Protein–RNA interactions for Protein: Q13619

CUL4A, Cullin-4A, humanhuman

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Length 759 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CUL4AQ13619 ZNF576-206ENST00000533118 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CUL4AQ13619 LINC01413-201ENST00000564843 772 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CUL4AQ13619 AP001059.3-201ENST00000619053 235 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
CUL4AQ13619 HOTTIP_1.1-201ENST00000620415 57 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
CUL4AQ13619 PCSK6-221ENST00000632686 1210 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CUL4AQ13619 MBNL1-201ENST00000282486 6422 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CUL4AQ13619 SLC8A3-203ENST00000357887 5259 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CUL4AQ13619 MSC-AS1-208ENST00000522519 1537 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CUL4AQ13619 RAD51D-218ENST00000590016 1528 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CUL4AQ13619 B3GNTL1-211ENST00000576599 1787 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CUL4AQ13619 SLC29A1-204ENST00000371731 2258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CUL4AQ13619 TMEM230-202ENST00000342308 1562 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CUL4AQ13619 NEO1-207ENST00000560262 4315 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CUL4AQ13619 RAB33B-201ENST00000305626 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CUL4AQ13619 EIF3J-AS1-201ENST00000313807 2863 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CUL4AQ13619 TSSK3-201ENST00000373534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CUL4AQ13619 CTSB-219ENST00000530640 1389 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CUL4AQ13619 MVB12B-206ENST00000489637 2666 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CUL4AQ13619 PTPRU-201ENST00000345512 4470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CUL4AQ13619 AC113367.3-201ENST00000508316 1912 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
CUL4AQ13619 TIA1-206ENST00000445587 1440 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CUL4AQ13619 ABCB7-202ENST00000339447 2234 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CUL4AQ13619 MAGI3-201ENST00000307546 6430 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CUL4AQ13619 YME1L1-202ENST00000375972 2517 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CUL4AQ13619 TPD52L2-202ENST00000346249 2297 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CUL4AQ13619 PLPPR4-203ENST00000457765 4846 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CUL4AQ13619 F8-201ENST00000330287 2620 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CUL4AQ13619 DXO-203ENST00000375356 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CUL4AQ13619 MPI-203ENST00000535694 1523 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CUL4AQ13619 RAB37-206ENST00000392615 2655 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CUL4AQ13619 EFNA4-201ENST00000359751 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CUL4AQ13619 HFE-208ENST00000397022 1280 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CUL4AQ13619 SYS1-203ENST00000414310 795 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CUL4AQ13619 PLAC9P1-202ENST00000433290 400 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CUL4AQ13619 PFN2-205ENST00000461868 613 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CUL4AQ13619 HFE-214ENST00000488199 781 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CUL4AQ13619 SATB1-217ENST00000493952 626 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CUL4AQ13619 GTF2H2C-210ENST00000510979 2952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CUL4AQ13619 TPT1-AS1-219ENST00000523506 574 ntTSL 4 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CUL4AQ13619 TRMT112-203ENST00000535750 823 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CUL4AQ13619 PXN-AS1-202ENST00000538804 508 ntTSL 4 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CUL4AQ13619 GTF2IRD2-205ENST00000614386 578 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CUL4AQ13619 PCDHA1-203ENST00000504120 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CUL4AQ13619 GABRB3-215ENST00000622697 5876 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CUL4AQ13619 KATNBL1-201ENST00000256544 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CUL4AQ13619 CECR7-202ENST00000441006 2726 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CUL4AQ13619 RNF122-201ENST00000256257 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CUL4AQ13619 EML1-201ENST00000262233 4535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CUL4AQ13619 MAPK7-203ENST00000395602 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CUL4AQ13619 ZNF683-201ENST00000349618 1610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CUL4AQ13619 PDGFRL-201ENST00000251630 1901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CUL4AQ13619 TRIP10-208ENST00000596758 1920 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CUL4AQ13619 CYP2U1-201ENST00000332884 4944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CUL4AQ13619 ARHGEF26-AS1-204ENST00000491862 2598 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CUL4AQ13619 FAM46A-201ENST00000320172 5609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CUL4AQ13619 COL4A2-201ENST00000360467 6281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CUL4AQ13619 TLCD2-201ENST00000330676 5971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CUL4AQ13619 SF1-209ENST00000433274 2317 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CUL4AQ13619 MAN2A2-216ENST00000559717 6704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CUL4AQ13619 POLR2E-211ENST00000612655 1749 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CUL4AQ13619 AHSA1-201ENST00000216479 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CUL4AQ13619 SIGLEC5-201ENST00000534261 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CUL4AQ13619 C15orf52-206ENST00000559313 3022 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CUL4AQ13619 ANKRD44-203ENST00000409153 2724 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.5
CUL4AQ13619 AP001627.1-201ENST00000437426 1754 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
CUL4AQ13619 ALDOA-228ENST00000627059 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.5
CUL4AQ13619 CACNA1A-201ENST00000360228 8627 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
CUL4AQ13619 SH2D3C-206ENST00000429553 2794 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
CUL4AQ13619 HDHD3-202ENST00000374180 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
CUL4AQ13619 CYP2AB1P-202ENST00000454440 1456 ntBASIC18.14■□□□□ 0.5
CUL4AQ13619 TBC1D9B-201ENST00000355235 5119 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.5
CUL4AQ13619 HDHD3-201ENST00000238379 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
CUL4AQ13619 TGFB1I1-202ENST00000394858 1803 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
CUL4AQ13619 VAC14-202ENST00000536184 2161 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CUL4AQ13619 ACP5-202ENST00000412435 1527 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CUL4AQ13619 ASXL1-212ENST00000620121 5374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CUL4AQ13619 SPOCK3-201ENST00000357154 2986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CUL4AQ13619 IQCA1L-203ENST00000615129 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CUL4AQ13619 MAGED2-201ENST00000218439 1958 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CUL4AQ13619 SH3RF1-201ENST00000284637 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CUL4AQ13619 PAM16-201ENST00000318059 587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CUL4AQ13619 MUC1-204ENST00000343256 648 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CUL4AQ13619 RBM3-202ENST00000376755 1130 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CUL4AQ13619 AL022342.1-201ENST00000400363 863 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
CUL4AQ13619 RPL37AP1-201ENST00000412502 279 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
CUL4AQ13619 AL513327.2-201ENST00000432703 490 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CUL4AQ13619 LINC01089-211ENST00000543334 1282 ntTSL 4 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CUL4AQ13619 AP005233.2-201ENST00000561588 372 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CUL4AQ13619 AC004835.2-201ENST00000603762 682 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
CUL4AQ13619 LINC01115-203ENST00000606068 577 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
CUL4AQ13619 AL589739.1-201ENST00000607720 493 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
CUL4AQ13619 XRCC1-201ENST00000262887 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CUL4AQ13619 BCL10-201ENST00000370580 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CUL4AQ13619 FERMT3-201ENST00000279227 2489 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CUL4AQ13619 FERMT3-202ENST00000345728 2481 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CUL4AQ13619 ANKRD46-205ENST00000520311 3270 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CUL4AQ13619 GTF2IRD1-203ENST00000455841 3315 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CUL4AQ13619 GOLGA6L17P-202ENST00000614358 1398 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
CUL4AQ13619 PHF12-205ENST00000577226 7679 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CUL4AQ13619 SPEG-205ENST00000396698 3379 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
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