Protein–RNA interactions for Protein: Q13790

APOF, Apolipoprotein F, humanhuman

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Length 326 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOFQ13790 HNRNPDP1-201ENST00000439535 754 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
APOFQ13790 TMEM205-202ENST00000447337 916 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
APOFQ13790 AC080013.1-203ENST00000468242 720 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
APOFQ13790 BMF-207ENST00000559701 630 ntTSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.09
APOFQ13790 MIR4751-201ENST00000578027 74 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
APOFQ13790 PPP1R1B-208ENST00000580825 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
APOFQ13790 AC022150.1-201ENST00000599222 640 ntTSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.09
APOFQ13790 PLAUR-214ENST00000601723 1205 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
APOFQ13790 WNT3A-201ENST00000284523 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
APOFQ13790 LINC01782-201ENST00000591212 2908 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
APOFQ13790 DLX4-201ENST00000240306 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
APOFQ13790 PCDHGB8P-201ENST00000502926 1973 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
APOFQ13790 AC113189.2-201ENST00000575310 1975 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
APOFQ13790 ACTL6A-202ENST00000429709 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
APOFQ13790 FANCG-201ENST00000378643 2631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
APOFQ13790 STRN3-201ENST00000355683 3970 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
APOFQ13790 MAPT-204ENST00000344290 6816 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
APOFQ13790 AP001627.1-201ENST00000437426 1754 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
APOFQ13790 VIPR1-202ENST00000433647 3161 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
APOFQ13790 PHTF1-203ENST00000369600 3075 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
APOFQ13790 SYT12-203ENST00000525457 1678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
APOFQ13790 OPA1-208ENST00000392438 6340 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
APOFQ13790 HGNC:18790-202ENST00000421177 4172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
APOFQ13790 SRD5A2-201ENST00000622030 4648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
APOFQ13790 MROH1-201ENST00000326134 5183 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
APOFQ13790 TDP2-201ENST00000341060 2120 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
APOFQ13790 PDE4A-209ENST00000592685 2707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
APOFQ13790 USP19-205ENST00000398898 4474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
APOFQ13790 NPM2-209ENST00000521157 1484 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
APOFQ13790 EHF-210ENST00000531794 1481 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
APOFQ13790 RCAN3-207ENST00000538532 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
APOFQ13790 SEMA3G-201ENST00000231721 4899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
APOFQ13790 CXorf40B-205ENST00000462691 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
APOFQ13790 AC015802.1-201ENST00000588104 1449 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
APOFQ13790 SYCP2L-201ENST00000283141 3130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
APOFQ13790 APAF1-203ENST00000359972 7029 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
APOFQ13790 PDPK1-201ENST00000268673 4728 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
APOFQ13790 BAIAP2-201ENST00000321280 1939 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
APOFQ13790 ZNF517-202ENST00000525105 1383 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
APOFQ13790 HERPUD1-201ENST00000300302 1862 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
APOFQ13790 SYAP1-201ENST00000380155 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
APOFQ13790 TSPAN4-208ENST00000409531 1339 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
APOFQ13790 AL161772.1-201ENST00000610494 4412 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
APOFQ13790 PHLDA1-203ENST00000619060 5913 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
APOFQ13790 PIH1D1-201ENST00000262265 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
APOFQ13790 NFU1-201ENST00000303698 1034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
APOFQ13790 PTPMT1-201ENST00000326656 928 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
APOFQ13790 SMIM29-201ENST00000335352 1160 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
APOFQ13790 ZNF593-202ENST00000374266 675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
APOFQ13790 SUMO1-201ENST00000392244 831 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
APOFQ13790 SMAGP-202ENST00000398453 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
APOFQ13790 KRTCAP3-202ENST00000407293 942 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
APOFQ13790 SUMO1-209ENST00000409712 761 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
APOFQ13790 LINC02247-201ENST00000417135 743 ntTSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
APOFQ13790 AL645939.2-201ENST00000427340 991 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
APOFQ13790 FAM197Y8-203ENST00000450145 560 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
APOFQ13790 SDHD-206ENST00000528182 754 ntTSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
APOFQ13790 TOLLIP-AS1-201ENST00000530897 939 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
APOFQ13790 TRMT112-202ENST00000535126 704 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
APOFQ13790 ORAOV1-210ENST00000539414 817 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
APOFQ13790 OVCA2-201ENST00000572195 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
APOFQ13790 NAA60-217ENST00000572942 1089 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
APOFQ13790 AC012615.5-201ENST00000592720 581 ntTSL 4 BASIC14.51□□□□□ -0.09
APOFQ13790 SSBP1-215ENST00000612337 884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
APOFQ13790 AC012313.10-201ENST00000623509 926 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
APOFQ13790 TP73-AS1-207ENST00000624167 988 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
APOFQ13790 ADRA1A-202ENST00000354550 1765 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
APOFQ13790 FUT8-213ENST00000557164 2269 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
APOFQ13790 MLST8-201ENST00000301724 1735 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
APOFQ13790 SELENOV-201ENST00000335426 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
APOFQ13790 SELENOV-205ENST00000622070 1704 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
APOFQ13790 PLAU-202ENST00000446342 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
APOFQ13790 TMEM184B-202ENST00000361906 3611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
APOFQ13790 PNPLA5-204ENST00000593866 2197 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
APOFQ13790 MAPKAP1-204ENST00000373498 3131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
APOFQ13790 SHISA5-210ENST00000444115 2081 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
APOFQ13790 ANKRD20A5P-207ENST00000581935 2089 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
APOFQ13790 SF1-201ENST00000227503 2850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
APOFQ13790 PML-203ENST00000354026 2885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
APOFQ13790 RPS6KB1-203ENST00000406116 1982 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
APOFQ13790 AC134407.2-201ENST00000625089 1978 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
APOFQ13790 NQO2-201ENST00000338130 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
APOFQ13790 ITSN1-205ENST00000381291 5437 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
APOFQ13790 ACVR1B-206ENST00000542485 2362 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
APOFQ13790 PBXIP1-202ENST00000368463 3212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
APOFQ13790 CCDC186-202ENST00000369286 1928 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
APOFQ13790 CAP2-209ENST00000616440 2776 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
APOFQ13790 IBA57-201ENST00000366711 7817 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
APOFQ13790 SC5D-202ENST00000392789 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
APOFQ13790 AL512306.2-201ENST00000444037 2219 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
APOFQ13790 TIMP3-201ENST00000266085 4603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
APOFQ13790 SEMA4B-201ENST00000332496 3781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
APOFQ13790 WASH3P-207ENST00000560956 1394 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
APOFQ13790 FO538757.1-201ENST00000623083 1397 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
APOFQ13790 KDM3A-201ENST00000312912 4886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
APOFQ13790 B3GNT4-202ENST00000535274 2938 ntAPPRIS P1 BASIC14.5□□□□□ -0.09
APOFQ13790 NEDD4L-205ENST00000400345 3647 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
APOFQ13790 NUTM2HP-201ENST00000442076 2498 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
APOFQ13790 NFATC4-204ENST00000424781 5488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
APOFQ13790 CYP4F3-202ENST00000585846 2056 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
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