3Q8TAT5 ISG20L2-202ENST00000368219 2310 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
NEIL3Q8TAT5 ZNF30-202ENST00000439785 2651 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
NEIL3Q8TAT5 TPO-203ENST00000346956 2923 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
NEIL3Q8TAT5 ARFGAP2-202ENST00000426335 2937 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
NEIL3Q8TAT5 MAP7D1-203ENST00000373150 3238 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
NEIL3Q8TAT5 MAPKAP1-201ENST00000265960 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
NEIL3Q8TAT5 GRID2IP-202ENST00000452113 3428 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
NEIL3Q8TAT5 SYCE1-202ENST00000343131 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
NEIL3Q8TAT5 LCE3E-201ENST00000368789 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
NEIL3Q8TAT5 C11orf88-202ENST00000375618 712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
NEIL3Q8TAT5 AC015922.1-201ENST00000421102 1152 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
NEIL3Q8TAT5 SPTLC1P1-201ENST00000447199 261 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
NEIL3Q8TAT5 AC245100.5-201ENST00000452108 331 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
NEIL3Q8TAT5 TMEM176B-206ENST00000492607 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
NEIL3Q8TAT5 SSBP1-214ENST00000498107 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
NEIL3Q8TAT5 AC007406.4-201ENST00000539568 765 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
NEIL3Q8TAT5 PPHLN1-221ENST00000552761 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
NEIL3Q8TAT5 COQ6-210ENST00000554920 649 ntTSL 3 BASIC14.54□□□□□ -0.08
NEIL3Q8TAT5 ZNF710-AS1-201ENST00000558334 1168 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
NEIL3Q8TAT5 AC040162.1-202ENST00000573493 573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.54□□□□□ -0.08
NEIL3Q8TAT5 RBP1-207ENST00000619087 516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
NEIL3Q8TAT5 HOTAIRM1_1.1-201ENST00000622675 125 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
NEIL3Q8TAT5 SFT2D2-204ENST00000630869 1073 ntTSL 4 BASIC14.54□□□□□ -0.08
NEIL3Q8TAT5 AC105277.1-203ENST00000635492 1293 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
NEIL3Q8TAT5 HDHD3-202ENST00000374180 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
NEIL3Q8TAT5 TNRC18-202ENST00000399434 1459 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
NEIL3Q8TAT5 DDTL-201ENST00000215770 1545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
NEIL3Q8TAT5 KLK10-202ENST00000358789 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
NEIL3Q8TAT5 IBA57-201ENST00000366711 7817 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
NEIL3Q8TAT5 TAPBPL-201ENST00000266556 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
NEIL3Q8TAT5 ALOX15B-205ENST00000573359 1809 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
NEIL3Q8TAT5 SAE1-202ENST00000392776 1851 ntTSL 3 BASIC14.54□□□□□ -0.08
NEIL3Q8TAT5 MAP2K3-202ENST00000342679 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
NEIL3Q8TAT5 DEPDC5-203ENST00000400242 2395 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
NEIL3Q8TAT5 THEMIS2-202ENST00000373921 2687 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
NEIL3Q8TAT5 RNF11-201ENST00000242719 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
NEIL3Q8TAT5 CPT2-201ENST00000371486 3094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
NEIL3Q8TAT5 ZNF365-205ENST00000395254 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
NEIL3Q8TAT5 ITSN1-205ENST00000381291 5437 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
NEIL3Q8TAT5 NEURL1-201ENST00000369780 4314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
NEIL3Q8TAT5 GPD1L-201ENST00000282541 4060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
NEIL3Q8TAT5 PATZ1-202ENST00000266269 3781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
NEIL3Q8TAT5 NBEA-203ENST00000379939 10738 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.2 ms