Protein–RNA interactions for Protein: P50548

ERF, ETS domain-containing transcription factor ERF, humanhuman

Predictions only

Length 548 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERFP50548 RPL15-201ENST00000307839 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ERFP50548 CUX2-201ENST00000261726 6844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ERFP50548 INPP5J-204ENST00000402238 1564 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
ERFP50548 NCALD-217ENST00000521599 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ERFP50548 WAC-AS1-202ENST00000528337 2608 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ERFP50548 GPS1-227ENST00000623761 1943 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
ERFP50548 WASHC2A-203ENST00000351071 4642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ERFP50548 EHD4-201ENST00000220325 6416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ERFP50548 SYBU-207ENST00000433638 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
ERFP50548 ATP12A-201ENST00000218548 3732 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ERFP50548 ELFN2-201ENST00000402918 8361 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.15■□□□□ 0.02
ERFP50548 POLN-210ENST00000511885 3253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
ERFP50548 NDRG4-217ENST00000562999 2931 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
ERFP50548 RPS9-207ENST00000441429 1600 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ERFP50548 BOLA2B-201ENST00000305321 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ERFP50548 BOLA2-201ENST00000330978 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ERFP50548 C1QC-202ENST00000374639 1183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
ERFP50548 ADARB2-201ENST00000381305 703 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
ERFP50548 KRTAP5-11-201ENST00000398530 1021 ntAPPRIS P2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
ERFP50548 GNB1L-203ENST00000405009 1076 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ERFP50548 POM121L3P-201ENST00000419331 1163 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
ERFP50548 AL162431.1-201ENST00000434447 543 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
ERFP50548 PLCD1-204ENST00000463876 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
ERFP50548 FOSL1P1-201ENST00000511041 816 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
ERFP50548 PTHLH-207ENST00000539239 890 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
ERFP50548 AHSA1-208ENST00000555517 832 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
ERFP50548 CYB561-216ENST00000582297 897 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
ERFP50548 CHMP2A-208ENST00000601220 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ERFP50548 AL591684.3-201ENST00000605187 298 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
ERFP50548 AL162497.1-201ENST00000615635 518 ntTSL 4 BASIC15.15■□□□□ 0.02
ERFP50548 HIST1H2AK-201ENST00000618958 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
ERFP50548 DHRS4L2-211ENST00000621761 1049 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
ERFP50548 GRIN1-207ENST00000371560 3640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ERFP50548 CDCA7-202ENST00000347703 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ERFP50548 ITGB2-206ENST00000397852 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ERFP50548 SYBU-206ENST00000424158 3007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ERFP50548 ATP6V1E1-201ENST00000253413 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ERFP50548 CFAP43-203ENST00000369719 1434 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
ERFP50548 DUSP11-201ENST00000272444 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ERFP50548 CFLAR-214ENST00000443227 1679 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
ERFP50548 KCNJ18-201ENST00000567955 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ERFP50548 PCDHGA3-203ENST00000619750 2695 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
ERFP50548 MARS-201ENST00000262027 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ERFP50548 MTMR6-201ENST00000381801 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ERFP50548 FARP2-201ENST00000264042 4051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ERFP50548 TPM3-208ENST00000341485 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ERFP50548 ZNF286A-218ENST00000583566 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ERFP50548 FRMD8-201ENST00000317568 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ERFP50548 HSPH1-202ENST00000380405 3480 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ERFP50548 RIC8B-202ENST00000392837 5135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
ERFP50548 SCYL1-205ENST00000524944 2715 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ERFP50548 PLEKHN1-202ENST00000379409 2455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
ERFP50548 FBXO41-201ENST00000295133 6928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ERFP50548 MINDY1-207ENST00000622754 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ERFP50548 CYP51A1P2-201ENST00000419457 1499 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
ERFP50548 TMEM47-201ENST00000275954 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ERFP50548 PRKN-204ENST00000366896 2514 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ERFP50548 GORASP1-201ENST00000319283 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ERFP50548 CDC25B-205ENST00000439880 3096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ERFP50548 HTD2-206ENST00000481972 1378 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
ERFP50548 SSTR1-201ENST00000267377 4295 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
ERFP50548 TIGD6-201ENST00000296736 4006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ERFP50548 MMAB-210ENST00000545712 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ERFP50548 C21orf33-202ENST00000348499 1506 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ERFP50548 RBFOX3-212ENST00000584778 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
ERFP50548 AC012569.1-201ENST00000591191 1524 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
ERFP50548 RPS5-202ENST00000596046 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ERFP50548 PHF8-202ENST00000338154 6062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ERFP50548 TFR2-201ENST00000223051 2888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ERFP50548 SF1-201ENST00000227503 2850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ERFP50548 MYD88-203ENST00000417037 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ERFP50548 TMEM161A-206ENST00000587583 1654 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
ERFP50548 SHPK-201ENST00000225519 3838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ERFP50548 GGT1-204ENST00000401885 968 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ERFP50548 FOXD3-AS1-201ENST00000418244 941 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ERFP50548 SNHG11-204ENST00000420006 720 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
ERFP50548 SNHG11-206ENST00000432153 1181 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
ERFP50548 PHGR1-201ENST00000448599 436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
ERFP50548 BLOC1S1-204ENST00000549147 1229 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ERFP50548 AC139887.3-201ENST00000568585 713 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
ERFP50548 METTL23-202ENST00000586200 465 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ERFP50548 METTL23-212ENST00000590964 1006 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ERFP50548 AC004706.3-202ENST00000621574 984 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
ERFP50548 AL513523.2-201ENST00000633218 660 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
ERFP50548 GPC3-202ENST00000394299 2379 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ERFP50548 EVL-201ENST00000392920 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ERFP50548 CHRD-206ENST00000450923 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ERFP50548 HIPK3-203ENST00000456517 7399 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
ERFP50548 AC005252.3-201ENST00000623855 2258 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
ERFP50548 TMCC3-201ENST00000261226 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ERFP50548 GPER1-203ENST00000397092 2971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
ERFP50548 MLLT6-211ENST00000621332 7578 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ERFP50548 GFRA1-201ENST00000355422 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
ERFP50548 UBXN11-206ENST00000374222 2043 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
ERFP50548 SEZ6L-209ENST00000529632 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ERFP50548 ZBED1P1-201ENST00000502364 1930 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
ERFP50548 PHYHIP-202ENST00000454243 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ERFP50548 SLC16A1-207ENST00000538576 4374 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
ERFP50548 AC089987.1-201ENST00000551654 2209 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
ERFP50548 VSIR-201ENST00000394957 4689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.4 ms