Protein–RNA interactions for Protein: Q05586

GRIN1, Glutamate receptor ionotropic, NMDA 1, humanhuman

Predictions only

Length 938 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIN1Q05586 AC092910.3-201ENST00000484076 969 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
GRIN1Q05586 IGHV3OR16-13-201ENST00000562905 353 ntAPPRIS P1 BASIC17.6■□□□□ 0.41
GRIN1Q05586 AC005498.2-205ENST00000593218 784 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
GRIN1Q05586 AC025181.2-201ENST00000606994 802 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
GRIN1Q05586 SELENOH-206ENST00000622257 1291 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
GRIN1Q05586 TBCD-202ENST00000539345 3975 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
GRIN1Q05586 ATP6V0E1-203ENST00000519374 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
GRIN1Q05586 ASAH1-221ENST00000636128 1608 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
GRIN1Q05586 IFT52-201ENST00000373030 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
GRIN1Q05586 TPRX1-201ENST00000322175 1924 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
GRIN1Q05586 MCM7-202ENST00000343023 1968 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
GRIN1Q05586 REC8-209ENST00000611366 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
GRIN1Q05586 UBE2D3-207ENST00000394801 2368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
GRIN1Q05586 BTBD11-204ENST00000420571 3478 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
GRIN1Q05586 TOR4A-201ENST00000357503 4148 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
GRIN1Q05586 CNOT9-208ENST00000542068 3259 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
GRIN1Q05586 GRAMD2B-201ENST00000285689 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
GRIN1Q05586 CDK16-202ENST00000357227 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
GRIN1Q05586 ACHE-202ENST00000302913 2956 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
GRIN1Q05586 AKAP1-201ENST00000314126 2380 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
GRIN1Q05586 CALD1-222ENST00000495522 2199 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
GRIN1Q05586 UCK1-203ENST00000372211 2114 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
GRIN1Q05586 AZGP1-202ENST00000411734 2027 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
GRIN1Q05586 CNN3-207ENST00000545882 1902 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
GRIN1Q05586 MAGEA9-201ENST00000243314 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
GRIN1Q05586 CAMK2D-207ENST00000505990 1802 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
GRIN1Q05586 ADAMTS16-201ENST00000274181 4979 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
GRIN1Q05586 ZBTB7C-221ENST00000590800 4947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
GRIN1Q05586 SNHG22-201ENST00000589499 1615 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
GRIN1Q05586 NFIC-201ENST00000341919 1573 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
GRIN1Q05586 PLIN3-202ENST00000585479 1535 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
GRIN1Q05586 LRRC47-201ENST00000378251 4310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
GRIN1Q05586 ACTL9-201ENST00000324436 1426 ntAPPRIS P1 BASIC17.59■□□□□ 0.41
GRIN1Q05586 CBWD2-204ENST00000433343 1411 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
GRIN1Q05586 NCAPH2-202ENST00000395698 1388 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
GRIN1Q05586 AL133267.1-201ENST00000398220 340 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
GRIN1Q05586 METTL6-204ENST00000450816 1221 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
GRIN1Q05586 AC092183.1-201ENST00000469884 875 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
GRIN1Q05586 FAU-205ENST00000527548 538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
GRIN1Q05586 TMEM63A-209ENST00000537914 1018 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
GRIN1Q05586 PPHLN1-221ENST00000552761 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
GRIN1Q05586 OIP5-AS1-209ENST00000561226 775 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
GRIN1Q05586 ACYP2-209ENST00000607452 831 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
GRIN1Q05586 AL391069.4-201ENST00000609583 481 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
GRIN1Q05586 PPP1R21-201ENST00000281394 3137 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
GRIN1Q05586 PITPNB-202ENST00000335272 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
GRIN1Q05586 LENG8-209ENST00000616932 2825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
GRIN1Q05586 KANK2-207ENST00000589894 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
GRIN1Q05586 ERG28-201ENST00000256319 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
GRIN1Q05586 FECH-202ENST00000382873 2526 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
GRIN1Q05586 LINC00926-201ENST00000501726 2530 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
GRIN1Q05586 TOM1L2-202ENST00000379504 2418 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
GRIN1Q05586 SLC9A7P1-202ENST00000556476 2239 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
GRIN1Q05586 PIP5K1A-202ENST00000368888 2134 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
GRIN1Q05586 PMP22-201ENST00000312280 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
GRIN1Q05586 PEX11B-201ENST00000369306 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
GRIN1Q05586 ZNF563-201ENST00000293725 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
GRIN1Q05586 GRAP-201ENST00000284154 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
GRIN1Q05586 CNOT8-201ENST00000285896 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
GRIN1Q05586 COBL-201ENST00000265136 5291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
GRIN1Q05586 LMF1-AS1-202ENST00000569574 1408 ntTSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.41
GRIN1Q05586 ARVCF-201ENST00000263207 4041 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
GRIN1Q05586 DNAH14-204ENST00000366849 2215 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
GRIN1Q05586 TM4SF19-201ENST00000273695 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
GRIN1Q05586 TM4SF4-201ENST00000305354 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
GRIN1Q05586 CIDEA-201ENST00000320477 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
GRIN1Q05586 POLR3GL-202ENST00000369314 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
GRIN1Q05586 YWHAZ-204ENST00000395953 994 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
GRIN1Q05586 CLTA-203ENST00000396603 1090 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
GRIN1Q05586 NUDT1-205ENST00000397048 783 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
GRIN1Q05586 FAM8A3P-201ENST00000427218 844 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
GRIN1Q05586 AC108134.3-202ENST00000571404 1207 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
GRIN1Q05586 TBCB-211ENST00000589996 724 ntTSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
GRIN1Q05586 SWI5-206ENST00000608796 906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
GRIN1Q05586 EBAG9-209ENST00000614147 1179 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
GRIN1Q05586 CLN3-246ENST00000636228 1224 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
GRIN1Q05586 PDIA4-201ENST00000286091 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
GRIN1Q05586 PIGT-246ENST00000639499 2021 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
GRIN1Q05586 RALGDS-202ENST00000372050 3634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
GRIN1Q05586 TAOK2-202ENST00000308893 5169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
GRIN1Q05586 NUMBL-201ENST00000252891 3561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
GRIN1Q05586 TGFB1-201ENST00000221930 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
GRIN1Q05586 E2F6-211ENST00000542100 3450 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
GRIN1Q05586 IL1RN-203ENST00000361779 1922 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
GRIN1Q05586 C6orf120-201ENST00000332290 2667 ntAPPRIS P1 BASIC17.58■□□□□ 0.4
GRIN1Q05586 MVB12B-206ENST00000489637 2666 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
GRIN1Q05586 TTC22-202ENST00000371276 3345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
GRIN1Q05586 LRCH1-202ENST00000389797 3314 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
GRIN1Q05586 PIP5K1C-202ENST00000537021 3326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
GRIN1Q05586 ITGB2-207ENST00000397854 2592 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
GRIN1Q05586 UCHL5-206ENST00000367455 5327 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
GRIN1Q05586 PPP3CB-201ENST00000342558 2418 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
GRIN1Q05586 ZNF385A-201ENST00000338010 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
GRIN1Q05586 NF2-209ENST00000403999 2999 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
GRIN1Q05586 CLN3-201ENST00000333496 1608 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
GRIN1Q05586 MBD1-209ENST00000398495 2178 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
GRIN1Q05586 SEC24D-202ENST00000419654 2786 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
GRIN1Q05586 ABI3-201ENST00000225941 2109 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
GRIN1Q05586 ACIN1-205ENST00000457657 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
GRIN1Q05586 WDR61-201ENST00000267973 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.8 ms