Protein–RNA interactions for Protein: Q15834

CCDC85B, Coiled-coil domain-containing protein 85B, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 202 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC85BQ15834 RNPS1-203ENST00000397086 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CCDC85BQ15834 TSHZ1-204ENST00000580243 3582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CCDC85BQ15834 NR6A1-205ENST00000487099 7031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CCDC85BQ15834 RB1CC1-202ENST00000435644 6614 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CCDC85BQ15834 NUS1-201ENST00000368494 4676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CCDC85BQ15834 VPS51-201ENST00000279281 2714 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CCDC85BQ15834 CPT2-208ENST00000636891 2746 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CCDC85BQ15834 CPT2-210ENST00000637252 2739 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CCDC85BQ15834 LRRFIP2-209ENST00000440230 1989 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CCDC85BQ15834 KCNMA1-251ENST00000639090 4319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CCDC85BQ15834 SARAF-201ENST00000256255 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CCDC85BQ15834 C2orf48-201ENST00000381786 1897 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CCDC85BQ15834 RBM33-205ENST00000392759 1580 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CCDC85BQ15834 HMGN3-201ENST00000275036 831 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CCDC85BQ15834 ATP5H-201ENST00000301587 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CCDC85BQ15834 KCNG3-201ENST00000306078 3824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CCDC85BQ15834 CALCA-201ENST00000331587 843 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CCDC85BQ15834 HMGN3-202ENST00000344726 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CCDC85BQ15834 PSMB5-202ENST00000361611 1294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CCDC85BQ15834 C1orf43-205ENST00000368519 1163 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CCDC85BQ15834 AL627389.1-201ENST00000413508 1182 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
CCDC85BQ15834 IDI2-AS1-201ENST00000420381 672 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CCDC85BQ15834 AL590617.2-201ENST00000432673 917 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CCDC85BQ15834 AL139246.4-201ENST00000442305 514 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CCDC85BQ15834 AC128709.1-201ENST00000445908 600 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CCDC85BQ15834 PPOX-204ENST00000462866 473 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CCDC85BQ15834 RAMP3-202ENST00000481345 559 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CCDC85BQ15834 AC021723.1-201ENST00000486306 515 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
CCDC85BQ15834 RBM4B-202ENST00000524637 867 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CCDC85BQ15834 AC025048.1-201ENST00000592317 542 ntTSL 4 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CCDC85BQ15834 AC025181.2-201ENST00000606994 802 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
CCDC85BQ15834 BX539320.1-201ENST00000623759 877 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
CCDC85BQ15834 RPL35-206ENST00000629845 340 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CCDC85BQ15834 PRRC2B-210ENST00000638390 1084 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CCDC85BQ15834 ATXN2-219ENST00000550104 4648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CCDC85BQ15834 CKMT2-202ENST00000424301 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CCDC85BQ15834 HLA-DQB1-205ENST00000434651 1642 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CCDC85BQ15834 EPHX2-202ENST00000517536 1600 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CCDC85BQ15834 OLIG2-201ENST00000333337 3262 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CCDC85BQ15834 FAM32A-201ENST00000263384 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CCDC85BQ15834 AL163636.2-201ENST00000553909 1498 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CCDC85BQ15834 SLC9A7-205ENST00000616978 10024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CCDC85BQ15834 TLE2-219ENST00000591529 2483 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CCDC85BQ15834 PEX6-202ENST00000304611 3478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CCDC85BQ15834 MIB2-219ENST00000505820 3305 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CCDC85BQ15834 YKT6-201ENST00000223369 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CCDC85BQ15834 ARAP2-201ENST00000303965 7514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CCDC85BQ15834 MUS81-215ENST00000533035 2180 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CCDC85BQ15834 KIAA1586-203ENST00000545356 2883 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CCDC85BQ15834 SRPX-201ENST00000378533 1874 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
CCDC85BQ15834 MOGS-205ENST00000452063 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
CCDC85BQ15834 SH3PXD2B-203ENST00000519643 1394 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CCDC85BQ15834 BFSP1-205ENST00000536626 2075 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CCDC85BQ15834 PSMG3-AS1-201ENST00000437621 5701 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CCDC85BQ15834 PDE2A-226ENST00000544570 3119 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CCDC85BQ15834 CACNA1G-205ENST00000360761 7497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CCDC85BQ15834 DIRAS2-201ENST00000375765 4386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CCDC85BQ15834 MAGI1-202ENST00000402939 4389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CCDC85BQ15834 HPSE-206ENST00000512196 1571 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CCDC85BQ15834 ZDHHC9-202ENST00000371064 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CCDC85BQ15834 AL096870.2-201ENST00000565988 2108 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CCDC85BQ15834 HNRNPR-204ENST00000427764 1788 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CCDC85BQ15834 TGFBR2-202ENST00000359013 4605 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CCDC85BQ15834 PAPD5-202ENST00000436909 4635 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CCDC85BQ15834 ZNF133-212ENST00000622607 2660 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CCDC85BQ15834 CHTOP-203ENST00000368690 2165 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CCDC85BQ15834 SYCN-201ENST00000318438 573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CCDC85BQ15834 CMTM5-203ENST00000359320 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CCDC85BQ15834 CITED1-202ENST00000373619 886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CCDC85BQ15834 VGLL4-214ENST00000451674 938 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CCDC85BQ15834 PGAP2-208ENST00000464229 863 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CCDC85BQ15834 ZNF720-210ENST00000534369 791 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CCDC85BQ15834 PPY2P-201ENST00000582808 702 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
CCDC85BQ15834 PPY2P-202ENST00000583761 657 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CCDC85BQ15834 AC012044.1-201ENST00000603431 297 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
CCDC85BQ15834 AP001043.1-205ENST00000623098 1033 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CCDC85BQ15834 CYP2AB1P-202ENST00000454440 1456 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
CCDC85BQ15834 SLC22A3-201ENST00000275300 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CCDC85BQ15834 COL5A1-208ENST00000618395 8437 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CCDC85BQ15834 GLG1-201ENST00000205061 8261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CCDC85BQ15834 SYVN1-201ENST00000294256 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CCDC85BQ15834 DCLK2-204ENST00000506325 2298 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CCDC85BQ15834 LRRFIP1-201ENST00000244815 4370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CCDC85BQ15834 ZNF274-202ENST00000345813 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CCDC85BQ15834 AFMID-201ENST00000327898 1700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CCDC85BQ15834 SLC38A6-202ENST00000354886 1730 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CCDC85BQ15834 PACSIN2-205ENST00000407585 3080 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CCDC85BQ15834 ELMSAN1-202ENST00000394071 7721 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CCDC85BQ15834 SEMA7A-201ENST00000261918 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CCDC85BQ15834 ST8SIA5-201ENST00000315087 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CCDC85BQ15834 PPP1CA-201ENST00000312989 1389 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CCDC85BQ15834 SHOX-202ENST00000381575 1351 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CCDC85BQ15834 PPP1CB-202ENST00000358506 4771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CCDC85BQ15834 WIF1-201ENST00000286574 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CCDC85BQ15834 AL158154.2-201ENST00000585776 2208 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CCDC85BQ15834 MARCO-201ENST00000327097 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CCDC85BQ15834 GABARAP-201ENST00000302386 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CCDC85BQ15834 SLC30A2-202ENST00000374278 3097 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CCDC85BQ15834 TBX4-201ENST00000240335 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CCDC85BQ15834 TMEM237-202ENST00000409444 5592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.2 ms