Protein–RNA interactions for Protein: Q1MSJ5

CSPP1, Centrosome and spindle pole-associated protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,256 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSPP1Q1MSJ5 AC010503.2-201ENST00000599292 296 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CSPP1Q1MSJ5 FHL2-212ENST00000607522 759 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CSPP1Q1MSJ5 SBK3-202ENST00000612221 1270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CSPP1Q1MSJ5 SERF2-217ENST00000630046 862 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CSPP1Q1MSJ5 TRIM17-205ENST00000456946 1731 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CSPP1Q1MSJ5 CFAP53-201ENST00000398545 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CSPP1Q1MSJ5 USP36-201ENST00000312010 5234 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CSPP1Q1MSJ5 TRIM45-201ENST00000256649 3515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CSPP1Q1MSJ5 ETV2-205ENST00000479824 1342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CSPP1Q1MSJ5 TNRC18-202ENST00000399434 1459 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CSPP1Q1MSJ5 ANKRD50-202ENST00000515641 4212 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CSPP1Q1MSJ5 KCNC3-202ENST00000474951 3347 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CSPP1Q1MSJ5 MCM3AP-AS1-203ENST00000421927 2280 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CSPP1Q1MSJ5 AC126365.1-201ENST00000578585 1514 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
CSPP1Q1MSJ5 AC245052.4-201ENST00000452097 4158 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CSPP1Q1MSJ5 GPR61-206ENST00000616874 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CSPP1Q1MSJ5 SNPH-202ENST00000381873 4995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CSPP1Q1MSJ5 UBR5-212ENST00000521922 9008 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CSPP1Q1MSJ5 CNOT9-208ENST00000542068 3259 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CSPP1Q1MSJ5 AC139749.1-202ENST00000617529 3139 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
CSPP1Q1MSJ5 ACTL7B-201ENST00000374667 2379 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CSPP1Q1MSJ5 CNDP1-201ENST00000358821 2215 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CSPP1Q1MSJ5 FALEC-201ENST00000416894 566 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CSPP1Q1MSJ5 C8orf46-213ENST00000521495 557 ntTSL 4 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CSPP1Q1MSJ5 IL18BP-211ENST00000531053 853 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CSPP1Q1MSJ5 AP000777.2-201ENST00000539897 501 ntTSL 4 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CSPP1Q1MSJ5 AC005225.4-201ENST00000557330 545 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
CSPP1Q1MSJ5 AC092811.2-201ENST00000632561 559 ntTSL 4 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CSPP1Q1MSJ5 TKT-202ENST00000423516 2075 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CSPP1Q1MSJ5 ITGAV-201ENST00000261023 7030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CSPP1Q1MSJ5 CAPN2-201ENST00000295006 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CSPP1Q1MSJ5 ZFY-201ENST00000155093 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CSPP1Q1MSJ5 DCAKD-201ENST00000310604 2122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CSPP1Q1MSJ5 APBB1-221ENST00000609360 2642 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CSPP1Q1MSJ5 PPHLN1-201ENST00000256678 1820 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CSPP1Q1MSJ5 LINC01250-201ENST00000457478 2344 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CSPP1Q1MSJ5 GRSF1-208ENST00000545193 2682 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CSPP1Q1MSJ5 UHRF1-204ENST00000616255 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CSPP1Q1MSJ5 STIP1-201ENST00000305218 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CSPP1Q1MSJ5 IVL-201ENST00000368764 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CSPP1Q1MSJ5 AADAT-208ENST00000515480 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CSPP1Q1MSJ5 SPN-201ENST00000360121 6894 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CSPP1Q1MSJ5 SLC35A2-204ENST00000376521 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CSPP1Q1MSJ5 MAMLD1-203ENST00000370401 4854 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CSPP1Q1MSJ5 FOXH1-201ENST00000377317 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CSPP1Q1MSJ5 RPTOR-202ENST00000544334 5734 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CSPP1Q1MSJ5 ZNF74-209ENST00000611540 3714 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CSPP1Q1MSJ5 DNM1-203ENST00000393594 3245 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CSPP1Q1MSJ5 CECR7-202ENST00000441006 2726 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CSPP1Q1MSJ5 ITSN1-210ENST00000399353 3913 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CSPP1Q1MSJ5 NISCH-202ENST00000420808 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CSPP1Q1MSJ5 MECR-201ENST00000263702 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CSPP1Q1MSJ5 SHISA5-210ENST00000444115 2081 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CSPP1Q1MSJ5 MED20-201ENST00000265350 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CSPP1Q1MSJ5 FBXO45-202ENST00000440469 3689 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CSPP1Q1MSJ5 SLC4A9-203ENST00000506545 2838 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CSPP1Q1MSJ5 SFI1-209ENST00000443011 3579 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CSPP1Q1MSJ5 HOXB4-201ENST00000332503 3757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CSPP1Q1MSJ5 MAP3K12-201ENST00000267079 4319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CSPP1Q1MSJ5 KIAA1468-202ENST00000398130 6178 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CSPP1Q1MSJ5 KLK8-202ENST00000320838 456 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CSPP1Q1MSJ5 NKX2-6-201ENST00000325017 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CSPP1Q1MSJ5 IFNL1-201ENST00000333625 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CSPP1Q1MSJ5 LCN2-203ENST00000373017 848 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CSPP1Q1MSJ5 SYNGR1-205ENST00000406293 564 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CSPP1Q1MSJ5 ZFAND2B-212ENST00000444522 1199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CSPP1Q1MSJ5 MTUS1-215ENST00000519066 567 ntTSL 4 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CSPP1Q1MSJ5 Z92544.3-201ENST00000624747 417 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
CSPP1Q1MSJ5 DSE-202ENST00000359564 4037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CSPP1Q1MSJ5 SLC4A3-202ENST00000317151 4069 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CSPP1Q1MSJ5 TAF1C-216ENST00000566732 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CSPP1Q1MSJ5 CYB561-203ENST00000392976 3151 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CSPP1Q1MSJ5 CDKN2AIP-201ENST00000302350 2646 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CSPP1Q1MSJ5 GAD2-201ENST00000259271 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CSPP1Q1MSJ5 ESR2-201ENST00000267525 1518 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CSPP1Q1MSJ5 PAK6-202ENST00000455577 4215 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CSPP1Q1MSJ5 CELF4-223ENST00000603232 1906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CSPP1Q1MSJ5 TAF5-201ENST00000369839 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CSPP1Q1MSJ5 ADD2-208ENST00000430656 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CSPP1Q1MSJ5 LINC00900-201ENST00000499809 3322 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CSPP1Q1MSJ5 AC004706.4-201ENST00000634965 3537 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CSPP1Q1MSJ5 TMA16-201ENST00000358572 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CSPP1Q1MSJ5 BLMH-201ENST00000261714 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CSPP1Q1MSJ5 MAD1L1-203ENST00000402746 2355 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CSPP1Q1MSJ5 FLII-221ENST00000578558 2377 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CSPP1Q1MSJ5 GOLGA5-201ENST00000163416 2969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CSPP1Q1MSJ5 GRB2-201ENST00000316615 3181 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CSPP1Q1MSJ5 CCDC6-201ENST00000263102 5811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CSPP1Q1MSJ5 STK40-202ENST00000373129 3846 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CSPP1Q1MSJ5 LRRFIP1P1-201ENST00000498774 2246 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
CSPP1Q1MSJ5 ACSM2A-203ENST00000417235 1835 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CSPP1Q1MSJ5 SETD7-204ENST00000506866 1602 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CSPP1Q1MSJ5 NOP14-201ENST00000314262 2889 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CSPP1Q1MSJ5 GRAP-201ENST00000284154 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CSPP1Q1MSJ5 JARID2-201ENST00000341776 5755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CSPP1Q1MSJ5 TPD52L2-202ENST00000346249 2297 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CSPP1Q1MSJ5 ARIH2-205ENST00000449376 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CSPP1Q1MSJ5 GPSM1-202ENST00000354753 3533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CSPP1Q1MSJ5 KLF5-201ENST00000377687 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CSPP1Q1MSJ5 APP-208ENST00000439274 2517 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.3 ms