Protein–RNA interactions for Protein: P61550

ERVS71-1, Endogenous retrovirus group S71 member 1 Env polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 626 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVS71-1P61550 DDX55-203ENST00000421670 1574 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
ERVS71-1P61550 POLG2-201ENST00000539111 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
ERVS71-1P61550 NID1-201ENST00000264187 5864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
ERVS71-1P61550 DOK3-203ENST00000377112 1884 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
ERVS71-1P61550 KIAA0368-201ENST00000259335 7391 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
ERVS71-1P61550 SLC35C2-202ENST00000317734 2175 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
ERVS71-1P61550 CACFD1-207ENST00000542192 2754 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
ERVS71-1P61550 URAHP-202ENST00000409873 1349 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
ERVS71-1P61550 CLN8-205ENST00000520991 1305 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
ERVS71-1P61550 MAPT-215ENST00000574436 1326 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
ERVS71-1P61550 DAGLA-201ENST00000257215 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
ERVS71-1P61550 LINC02551-202ENST00000533812 2203 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
ERVS71-1P61550 BCAR3-201ENST00000260502 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
ERVS71-1P61550 ING1-203ENST00000375774 2870 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
ERVS71-1P61550 APLP1-202ENST00000537454 2266 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
ERVS71-1P61550 QRICH1-202ENST00000395443 3549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
ERVS71-1P61550 TRAPPC8-210ENST00000582513 3205 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
ERVS71-1P61550 RIMS1-216ENST00000521978 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
ERVS71-1P61550 LINC02495-201ENST00000508601 4167 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
ERVS71-1P61550 MFN2-203ENST00000444836 4531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
ERVS71-1P61550 ZNF382-202ENST00000423582 2657 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
ERVS71-1P61550 OXA1L-203ENST00000412791 1440 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
ERVS71-1P61550 BORCS8-MEF2B-203ENST00000514819 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
ERVS71-1P61550 AC141586.1-201ENST00000399702 2748 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
ERVS71-1P61550 SHANK2-204ENST00000409530 2123 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
ERVS71-1P61550 IER5-201ENST00000367577 4188 ntAPPRIS P1 BASIC13.55□□□□□ -0.24
ERVS71-1P61550 AP000704.1-201ENST00000637940 2182 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
ERVS71-1P61550 CDR2L-201ENST00000337231 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
ERVS71-1P61550 HSP90B1-201ENST00000299767 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
ERVS71-1P61550 NFATC4-213ENST00000554591 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
ERVS71-1P61550 TUBA3E-201ENST00000312988 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
ERVS71-1P61550 TM6SF2-201ENST00000389363 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
ERVS71-1P61550 CDPF1-204ENST00000404744 1541 ntTSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
ERVS71-1P61550 AC067930.6-201ENST00000623257 4947 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
ERVS71-1P61550 FOXRED2-204ENST00000397224 4967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
ERVS71-1P61550 CHRNG-202ENST00000389494 2262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
ERVS71-1P61550 TAOK3-201ENST00000392533 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
ERVS71-1P61550 PGAP2-205ENST00000396993 1566 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
ERVS71-1P61550 DKFZP434H168-201ENST00000567381 1905 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
ERVS71-1P61550 MYH11-211ENST00000576790 6272 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
ERVS71-1P61550 RSRP1-202ENST00000431849 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
ERVS71-1P61550 TUBB3-206ENST00000554444 1978 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
ERVS71-1P61550 PTPRF-201ENST00000359947 7727 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
ERVS71-1P61550 EPHX2-202ENST00000517536 1600 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
ERVS71-1P61550 FOSL2-201ENST00000264716 6708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
ERVS71-1P61550 CMA1-201ENST00000206446 633 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
ERVS71-1P61550 CCL25-201ENST00000253451 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
ERVS71-1P61550 NUDT1-205ENST00000397048 783 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
ERVS71-1P61550 TMEM210-201ENST00000413619 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
ERVS71-1P61550 GOLGA6L11P-201ENST00000417252 1298 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
ERVS71-1P61550 AC015922.1-201ENST00000421102 1152 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
ERVS71-1P61550 C8orf88-201ENST00000517562 894 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
ERVS71-1P61550 LMO7-AS1-202ENST00000568735 467 ntTSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
ERVS71-1P61550 ZNF226-211ENST00000588742 447 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
ERVS71-1P61550 YTHDF3-AS1-201ENST00000603538 718 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
ERVS71-1P61550 AC004233.3-201ENST00000607794 1269 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
ERVS71-1P61550 AC131235.3-202ENST00000608135 362 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
ERVS71-1P61550 MALAT1-213ENST00000618227 593 ntTSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
ERVS71-1P61550 AC010507.1-202ENST00000633286 381 ntTSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
ERVS71-1P61550 SBF1-201ENST00000348911 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
ERVS71-1P61550 ACSL3-201ENST00000357430 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
ERVS71-1P61550 ABCB9-216ENST00000542678 6051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
ERVS71-1P61550 KIFC3-205ENST00000540079 2781 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
ERVS71-1P61550 TFPI2-201ENST00000222543 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
ERVS71-1P61550 METTL25-201ENST00000248306 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
ERVS71-1P61550 RPS28-203ENST00000600659 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
ERVS71-1P61550 CYP51A1-201ENST00000003100 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
ERVS71-1P61550 MAP7D1-203ENST00000373150 3238 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
ERVS71-1P61550 RABGAP1L-201ENST00000251507 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
ERVS71-1P61550 TNIP1-217ENST00000523200 1743 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
ERVS71-1P61550 CHL1-202ENST00000397491 5235 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
ERVS71-1P61550 ATP2A2-204ENST00000539276 4094 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
ERVS71-1P61550 AP003397.1-201ENST00000525706 1387 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
ERVS71-1P61550 TMEM150A-203ENST00000409668 1776 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
ERVS71-1P61550 ELOF1-203ENST00000586683 2154 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
ERVS71-1P61550 AC127383.1-201ENST00000444697 1800 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
ERVS71-1P61550 ATG10-202ENST00000355178 1438 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
ERVS71-1P61550 ARHGEF5-201ENST00000056217 5544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
ERVS71-1P61550 ACSS2-202ENST00000360596 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
ERVS71-1P61550 FOLH1-202ENST00000340334 2697 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
ERVS71-1P61550 PIK3R6-203ENST00000614407 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
ERVS71-1P61550 STEAP3-202ENST00000393107 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
ERVS71-1P61550 STAT1-202ENST00000392322 2716 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
ERVS71-1P61550 TAP2-205ENST00000620123 5676 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
ERVS71-1P61550 CPA1-201ENST00000011292 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
ERVS71-1P61550 LAT-202ENST00000360872 1459 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
ERVS71-1P61550 HGNC:18790-211ENST00000621129 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
ERVS71-1P61550 MAPK13-203ENST00000373766 6196 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
ERVS71-1P61550 HPCAL1-202ENST00000381765 1904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
ERVS71-1P61550 DEPDC5-203ENST00000400242 2395 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
ERVS71-1P61550 C21orf33-202ENST00000348499 1506 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
ERVS71-1P61550 SGSH-203ENST00000570923 1546 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
ERVS71-1P61550 GSK3B-201ENST00000264235 7711 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
ERVS71-1P61550 SPN-201ENST00000360121 6894 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
ERVS71-1P61550 HSPH1-201ENST00000320027 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
ERVS71-1P61550 ITFG1-201ENST00000320640 3400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
ERVS71-1P61550 ACHE-202ENST00000302913 2956 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
ERVS71-1P61550 ARMC5-204ENST00000538189 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
ERVS71-1P61550 DDB1-201ENST00000301764 4506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
ERVS71-1P61550 TMEM30A-201ENST00000230461 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.2 ms