Protein–RNA interactions for Protein: Q05952

TNP2, Nuclear transition protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 138 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNP2Q05952 ALDH3A1-205ENST00000444455 1771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
TNP2Q05952 DIMT1-201ENST00000199320 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
TNP2Q05952 CTSW-201ENST00000307886 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
TNP2Q05952 POMP-201ENST00000380842 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
TNP2Q05952 PRPS2-203ENST00000398491 1348 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
TNP2Q05952 PPP6R1-201ENST00000412770 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
TNP2Q05952 ITM2C-201ENST00000326407 1888 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
TNP2Q05952 NFATC4-231ENST00000557451 5613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
TNP2Q05952 SNX9-201ENST00000392185 4198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
TNP2Q05952 TMPRSS13-203ENST00000524993 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
TNP2Q05952 FOLH1-201ENST00000256999 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
TNP2Q05952 NDUFS2-202ENST00000392179 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
TNP2Q05952 KRT15-201ENST00000254043 5237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
TNP2Q05952 CCNC-209ENST00000520371 2186 ntTSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
TNP2Q05952 RECK-201ENST00000377966 4888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
TNP2Q05952 PDE12-202ENST00000487257 3040 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
TNP2Q05952 RAB29-201ENST00000235932 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
TNP2Q05952 MRS2-202ENST00000378353 1740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
TNP2Q05952 OXCT1-AS1-201ENST00000508458 1731 ntTSL 3 BASIC10.59□□□□□ -0.71
TNP2Q05952 ZNF451-203ENST00000370706 5268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
TNP2Q05952 CT62-201ENST00000449977 1825 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
TNP2Q05952 NUTM2F-201ENST00000253262 2561 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
TNP2Q05952 CYP11A1-201ENST00000268053 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
TNP2Q05952 SERAC1-201ENST00000367101 1907 ntTSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
TNP2Q05952 AC139530.2-201ENST00000571730 1922 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.59□□□□□ -0.71
TNP2Q05952 TFF2-201ENST00000291526 737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
TNP2Q05952 NUDT1-205ENST00000397048 783 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
TNP2Q05952 MYO16-AS2-201ENST00000412809 436 ntTSL 3 BASIC10.59□□□□□ -0.71
TNP2Q05952 AL161638.1-201ENST00000420354 481 ntTSL 3 BASIC10.59□□□□□ -0.71
TNP2Q05952 SFTPC-202ENST00000437090 773 ntTSL 3 BASIC10.59□□□□□ -0.71
TNP2Q05952 KDM4A-AS1-204ENST00000439057 686 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
TNP2Q05952 RAB28P2-201ENST00000454299 641 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
TNP2Q05952 AP000345.1-201ENST00000454863 569 ntTSL 4 BASIC10.59□□□□□ -0.71
TNP2Q05952 MACROD2-AS1-202ENST00000455291 663 ntTSL 2 BASIC10.59□□□□□ -0.71
TNP2Q05952 RN7SL399P-201ENST00000471648 279 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
TNP2Q05952 FXR1-221ENST00000491674 365 ntTSL 2 BASIC10.59□□□□□ -0.71
TNP2Q05952 USP32P1-208ENST00000506594 1164 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
TNP2Q05952 AC093730.1-201ENST00000508825 448 ntTSL 3 BASIC10.59□□□□□ -0.71
TNP2Q05952 CD44-AS1-201ENST00000528869 587 ntTSL 4 BASIC10.59□□□□□ -0.71
TNP2Q05952 USB1-203ENST00000539737 1212 ntTSL 2 BASIC10.59□□□□□ -0.71
TNP2Q05952 AC116158.2-201ENST00000559544 553 ntTSL 4 BASIC10.59□□□□□ -0.71
TNP2Q05952 AC020978.5-201ENST00000564147 533 ntTSL 4 BASIC10.59□□□□□ -0.71
TNP2Q05952 AC010491.1-203ENST00000564167 638 ntTSL 2 BASIC10.59□□□□□ -0.71
TNP2Q05952 AC007611.1-201ENST00000568150 826 ntTSL 2 BASIC10.59□□□□□ -0.71
TNP2Q05952 ANKS3-227ENST00000592711 580 ntTSL 4 BASIC10.59□□□□□ -0.71
TNP2Q05952 KXD1-204ENST00000595073 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
TNP2Q05952 AC146944.4-201ENST00000602697 718 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
TNP2Q05952 LINC01115-203ENST00000606068 577 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
TNP2Q05952 AC016911.1-201ENST00000613297 452 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
TNP2Q05952 NRXN1-223ENST00000625891 1164 ntTSL 4 BASIC10.59□□□□□ -0.71
TNP2Q05952 PFAS-212ENST00000625942 396 ntTSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
TNP2Q05952 MIOS-202ENST00000405785 3095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
TNP2Q05952 HDHD2-201ENST00000300605 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
TNP2Q05952 BCAS4-201ENST00000358791 1378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
TNP2Q05952 CALM3-212ENST00000599839 1355 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
TNP2Q05952 SLC37A4-217ENST00000545985 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
TNP2Q05952 CPSF4-201ENST00000292476 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
TNP2Q05952 TCP1-203ENST00000420894 1671 ntTSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
TNP2Q05952 RFC5-204ENST00000454402 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
TNP2Q05952 AL138694.1-201ENST00000637731 1689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
TNP2Q05952 FBXO21-201ENST00000330622 2906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
TNP2Q05952 MAP4K4-205ENST00000350878 7640 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
TNP2Q05952 NAT9-210ENST00000580301 1860 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
TNP2Q05952 U82695.1-201ENST00000635752 1889 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
TNP2Q05952 DUSP18-206ENST00000407308 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
TNP2Q05952 ACSM2B-211ENST00000567001 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
TNP2Q05952 LFNG-207ENST00000614382 1969 ntTSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
TNP2Q05952 IQSEC2-202ENST00000396435 6015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
TNP2Q05952 CCDC43-202ENST00000457422 2058 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
TNP2Q05952 VEGFA-205ENST00000372067 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
TNP2Q05952 LCK-201ENST00000333070 2166 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
TNP2Q05952 TMC3-AS1-203ENST00000559781 2195 ntTSL 3 BASIC10.59□□□□□ -0.71
TNP2Q05952 SENP1-204ENST00000549518 2260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
TNP2Q05952 ALPPL2-201ENST00000295453 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
TNP2Q05952 RAB11FIP5-205ENST00000486777 6120 ntTSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
TNP2Q05952 BEX4-202ENST00000372695 1328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.71
TNP2Q05952 SAMD4A-208ENST00000555192 1337 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.71
TNP2Q05952 IGHA1-202ENST00000641837 1310 ntAPPRIS P5 BASIC10.58□□□□□ -0.71
TNP2Q05952 AHSA1-201ENST00000216479 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
TNP2Q05952 TCEA2-203ENST00000361317 1427 ntTSL 2 BASIC10.58□□□□□ -0.72
TNP2Q05952 GLIPR2-205ENST00000619700 1645 ntTSL 3 BASIC10.58□□□□□ -0.72
TNP2Q05952 LINC01185-202ENST00000452343 1705 ntTSL 2 BASIC10.58□□□□□ -0.72
TNP2Q05952 C16orf89-203ENST00000474471 1829 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
TNP2Q05952 MUC1-228ENST00000620103 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
TNP2Q05952 NFATC2-206ENST00000609943 5690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
TNP2Q05952 KLHDC3-202ENST00000326974 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
TNP2Q05952 PLPPR2-201ENST00000251473 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
TNP2Q05952 GALNT6-201ENST00000356317 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
TNP2Q05952 ELOVL7-205ENST00000508821 3994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
TNP2Q05952 PPP2R2B-206ENST00000453001 2569 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
TNP2Q05952 ELK1-203ENST00000376983 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
TNP2Q05952 PACRGL-202ENST00000360916 2073 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
TNP2Q05952 HAPLN3-201ENST00000359595 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
TNP2Q05952 TMUB2-209ENST00000587989 1969 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC10.58□□□□□ -0.72
TNP2Q05952 HMGA1-204ENST00000401473 1887 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
TNP2Q05952 PDE4DIP-230ENST00000530472 1690 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
TNP2Q05952 KRT8-215ENST00000552150 1687 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
TNP2Q05952 IL3RA-202ENST00000381469 1476 ntTSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
TNP2Q05952 AC020915.1-201ENST00000413518 1469 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.58□□□□□ -0.72
TNP2Q05952 NEO1-206ENST00000558964 4441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.9 ms