Protein–RNA interactions for Protein: Q13634

CDH18, Cadherin-18, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDH18Q13634 AP001360.1-202ENST00000526934 479 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CDH18Q13634 NAALADL1-208ENST00000528884 973 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CDH18Q13634 AP006621.2-201ENST00000533938 284 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CDH18Q13634 PUDP-206ENST00000540122 825 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CDH18Q13634 ENPP7P5-201ENST00000541031 1031 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
CDH18Q13634 ABBA01031660.1-201ENST00000635219 756 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
CDH18Q13634 SLC2A13-202ENST00000380858 3082 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CDH18Q13634 POC1B-202ENST00000393179 3096 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CDH18Q13634 POLL-217ENST00000628479 1953 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CDH18Q13634 TAP2-201ENST00000374897 5684 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CDH18Q13634 SPOCK2-202ENST00000373109 5445 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CDH18Q13634 AMZ1-201ENST00000312371 5516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CDH18Q13634 TRPM2-AS-202ENST00000456880 2056 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CDH18Q13634 STK17A-201ENST00000319357 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CDH18Q13634 IPPK-201ENST00000287996 4401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
CDH18Q13634 LINC00391-201ENST00000433569 1844 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
CDH18Q13634 MLPH-204ENST00000410032 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.14
CDH18Q13634 CLUH-202ENST00000570628 5244 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.14
CDH18Q13634 PMS1-212ENST00000432292 3234 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.14
CDH18Q13634 HARS2-206ENST00000508522 1562 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.14
CDH18Q13634 DFNA5-202ENST00000409775 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CDH18Q13634 EGLN2-207ENST00000593726 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CDH18Q13634 LINC01502-201ENST00000445997 2471 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CDH18Q13634 RPN1-207ENST00000497289 2137 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CDH18Q13634 ACP2-201ENST00000256997 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CDH18Q13634 HERPUD1-201ENST00000300302 1862 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CDH18Q13634 CLEC18A-203ENST00000449317 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CDH18Q13634 ATP2C1-224ENST00000533801 3690 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CDH18Q13634 RSRP1-202ENST00000431849 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CDH18Q13634 RUNX1-202ENST00000344691 7274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CDH18Q13634 CUX1-211ENST00000546411 4212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CDH18Q13634 LOX-206ENST00000639739 1626 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CDH18Q13634 SLC35C2-202ENST00000317734 2175 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CDH18Q13634 DLGAP1-220ENST00000581699 2258 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CDH18Q13634 APOA1-201ENST00000236850 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CDH18Q13634 APOA1-205ENST00000375329 927 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CDH18Q13634 TMEM14DP-201ENST00000422205 345 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
CDH18Q13634 AL391069.3-201ENST00000455503 618 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CDH18Q13634 GPR53P-205ENST00000457298 1084 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
CDH18Q13634 MDH2-205ENST00000461263 648 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CDH18Q13634 TMEM14B-212ENST00000475942 992 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CDH18Q13634 MTX3-202ENST00000512528 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CDH18Q13634 EEF1AKMT3-204ENST00000551420 836 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CDH18Q13634 LINC00928-204ENST00000561201 1123 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CDH18Q13634 RPL36-203ENST00000577222 874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CDH18Q13634 PPP1R14A-203ENST00000587515 607 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CDH18Q13634 ELOF1-206ENST00000590700 585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CDH18Q13634 AC107373.2-201ENST00000607735 490 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
CDH18Q13634 APOBEC3H-206ENST00000613677 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CDH18Q13634 TRIM7-201ENST00000274773 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CDH18Q13634 RBPMS-204ENST00000397323 2941 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CDH18Q13634 VPS26A-201ENST00000263559 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CDH18Q13634 ZNF7-218ENST00000544249 2125 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CDH18Q13634 TBC1D26-206ENST00000579428 1583 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CDH18Q13634 RNF31-201ENST00000324103 3627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CDH18Q13634 ATP6AP2-217ENST00000636580 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CDH18Q13634 BNIP2-201ENST00000267859 6325 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CDH18Q13634 CGGBP1-201ENST00000309534 4495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CDH18Q13634 HHIP-202ENST00000434550 1770 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CDH18Q13634 CTSD-207ENST00000636571 1790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CDH18Q13634 SLC37A4-217ENST00000545985 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CDH18Q13634 ADCY2-201ENST00000338316 6575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CDH18Q13634 CHD4-210ENST00000544040 6514 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CDH18Q13634 DRD5P1-201ENST00000456605 1438 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
CDH18Q13634 SCYL1-206ENST00000525364 2584 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CDH18Q13634 DENND1A-202ENST00000373620 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CDH18Q13634 SIX6-201ENST00000327720 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CDH18Q13634 AQP3-201ENST00000297991 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CDH18Q13634 AL445931.1-201ENST00000412181 2112 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CDH18Q13634 TPD52L2-203ENST00000348257 2237 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CDH18Q13634 CCT6A-201ENST00000275603 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CDH18Q13634 MAP3K1-201ENST00000399503 7011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CDH18Q13634 CTPS2-201ENST00000359276 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CDH18Q13634 ALG5-201ENST00000239891 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CDH18Q13634 IL32-202ENST00000325568 1105 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CDH18Q13634 PRKN-203ENST00000366894 1157 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CDH18Q13634 CD164L2-203ENST00000374030 993 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CDH18Q13634 VCX3B-202ENST00000381032 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CDH18Q13634 IL32-203ENST00000382213 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CDH18Q13634 SUN1-204ENST00000403868 978 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CDH18Q13634 AC105940.2-201ENST00000421055 380 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CDH18Q13634 U91328.1-201ENST00000437528 223 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
CDH18Q13634 FKBP11-203ENST00000453172 959 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CDH18Q13634 AC026410.3-201ENST00000514280 936 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
CDH18Q13634 C17orf62-239ENST00000585080 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CDH18Q13634 TBCB-211ENST00000589996 724 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CDH18Q13634 RAB11B-202ENST00000594216 894 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CDH18Q13634 SMCO4-206ENST00000596676 180 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CDH18Q13634 AC011497.1-201ENST00000596781 561 ntTSL 4 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CDH18Q13634 STYXL1-203ENST00000359697 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CDH18Q13634 BECN1-213ENST00000590099 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CDH18Q13634 ZDHHC13-201ENST00000399351 2283 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CDH18Q13634 DHX40-202ENST00000425628 2255 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CDH18Q13634 AQP10-203ENST00000484864 2262 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CDH18Q13634 KSR1-216ENST00000582410 2392 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CDH18Q13634 YTHDF3-212ENST00000621413 2370 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CDH18Q13634 RCC2-202ENST00000375436 4087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CDH18Q13634 RCL1-204ENST00000381750 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CDH18Q13634 NME7-201ENST00000367811 1642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CDH18Q13634 BCS1L-203ENST00000392110 1525 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
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