Protein–RNA interactions for Protein: Q12834

CDC20, Cell division cycle protein 20 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 499 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDC20Q12834 KCNK7-201ENST00000340313 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
CDC20Q12834 FAM86MP-201ENST00000340703 885 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
CDC20Q12834 NCR1-203ENST00000350790 739 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
CDC20Q12834 FAM104B-202ENST00000358460 1179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
CDC20Q12834 LDLRAD1-201ENST00000371360 785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
CDC20Q12834 TEN1-201ENST00000397640 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
CDC20Q12834 BNIP3P42-201ENST00000454982 569 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
CDC20Q12834 FXR1-221ENST00000491674 365 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
CDC20Q12834 PKD2-202ENST00000502363 1222 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
CDC20Q12834 AC026774.1-201ENST00000503652 691 ntTSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
CDC20Q12834 FLJ27354-203ENST00000526694 851 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
CDC20Q12834 AC138028.3-201ENST00000561699 213 ntTSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
CDC20Q12834 AC036164.1-201ENST00000570544 333 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
CDC20Q12834 LINC00237-203ENST00000593272 630 ntTSL 4 BASIC14.94□□□□□ -0.02
CDC20Q12834 KXD1-204ENST00000595073 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
CDC20Q12834 AC008758.5-201ENST00000595562 617 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.94□□□□□ -0.02
CDC20Q12834 BTNL10-201ENST00000595971 695 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
CDC20Q12834 BNIP3P29-201ENST00000598302 571 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
CDC20Q12834 AC011447.5-201ENST00000616168 564 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
CDC20Q12834 PFAS-212ENST00000625942 396 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
CDC20Q12834 CABP1-204ENST00000453000 1857 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
CDC20Q12834 KLF4-201ENST00000374672 2813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
CDC20Q12834 RPS23-201ENST00000296674 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
CDC20Q12834 EVC2-202ENST00000344408 4390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
CDC20Q12834 REPIN1-209ENST00000479668 3182 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
CDC20Q12834 NR4A3-202ENST00000338488 2588 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
CDC20Q12834 AK4-207ENST00000545314 6887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
CDC20Q12834 COG5-203ENST00000393603 5418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
CDC20Q12834 PKD2L2-205ENST00000508638 2333 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
CDC20Q12834 REPIN1-201ENST00000397281 3292 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
CDC20Q12834 SLC4A3-201ENST00000273063 4246 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
CDC20Q12834 TTC29-202ENST00000398886 1729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
CDC20Q12834 AL136982.4-201ENST00000437689 1740 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
CDC20Q12834 CPEB2-201ENST00000259997 5612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
CDC20Q12834 TUBBP5-201ENST00000290377 1563 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
CDC20Q12834 TBC1D25-201ENST00000376771 4042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
CDC20Q12834 ACTL7B-201ENST00000374667 2379 ntAPPRIS P1 BASIC14.93□□□□□ -0.02
CDC20Q12834 BEX4-202ENST00000372695 1328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
CDC20Q12834 COMP-201ENST00000222271 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
CDC20Q12834 ZNF385A-205ENST00000546970 2494 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
CDC20Q12834 PELI2-201ENST00000267460 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
CDC20Q12834 STEAP3-204ENST00000409811 2103 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
CDC20Q12834 RIF1-204ENST00000430328 7992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
CDC20Q12834 PRKD2-216ENST00000601806 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
CDC20Q12834 C14orf93-202ENST00000341470 2221 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
CDC20Q12834 AC010491.1-201ENST00000563101 2797 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
CDC20Q12834 PTHLH-209ENST00000545234 1544 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
CDC20Q12834 AL596087.1-201ENST00000400979 1969 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
CDC20Q12834 MRS2-202ENST00000378353 1740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
CDC20Q12834 PDE6D-201ENST00000287600 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
CDC20Q12834 ANKRD19P-201ENST00000338192 862 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
CDC20Q12834 NUDT1-205ENST00000397048 783 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
CDC20Q12834 SGK2-207ENST00000426287 1182 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
CDC20Q12834 KDM4A-AS1-204ENST00000439057 686 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
CDC20Q12834 C19orf24-202ENST00000469144 668 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
CDC20Q12834 USP32P1-208ENST00000506594 1164 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
CDC20Q12834 AC009720.1-201ENST00000511867 586 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
CDC20Q12834 TROAP-207ENST00000548311 623 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
CDC20Q12834 XRCC3-210ENST00000554974 575 ntTSL 4 BASIC14.93□□□□□ -0.02
CDC20Q12834 AC010491.1-203ENST00000564167 638 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
CDC20Q12834 AC079336.2-201ENST00000578408 927 ntTSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
CDC20Q12834 C19orf53-206ENST00000593274 491 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
CDC20Q12834 HBP1-201ENST00000222574 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
CDC20Q12834 UBE2I-201ENST00000325437 2832 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
CDC20Q12834 LTK-204ENST00000561619 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
CDC20Q12834 WSB2-202ENST00000441406 1353 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
CDC20Q12834 PPP1R3E-201ENST00000452015 4773 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
CDC20Q12834 AC118344.1-201ENST00000378432 1462 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
CDC20Q12834 RHOXF1P3-203ENST00000640298 2668 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
CDC20Q12834 TNFRSF14-AS1-201ENST00000416860 3522 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
CDC20Q12834 TRIM46-211ENST00000611379 3082 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
CDC20Q12834 LRRC58-201ENST00000295628 7903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
CDC20Q12834 H2AFY-202ENST00000312469 1859 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
CDC20Q12834 STAT1-202ENST00000392322 2716 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
CDC20Q12834 CCDC40-201ENST00000269318 1970 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
CDC20Q12834 POMP-201ENST00000380842 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
CDC20Q12834 ACOX3-202ENST00000413009 2374 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
CDC20Q12834 GAD2-201ENST00000259271 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
CDC20Q12834 CD81-201ENST00000263645 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
CDC20Q12834 LHFPL2-207ENST00000515007 4680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
CDC20Q12834 RAB29-201ENST00000235932 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
CDC20Q12834 CT62-201ENST00000449977 1825 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
CDC20Q12834 MUC1-228ENST00000620103 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
CDC20Q12834 SERAC1-201ENST00000367101 1907 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
CDC20Q12834 PTPN20-203ENST00000374342 1929 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
CDC20Q12834 CLIC6-202ENST00000360731 3860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
CDC20Q12834 MED20-201ENST00000265350 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
CDC20Q12834 COL4A1-204ENST00000543140 2547 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
CDC20Q12834 CLIP4-201ENST00000320081 4293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
CDC20Q12834 ADAM23-201ENST00000264377 6330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
CDC20Q12834 CRHR2-208ENST00000506074 3109 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
CDC20Q12834 SLC40A1-201ENST00000261024 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
CDC20Q12834 FGF6-201ENST00000228837 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
CDC20Q12834 TFF2-201ENST00000291526 737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
CDC20Q12834 VAMP4-202ENST00000367740 1193 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
CDC20Q12834 S100A16-201ENST00000368703 946 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.92□□□□□ -0.02
CDC20Q12834 LRCOL1-201ENST00000376608 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
CDC20Q12834 DSCR3-202ENST00000398998 988 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
CDC20Q12834 ATP5J-205ENST00000400094 589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
CDC20Q12834 PRAP1-201ENST00000433452 971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.3 ms