Protein–RNA interactions for Protein: P43119

PTGIR, Prostacyclin receptor, humanhuman

Predictions only

Length 386 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTGIRP43119 AL157832.3-201ENST00000635764 1005 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PTGIRP43119 HAUS2-211ENST00000639412 375 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PTGIRP43119 FAM49B-201ENST00000401979 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PTGIRP43119 PLXNB3-201ENST00000361971 6146 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PTGIRP43119 C4orf50-202ENST00000531445 6860 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PTGIRP43119 SRPRA-206ENST00000532259 2453 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PTGIRP43119 UBL7-209ENST00000567435 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PTGIRP43119 BICD2-201ENST00000356884 6427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PTGIRP43119 EFNB1-201ENST00000204961 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PTGIRP43119 AL034550.2-201ENST00000620523 1771 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PTGIRP43119 CASQ1-201ENST00000368078 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PTGIRP43119 HMGA1-204ENST00000401473 1887 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PTGIRP43119 DNAJC14-201ENST00000317269 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PTGIRP43119 PDP1-201ENST00000297598 4272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PTGIRP43119 CACNA1A-214ENST00000614285 8410 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PTGIRP43119 SPOCK3-201ENST00000357154 2986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PTGIRP43119 LARP4B-211ENST00000612396 8546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PTGIRP43119 ARHGEF26-AS1-204ENST00000491862 2598 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PTGIRP43119 MFF-204ENST00000353339 2186 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PTGIRP43119 SLC25A36-203ENST00000446041 4638 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PTGIRP43119 ZCCHC17-202ENST00000373714 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PTGIRP43119 ZSCAN32-205ENST00000439568 1746 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PTGIRP43119 TRAF3-202ENST00000351691 2239 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PTGIRP43119 SNRPB-201ENST00000381342 1154 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PTGIRP43119 SNRPB-202ENST00000438552 1008 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PTGIRP43119 TARDBPP1-201ENST00000442013 1203 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
PTGIRP43119 IGHV3-62-201ENST00000520057 340 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
PTGIRP43119 RAB30-AS1-202ENST00000526795 567 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PTGIRP43119 AC131235.3-202ENST00000608135 362 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PTGIRP43119 AC244153.1-202ENST00000617855 482 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PTGIRP43119 CITED2-204ENST00000618718 901 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PTGIRP43119 DDX49-201ENST00000247003 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PTGIRP43119 RHD-207ENST00000454452 1303 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PTGIRP43119 CORO1A-208ENST00000565497 1348 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PTGIRP43119 PKN1-202ENST00000342216 2960 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PTGIRP43119 PRMT9-201ENST00000322396 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PTGIRP43119 KIAA1211-203ENST00000504228 4628 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PTGIRP43119 COMP-201ENST00000222271 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PTGIRP43119 CD8A-203ENST00000409511 3048 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PTGIRP43119 LPAR1-203ENST00000374431 3637 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PTGIRP43119 SPSB1-202ENST00000357898 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PTGIRP43119 FAM86B1-216ENST00000533852 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PTGIRP43119 GREM1-202ENST00000560830 2648 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PTGIRP43119 ANKRD46-205ENST00000520311 3270 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PTGIRP43119 GTF2IRD1-203ENST00000455841 3315 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PTGIRP43119 WFIKKN2-202ENST00000426127 2193 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PTGIRP43119 GJD2-201ENST00000290374 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PTGIRP43119 HSDL1-201ENST00000219439 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
PTGIRP43119 EIF2B4-205ENST00000445933 1608 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
PTGIRP43119 GRN-214ENST00000589265 1632 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
PTGIRP43119 FP565260.6-204ENST00000620528 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
PTGIRP43119 AC007743.1-201ENST00000596663 3075 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
PTGIRP43119 BPGM-201ENST00000344924 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
PTGIRP43119 BPIFB2-201ENST00000170150 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
PTGIRP43119 GCLM-201ENST00000370238 4857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
PTGIRP43119 DIAPH2-204ENST00000373054 3376 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
PTGIRP43119 MUC20-201ENST00000320736 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PTGIRP43119 GPANK1-203ENST00000375896 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PTGIRP43119 ZNF586-202ENST00000396150 1977 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PTGIRP43119 LARP6-201ENST00000299213 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PTGIRP43119 RHPN1-201ENST00000289013 3683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PTGIRP43119 OPCML-IT1-201ENST00000533859 2936 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PTGIRP43119 ISCA1-201ENST00000311534 813 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PTGIRP43119 BAX-203ENST00000354470 433 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PTGIRP43119 BLOC1S2-202ENST00000370372 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PTGIRP43119 LINC00029-202ENST00000414668 1117 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PTGIRP43119 AKIRIN1-203ENST00000446189 1243 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PTGIRP43119 LINC01640-201ENST00000452505 550 ntTSL 4 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PTGIRP43119 MLF1-210ENST00000484955 1247 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PTGIRP43119 PUS1-205ENST00000535067 838 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PTGIRP43119 LINC00511-205ENST00000578206 908 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PTGIRP43119 AC005330.1-201ENST00000590086 1238 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PTGIRP43119 AC010326.2-201ENST00000602124 1020 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PTGIRP43119 DHRS4L2-205ENST00000543805 1334 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PTGIRP43119 KIF5B-201ENST00000302418 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PTGIRP43119 RAD51D-203ENST00000394589 2287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PTGIRP43119 RNPS1-216ENST00000565678 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PTGIRP43119 NEK7-202ENST00000367385 4149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PTGIRP43119 SNX14-202ENST00000346348 3348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PTGIRP43119 FDPS-202ENST00000368356 1431 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PTGIRP43119 MTHFR-210ENST00000641407 2387 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
PTGIRP43119 NORAD-201ENST00000565493 5339 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
PTGIRP43119 AKTIP-202ENST00000394657 2426 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PTGIRP43119 NCOA1-205ENST00000406961 7289 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PTGIRP43119 PNPLA5-201ENST00000216177 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PTGIRP43119 CERCAM-213ENST00000612334 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PTGIRP43119 DUSP14-204ENST00000613659 1559 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PTGIRP43119 COPS3-201ENST00000268717 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PTGIRP43119 RAB5C-201ENST00000346213 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PTGIRP43119 ACBD5-202ENST00000375897 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PTGIRP43119 TM4SF19-AS1-203ENST00000452051 1829 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PTGIRP43119 PLD3-201ENST00000356508 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PTGIRP43119 BBS1-225ENST00000630659 1934 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PTGIRP43119 AGPAT1-201ENST00000336984 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PTGIRP43119 BCAR1-204ENST00000418647 3387 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PTGIRP43119 DPP9-210ENST00000597849 2025 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PTGIRP43119 C17orf80-203ENST00000359042 3645 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PTGIRP43119 AP004608.1-203ENST00000528482 3679 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PTGIRP43119 SLC30A5-202ENST00000396591 4360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PTGIRP43119 PPP1R16A-201ENST00000292539 2722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 70.3 ms