Protein–RNA interactions for Protein: P78314

SH3BP2, SH3 domain-binding protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 561 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP2P78314 AC025183.2-201ENST00000503386 428 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SH3BP2P78314 SPDYE18-201ENST00000510091 1050 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
SH3BP2P78314 LEPROTL1-204ENST00000518192 847 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SH3BP2P78314 AC007406.4-201ENST00000539568 765 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SH3BP2P78314 RIC8B-209ENST00000549643 571 ntTSL 4 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SH3BP2P78314 AC027307.3-201ENST00000594262 1100 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
SH3BP2P78314 FAM66A-202ENST00000602658 546 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SH3BP2P78314 AL450472.2-201ENST00000603663 1156 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
SH3BP2P78314 AC004790.1-201ENST00000612686 536 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
SH3BP2P78314 CREB3L2-208ENST00000620715 1053 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SH3BP2P78314 CICP24-201ENST00000605464 2705 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
SH3BP2P78314 GCLM-201ENST00000370238 4857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SH3BP2P78314 KRT8P44-201ENST00000441609 1350 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
SH3BP2P78314 UBAP1L-201ENST00000502113 1381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SH3BP2P78314 OTUB1-206ENST00000535715 1391 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SH3BP2P78314 UPF3B-202ENST00000345865 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SH3BP2P78314 TEN1-CDK3-202ENST00000569284 3287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SH3BP2P78314 SLC52A3-201ENST00000217254 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SH3BP2P78314 TSC2-202ENST00000350773 5532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SH3BP2P78314 AC004922.1-201ENST00000638617 2430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SH3BP2P78314 CD300A-205ENST00000577511 1459 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SH3BP2P78314 KCNMA1-219ENST00000480683 2963 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SH3BP2P78314 MOXD1-202ENST00000367963 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SH3BP2P78314 ZSCAN10-209ENST00000576985 2739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SH3BP2P78314 DUOX1-202ENST00000389037 5483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SH3BP2P78314 SIGLEC11-202ENST00000426971 2479 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SH3BP2P78314 DBH-AS1-201ENST00000425189 2139 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SH3BP2P78314 CPEB1-211ENST00000615198 2112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SH3BP2P78314 MYRIP-202ENST00000396217 4877 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SH3BP2P78314 PDE8B-202ENST00000333194 2572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SH3BP2P78314 SIDT1-202ENST00000393830 2572 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SH3BP2P78314 KRT8P37-201ENST00000451609 1420 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
SH3BP2P78314 NAXD-202ENST00000424185 2311 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SH3BP2P78314 ADARB1-202ENST00000360697 6604 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SH3BP2P78314 COL17A1-202ENST00000369733 5488 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SH3BP2P78314 PPP3CB-201ENST00000342558 2418 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SH3BP2P78314 SLC25A33-201ENST00000302692 3854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SH3BP2P78314 POR-201ENST00000394893 2532 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SH3BP2P78314 GFAP-225ENST00000638281 2099 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SH3BP2P78314 TRIM46-209ENST00000543729 1703 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SH3BP2P78314 CALCB-202ENST00000523376 2258 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SH3BP2P78314 NMU-201ENST00000264218 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SH3BP2P78314 CIDEA-201ENST00000320477 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SH3BP2P78314 SPDYE17-201ENST00000412399 783 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
SH3BP2P78314 AL033519.3-201ENST00000450618 595 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SH3BP2P78314 PHKG1P2-201ENST00000457537 863 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
SH3BP2P78314 AC100810.1-201ENST00000518822 978 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SH3BP2P78314 SPSB2-204ENST00000523102 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SH3BP2P78314 SPSB2-205ENST00000524270 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SH3BP2P78314 RAB35-202ENST00000534951 939 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SH3BP2P78314 NUBP2-208ENST00000565987 1049 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SH3BP2P78314 VAT1-205ENST00000587173 1174 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SH3BP2P78314 ZNF226-211ENST00000588742 447 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SH3BP2P78314 Metazoa_SRP.112-201ENST00000613101 279 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
SH3BP2P78314 DBI-211ENST00000627093 554 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SH3BP2P78314 PDLIM3-213ENST00000629667 1016 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SH3BP2P78314 AL033527.5-202ENST00000641632 1098 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
SH3BP2P78314 UHRF2-201ENST00000276893 3452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SH3BP2P78314 CALR-201ENST00000316448 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SH3BP2P78314 SLC26A5-202ENST00000339444 2474 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SH3BP2P78314 LEKR1-209ENST00000491763 1940 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SH3BP2P78314 STRA6-218ENST00000574278 2455 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SH3BP2P78314 AEN-201ENST00000332810 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SH3BP2P78314 TNFSF13-202ENST00000349228 2036 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SH3BP2P78314 BAG1-210ENST00000634734 3786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SH3BP2P78314 HDHD3-202ENST00000374180 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SH3BP2P78314 PACSIN2-204ENST00000403744 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SH3BP2P78314 SEMA3B-212ENST00000616701 2958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SH3BP2P78314 ZNF385A-201ENST00000338010 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SH3BP2P78314 GSN-215ENST00000545652 2428 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SH3BP2P78314 PTBP1-204ENST00000394601 3185 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SH3BP2P78314 HMOX2-204ENST00000414777 1752 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SH3BP2P78314 DHFR-201ENST00000439211 3917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SH3BP2P78314 NPAS2-201ENST00000335681 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SH3BP2P78314 CUX1-211ENST00000546411 4212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SH3BP2P78314 SLC22A16-202ENST00000368919 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SH3BP2P78314 CPSF7-202ENST00000394888 3650 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SH3BP2P78314 BUD13-201ENST00000260210 2196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SH3BP2P78314 SERPINE2-202ENST00000409304 2161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SH3BP2P78314 SHANK1-204ENST00000391814 6622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SH3BP2P78314 PARN-202ENST00000420015 2360 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SH3BP2P78314 ROBO3-201ENST00000397801 4569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SH3BP2P78314 PTGES3-202ENST00000414274 1547 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SH3BP2P78314 ROBO3-220ENST00000538940 4551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SH3BP2P78314 DZIP1-204ENST00000376829 3738 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SH3BP2P78314 CDH20-203ENST00000538374 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SH3BP2P78314 PCCB-204ENST00000462637 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SH3BP2P78314 RSPH6A-202ENST00000597055 2306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SH3BP2P78314 ELMO3-202ENST00000393997 2531 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SH3BP2P78314 UBAP1-201ENST00000297661 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SH3BP2P78314 RER1-203ENST00000378513 3000 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SH3BP2P78314 PKIG-202ENST00000372886 1180 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SH3BP2P78314 CUTA-202ENST00000374496 762 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SH3BP2P78314 GRAP-202ENST00000395635 834 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SH3BP2P78314 SELENOM-201ENST00000400299 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SH3BP2P78314 AL136988.1-201ENST00000414640 1029 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SH3BP2P78314 PABPN1L-202ENST00000419291 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SH3BP2P78314 STMN1-204ENST00000426559 948 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SH3BP2P78314 RPSAP31-202ENST00000445165 716 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SH3BP2P78314 GAPDHP21-201ENST00000450301 1010 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56 ms