Protein–RNA interactions for Protein: P42263

GRIA3, Glutamate receptor 3, humanhuman

Predictions only

Length 894 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIA3P42263 BCL2L2-PABPN1-203ENST00000557008 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
GRIA3P42263 AP001282.1-201ENST00000531301 1499 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
GRIA3P42263 KIF21A-202ENST00000361961 6601 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
GRIA3P42263 CDH24-202ENST00000397359 3552 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
GRIA3P42263 TOPAZ1-201ENST00000309765 5334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
GRIA3P42263 PKN1-202ENST00000342216 2960 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
GRIA3P42263 RASD2-201ENST00000216127 3412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
GRIA3P42263 MAP3K10-201ENST00000253055 3436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
GRIA3P42263 NCK2-203ENST00000393349 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
GRIA3P42263 RAB5C-201ENST00000346213 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
GRIA3P42263 TRPM2-208ENST00000621064 1669 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
GRIA3P42263 FURIN-207ENST00000618099 4345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
GRIA3P42263 VARS2-201ENST00000321897 4073 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
GRIA3P42263 AC100757.3-201ENST00000622361 1406 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
GRIA3P42263 CDH20-203ENST00000538374 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
GRIA3P42263 CRHR2-208ENST00000506074 3109 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
GRIA3P42263 AC004943.2-201ENST00000563328 4842 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
GRIA3P42263 ANKHD1-EIF4EBP3-203ENST00000532219 8246 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
GRIA3P42263 SMIM5-201ENST00000375215 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
GRIA3P42263 IMPDH1P4-201ENST00000445028 1534 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
GRIA3P42263 KRT85-201ENST00000257901 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
GRIA3P42263 MECR-202ENST00000373791 2416 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
GRIA3P42263 C1QTNF2-201ENST00000393975 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
GRIA3P42263 TEAD3-201ENST00000338863 2983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
GRIA3P42263 RPS9-207ENST00000441429 1600 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
GRIA3P42263 HGNC:18790-202ENST00000421177 4172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
GRIA3P42263 VAT1-201ENST00000355653 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
GRIA3P42263 LRRC28-202ENST00000331450 752 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
GRIA3P42263 DUPD1-201ENST00000338487 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
GRIA3P42263 DBNDD2-205ENST00000372717 1207 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
GRIA3P42263 RNF186-201ENST00000375121 1250 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
GRIA3P42263 RETN-202ENST00000381324 249 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
GRIA3P42263 HNRNPA3P1-201ENST00000401429 1139 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
GRIA3P42263 PQLC3-202ENST00000402361 696 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
GRIA3P42263 RNF183-202ENST00000416588 849 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
GRIA3P42263 AC241585.1-201ENST00000433527 519 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
GRIA3P42263 U52111.1-201ENST00000434284 914 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
GRIA3P42263 TMEM120A-203ENST00000439537 1161 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
GRIA3P42263 HNRNPA3P5-201ENST00000455201 833 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
GRIA3P42263 AL512638.1-201ENST00000457493 794 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
GRIA3P42263 AL359815.1-201ENST00000457706 821 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
GRIA3P42263 INGX-202ENST00000489074 768 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
GRIA3P42263 BRK1-201ENST00000530758 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
GRIA3P42263 TMSB15B-204ENST00000540220 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
GRIA3P42263 TMSB15B-205ENST00000563257 590 ntTSL 4 BASIC15.44■□□□□ 0.06
GRIA3P42263 MPI-209ENST00000564003 1195 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
GRIA3P42263 AC087392.4-201ENST00000574560 486 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
GRIA3P42263 PRR29-209ENST00000582540 967 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
GRIA3P42263 LINC01775-201ENST00000587826 371 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
GRIA3P42263 AC011467.4-201ENST00000594891 528 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
GRIA3P42263 ZNF568-203ENST00000427117 1827 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
GRIA3P42263 CEP63-212ENST00000513612 2903 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
GRIA3P42263 MICAL1-201ENST00000358577 3142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
GRIA3P42263 SEMA3G-201ENST00000231721 4899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
GRIA3P42263 CLN3-229ENST00000567963 1452 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
GRIA3P42263 STAT5A-211ENST00000590949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
GRIA3P42263 KRT8-215ENST00000552150 1687 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
GRIA3P42263 RUNX1-202ENST00000344691 7274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
GRIA3P42263 AC068831.3-201ENST00000553321 1858 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
GRIA3P42263 UBE2D1-204ENST00000615793 2621 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
GRIA3P42263 AC134407.2-201ENST00000625089 1978 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
GRIA3P42263 PPP1R26-204ENST00000604351 4640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
GRIA3P42263 SLC34A2-202ENST00000503434 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GRIA3P42263 PUDP-203ENST00000424830 1334 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
GRIA3P42263 ETV2-205ENST00000479824 1342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GRIA3P42263 SNX14-215ENST00000513865 2259 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
GRIA3P42263 ARHGEF7-204ENST00000375736 5032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GRIA3P42263 MTRF1L-201ENST00000367230 3431 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GRIA3P42263 CRTC2-202ENST00000368630 1635 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
GRIA3P42263 PRKD2-201ENST00000291281 3070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GRIA3P42263 ZNF135-202ENST00000359978 2120 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
GRIA3P42263 ERG28-201ENST00000256319 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GRIA3P42263 RER1-203ENST00000378513 3000 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
GRIA3P42263 PMS1-221ENST00000624204 3417 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
GRIA3P42263 CLEC1B-201ENST00000298527 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GRIA3P42263 PRSS55-201ENST00000328655 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GRIA3P42263 PDSS2-201ENST00000369031 1236 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GRIA3P42263 RBM3-202ENST00000376755 1130 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
GRIA3P42263 ZC3H12D-202ENST00000409948 753 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
GRIA3P42263 PRICKLE2-AS1-203ENST00000476308 623 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
GRIA3P42263 RNA5SP421-201ENST00000516864 134 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
GRIA3P42263 AP006333.1-201ENST00000543817 575 ntTSL 4 BASIC15.43■□□□□ 0.06
GRIA3P42263 RNF24-204ENST00000545616 1128 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GRIA3P42263 AL359644.1-202ENST00000637541 571 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
GRIA3P42263 BNIP3P1-202ENST00000550043 1585 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
GRIA3P42263 C21orf33-201ENST00000291577 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GRIA3P42263 ABHD3-201ENST00000289119 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GRIA3P42263 FUT8-213ENST00000557164 2269 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
GRIA3P42263 SEMA5B-206ENST00000451055 4579 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
GRIA3P42263 MYH11-211ENST00000576790 6272 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GRIA3P42263 CNOT8-202ENST00000403027 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GRIA3P42263 APP-208ENST00000439274 2517 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GRIA3P42263 PGBD2-201ENST00000329291 2136 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GRIA3P42263 MPP2-208ENST00000520305 2111 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
GRIA3P42263 RNPS1-220ENST00000566458 2037 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GRIA3P42263 RNF32-204ENST00000392743 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GRIA3P42263 HNRNPH3-202ENST00000354695 1332 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GRIA3P42263 OPA1-201ENST00000361150 6330 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
GRIA3P42263 ME2-201ENST00000321341 9415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
GRIA3P42263 DPYSL3-201ENST00000343218 5476 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.3 ms