Protein–RNA interactions for Protein: Q2TAC2

CCDC57, Coiled-coil domain-containing protein 57, humanhuman

Predictions only

Length 916 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC57Q2TAC2 ASIC1-201ENST00000228468 4072 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
CCDC57Q2TAC2 DGKZ-202ENST00000343674 3816 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
CCDC57Q2TAC2 CCNY-202ENST00000339497 4630 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
CCDC57Q2TAC2 NCOA1-205ENST00000406961 7289 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
CCDC57Q2TAC2 FOXO3-201ENST00000343882 7308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
CCDC57Q2TAC2 LANCL3-201ENST00000378619 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
CCDC57Q2TAC2 CACNA1A-238ENST00000637276 7135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
CCDC57Q2TAC2 TNFRSF13C-201ENST00000291232 3944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
CCDC57Q2TAC2 MLKL-201ENST00000306247 1781 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
CCDC57Q2TAC2 CD34-202ENST00000356522 2874 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
CCDC57Q2TAC2 SEPT11-206ENST00000505788 2079 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
CCDC57Q2TAC2 BECN1-213ENST00000590099 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
CCDC57Q2TAC2 PDE6D-201ENST00000287600 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
CCDC57Q2TAC2 GBGT1-202ENST00000372038 847 ntTSL 3 BASIC19.17■□□□□ 0.66
CCDC57Q2TAC2 PHACTR1-202ENST00000379329 707 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
CCDC57Q2TAC2 GZMB-202ENST00000382540 816 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
CCDC57Q2TAC2 STX1A-203ENST00000395155 783 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
CCDC57Q2TAC2 DMKN-216ENST00000458071 510 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.17■□□□□ 0.66
CCDC57Q2TAC2 TMEM14B-204ENST00000461342 559 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
CCDC57Q2TAC2 GFM1-208ENST00000478576 2147 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
CCDC57Q2TAC2 AC116456.1-201ENST00000526646 815 ntTSL 3 BASIC19.17■□□□□ 0.66
CCDC57Q2TAC2 AC010641.1-201ENST00000591757 529 ntTSL 3 BASIC19.17■□□□□ 0.66
CCDC57Q2TAC2 TMEM179-205ENST00000615704 636 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
CCDC57Q2TAC2 MCF2L2-208ENST00000473233 4748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
CCDC57Q2TAC2 AAMP-201ENST00000248450 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
CCDC57Q2TAC2 LYNX1-206ENST00000621401 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
CCDC57Q2TAC2 TRIM7-201ENST00000274773 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
CCDC57Q2TAC2 SYT3-202ENST00000593901 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
CCDC57Q2TAC2 CYP2U1-201ENST00000332884 4944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
CCDC57Q2TAC2 MOB3B-201ENST00000262244 6454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
CCDC57Q2TAC2 FBN2-205ENST00000508989 4987 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
CCDC57Q2TAC2 FOXP3-202ENST00000376199 2274 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
CCDC57Q2TAC2 AC009090.5-201ENST00000624886 2285 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
CCDC57Q2TAC2 LINC00094-204ENST00000599836 1689 ntAPPRIS P5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
CCDC57Q2TAC2 SEMA4C-201ENST00000305476 3545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
CCDC57Q2TAC2 INA-201ENST00000369849 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
CCDC57Q2TAC2 PMS1-212ENST00000432292 3234 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
CCDC57Q2TAC2 PMS1-213ENST00000441310 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
CCDC57Q2TAC2 RSPO1-204ENST00000615459 2331 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
CCDC57Q2TAC2 TMEM30A-201ENST00000230461 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
CCDC57Q2TAC2 UBE3B-201ENST00000340074 1448 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
CCDC57Q2TAC2 GLUD1-201ENST00000277865 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
CCDC57Q2TAC2 SSH1-201ENST00000326470 2432 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
CCDC57Q2TAC2 RASD2-201ENST00000216127 3412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
CCDC57Q2TAC2 INPP4A-202ENST00000409016 9996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
CCDC57Q2TAC2 TOMM70-201ENST00000284320 4409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
CCDC57Q2TAC2 KLHDC3-203ENST00000332245 1494 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
CCDC57Q2TAC2 KIAA1586-203ENST00000545356 2883 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
CCDC57Q2TAC2 PPP2R1B-203ENST00000393055 1525 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
CCDC57Q2TAC2 FAM118B-210ENST00000627851 1862 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
CCDC57Q2TAC2 KHNYN-202ENST00000553935 3359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
CCDC57Q2TAC2 RUNX1-201ENST00000300305 6222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
CCDC57Q2TAC2 C11orf71-202ENST00000623205 1980 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
CCDC57Q2TAC2 PIKFYVE-202ENST00000308862 1640 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
CCDC57Q2TAC2 NEU3-206ENST00000532963 1643 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
CCDC57Q2TAC2 COQ8A-202ENST00000366778 2743 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
CCDC57Q2TAC2 AC018467.1-201ENST00000421581 717 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
CCDC57Q2TAC2 C2orf27AP3-201ENST00000434123 579 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
CCDC57Q2TAC2 LIMS3-201ENST00000437679 1220 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
CCDC57Q2TAC2 KCNQ1-AS1-201ENST00000440887 1084 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
CCDC57Q2TAC2 RMDN1-212ENST00000519966 1164 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
CCDC57Q2TAC2 AC008011.2-201ENST00000538113 792 ntTSL 3 BASIC19.16■□□□□ 0.66
CCDC57Q2TAC2 AP000812.2-201ENST00000538934 718 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
CCDC57Q2TAC2 SDR39U1-212ENST00000555365 976 ntTSL 3 BASIC19.16■□□□□ 0.66
CCDC57Q2TAC2 GNRHR2-203ENST00000581100 1187 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
CCDC57Q2TAC2 LINC01887-202ENST00000584734 860 ntTSL 3 BASIC19.16■□□□□ 0.66
CCDC57Q2TAC2 AC068473.4-201ENST00000587527 585 ntTSL 4 BASIC19.16■□□□□ 0.66
CCDC57Q2TAC2 AL354718.3-201ENST00000616414 581 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
CCDC57Q2TAC2 CR382287.1-201ENST00000623954 586 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
CCDC57Q2TAC2 SCNN1A-221ENST00000543768 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
CCDC57Q2TAC2 AC006063.2-201ENST00000640161 1696 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
CCDC57Q2TAC2 KRT2-201ENST00000309680 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
CCDC57Q2TAC2 GABRB3-215ENST00000622697 5876 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
CCDC57Q2TAC2 PTGDR2-201ENST00000332539 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
CCDC57Q2TAC2 PGBD2-201ENST00000329291 2136 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
CCDC57Q2TAC2 GOLGA6L2-201ENST00000312015 1379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
CCDC57Q2TAC2 STK40-202ENST00000373129 3846 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
CCDC57Q2TAC2 ARHGEF10-201ENST00000349830 5590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
CCDC57Q2TAC2 TPBG-201ENST00000369750 6484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
CCDC57Q2TAC2 HNF4A-202ENST00000316673 1470 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
CCDC57Q2TAC2 RAPSN-203ENST00000524487 1462 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
CCDC57Q2TAC2 CD209-207ENST00000593660 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
CCDC57Q2TAC2 DZIP1-203ENST00000361396 7418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
CCDC57Q2TAC2 LRRC56-201ENST00000270115 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
CCDC57Q2TAC2 ETV3-201ENST00000326786 1539 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
CCDC57Q2TAC2 SNAPC4-201ENST00000298532 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
CCDC57Q2TAC2 PDLIM5-202ENST00000318007 1960 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
CCDC57Q2TAC2 EIF1B-AS1-201ENST00000625390 1958 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
CCDC57Q2TAC2 NOP14-201ENST00000314262 2889 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
CCDC57Q2TAC2 PGAP2-205ENST00000396993 1566 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
CCDC57Q2TAC2 SLC22A6-203ENST00000421062 1560 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
CCDC57Q2TAC2 GRAMD2B-217ENST00000515200 3109 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
CCDC57Q2TAC2 TAPBPL-201ENST00000266556 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
CCDC57Q2TAC2 ADAMTS1-201ENST00000284984 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
CCDC57Q2TAC2 AC007405.2-202ENST00000418106 540 ntTSL 4 BASIC19.15■□□□□ 0.66
CCDC57Q2TAC2 AL450998.2-201ENST00000418525 639 ntTSL 3 BASIC19.15■□□□□ 0.66
CCDC57Q2TAC2 DHDDS-206ENST00000427245 868 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
CCDC57Q2TAC2 BNIP3P42-201ENST00000454982 569 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
CCDC57Q2TAC2 HOXC-AS3-201ENST00000509870 544 ntTSL 4 BASIC19.15■□□□□ 0.66
CCDC57Q2TAC2 AC136475.5-202ENST00000524824 587 ntTSL 4 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.2 ms