Protein–RNA interactions for Protein: Q15843

NEDD8, NEDD8, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEDD8Q15843 TNFAIP8L1-202ENST00000536716 3845 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.32□□□□□ -0.12
NEDD8Q15843 DOK5-202ENST00000395939 1453 ntTSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
NEDD8Q15843 MTERF2-201ENST00000240050 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
NEDD8Q15843 PAF1-201ENST00000221265 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
NEDD8Q15843 STK4-AS1-201ENST00000434401 2065 ntTSL 2 BASIC14.32□□□□□ -0.12
NEDD8Q15843 ACVR1B-206ENST00000542485 2362 ntTSL 2 BASIC14.32□□□□□ -0.12
NEDD8Q15843 ANKRD35-201ENST00000355594 3342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.32□□□□□ -0.12
NEDD8Q15843 HM13-201ENST00000335574 1809 ntTSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
NEDD8Q15843 AGRN-201ENST00000379370 7323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
NEDD8Q15843 CC2D1B-201ENST00000284376 3377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.32□□□□□ -0.12
NEDD8Q15843 GTF2IRD1-205ENST00000476977 5868 ntTSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
NEDD8Q15843 THBS2-206ENST00000617924 5280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
NEDD8Q15843 FRMD8-201ENST00000317568 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
NEDD8Q15843 TMEM47-201ENST00000275954 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
NEDD8Q15843 HDAC9-208ENST00000417496 2524 ntTSL 2 BASIC14.32□□□□□ -0.12
NEDD8Q15843 ENDOV-206ENST00000518901 2549 ntTSL 2 BASIC14.32□□□□□ -0.12
NEDD8Q15843 GUF1-201ENST00000281543 4449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
NEDD8Q15843 MROH1-209ENST00000534366 5092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
NEDD8Q15843 IGLL1-202ENST00000330377 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
NEDD8Q15843 ANK1-206ENST00000348036 622 ntTSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
NEDD8Q15843 LGALS7-201ENST00000378626 466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
NEDD8Q15843 RBCK1-206ENST00000400247 790 ntTSL 2 BASIC14.32□□□□□ -0.12
NEDD8Q15843 PTCHD3P3-201ENST00000403073 906 ntBASIC14.32□□□□□ -0.12
NEDD8Q15843 METTL21A-205ENST00000426075 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.32□□□□□ -0.12
NEDD8Q15843 AC093459.1-201ENST00000444567 481 ntTSL 3 BASIC14.32□□□□□ -0.12
NEDD8Q15843 EEF1E1-205ENST00000507463 654 ntTSL 2 BASIC14.32□□□□□ -0.12
NEDD8Q15843 AP001453.1-201ENST00000534988 923 ntTSL 3 BASIC14.32□□□□□ -0.12
NEDD8Q15843 TMEM220-203ENST00000578345 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.32□□□□□ -0.12
NEDD8Q15843 NTF6B-201ENST00000591913 560 ntBASIC14.32□□□□□ -0.12
NEDD8Q15843 AC114341.1-201ENST00000618070 349 ntBASIC14.32□□□□□ -0.12
NEDD8Q15843 KLHL21-201ENST00000377658 4487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
NEDD8Q15843 MAEL-202ENST00000367872 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
NEDD8Q15843 CLK4-201ENST00000316308 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
NEDD8Q15843 SLC22A12-202ENST00000377567 2599 ntTSL 5 BASIC14.32□□□□□ -0.12
NEDD8Q15843 MST1P2-201ENST00000457982 2291 ntBASIC14.32□□□□□ -0.12
NEDD8Q15843 PRDM16-206ENST00000511072 4282 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.32□□□□□ -0.12
NEDD8Q15843 SMARCA2-214ENST00000450198 5602 ntTSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
NEDD8Q15843 PTHLH-203ENST00000395872 1318 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.32□□□□□ -0.12
NEDD8Q15843 MOB3C-203ENST00000371940 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
NEDD8Q15843 DHX16-202ENST00000376442 3445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
NEDD8Q15843 CSPG4-201ENST00000308508 8290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
NEDD8Q15843 AC109583.3-201ENST00000641183 3128 ntAPPRIS P1 BASIC14.32□□□□□ -0.12
NEDD8Q15843 ACSL1-201ENST00000281455 3832 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
NEDD8Q15843 AFF3-202ENST00000409236 9849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.32□□□□□ -0.12
NEDD8Q15843 ARFGAP1-212ENST00000519604 3191 ntTSL 2 BASIC14.32□□□□□ -0.12
NEDD8Q15843 DDX19B-207ENST00000563206 1765 ntTSL 5 BASIC14.32□□□□□ -0.12
NEDD8Q15843 RNPS1-223ENST00000568631 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.32□□□□□ -0.12
NEDD8Q15843 KXD1-201ENST00000222307 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
NEDD8Q15843 APBB3-201ENST00000354402 1810 ntTSL 5 BASIC14.31□□□□□ -0.12
NEDD8Q15843 ATP6V1B1-202ENST00000412314 1805 ntTSL 5 BASIC14.31□□□□□ -0.12
NEDD8Q15843 NEK11-205ENST00000507910 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
NEDD8Q15843 SCYL1-208ENST00000527009 2586 ntTSL 5 BASIC14.31□□□□□ -0.12
NEDD8Q15843 ZP3-201ENST00000336517 1483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
NEDD8Q15843 ATP6AP2-226ENST00000637526 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.31□□□□□ -0.12
NEDD8Q15843 FIG4-201ENST00000230124 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
NEDD8Q15843 CILP2-201ENST00000291495 4199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
NEDD8Q15843 COQ6-220ENST00000629426 1538 ntTSL 5 BASIC14.31□□□□□ -0.12
NEDD8Q15843 AL139398.1-201ENST00000638795 1529 ntTSL 5 BASIC14.31□□□□□ -0.12
NEDD8Q15843 FSTL4-201ENST00000265342 5419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.31□□□□□ -0.12
NEDD8Q15843 NUP54-217ENST00000514987 1563 ntTSL 2 BASIC14.31□□□□□ -0.12
NEDD8Q15843 A1CF-202ENST00000373993 1997 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
NEDD8Q15843 PPT1-213ENST00000641319 2388 ntBASIC14.31□□□□□ -0.12
NEDD8Q15843 USP48-213ENST00000529637 3228 ntTSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
NEDD8Q15843 NDUFS7-202ENST00000313408 2818 ntTSL 2 BASIC14.31□□□□□ -0.12
NEDD8Q15843 ZCCHC7-209ENST00000534928 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
NEDD8Q15843 PPP2R5C-204ENST00000422945 4481 ntTSL 2 BASIC14.31□□□□□ -0.12
NEDD8Q15843 DISC1-222ENST00000622252 6927 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.31□□□□□ -0.12
NEDD8Q15843 OR10H2-201ENST00000305899 1041 ntAPPRIS P1 BASIC14.31□□□□□ -0.12
NEDD8Q15843 GJC3-201ENST00000312891 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
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NEDD8Q15843 RPL36-202ENST00000394580 556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
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NEDD8Q15843 ULK4P3-205ENST00000568486 1158 ntTSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
NEDD8Q15843 AC004771.4-201ENST00000576752 474 ntTSL 5 BASIC14.31□□□□□ -0.12
NEDD8Q15843 AC087741.1-203ENST00000576824 820 ntTSL 3 BASIC14.31□□□□□ -0.12
NEDD8Q15843 HIST1H2AK-201ENST00000618958 393 ntAPPRIS P1 BASIC14.31□□□□□ -0.12
NEDD8Q15843 OR4C6-202ENST00000641251 1058 ntAPPRIS P1 BASIC14.31□□□□□ -0.12
NEDD8Q15843 MLST8-201ENST00000301724 1735 ntTSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
NEDD8Q15843 BEX4-202ENST00000372695 1328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
NEDD8Q15843 TADA2B-204ENST00000512388 1343 ntTSL 5 BASIC14.31□□□□□ -0.12
NEDD8Q15843 WNT7A-201ENST00000285018 4041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
NEDD8Q15843 HMGA2-204ENST00000403681 4473 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
NEDD8Q15843 CAP2-202ENST00000378990 1812 ntTSL 2 BASIC14.31□□□□□ -0.12
NEDD8Q15843 AMT-202ENST00000395338 1831 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
NEDD8Q15843 ACP5-203ENST00000433365 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
NEDD8Q15843 ABHD14B-204ENST00000461108 1397 ntTSL 2 BASIC14.31□□□□□ -0.12
NEDD8Q15843 WASH3P-207ENST00000560956 1394 ntBASIC14.31□□□□□ -0.12
NEDD8Q15843 AC233702.3-201ENST00000578656 1387 ntBASIC14.31□□□□□ -0.12
NEDD8Q15843 FO538757.1-201ENST00000623083 1397 ntBASIC14.31□□□□□ -0.12
NEDD8Q15843 SNPH-201ENST00000381867 5533 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
NEDD8Q15843 PGLYRP2-201ENST00000292609 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
NEDD8Q15843 GRN-201ENST00000053867 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
NEDD8Q15843 DNAJA1-201ENST00000330899 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
NEDD8Q15843 RBM14-202ENST00000393979 1426 ntTSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
NEDD8Q15843 GDAP1L1-206ENST00000537864 2855 ntTSL 2 BASIC14.31□□□□□ -0.12
NEDD8Q15843 ACTL6A-202ENST00000429709 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
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