Protein–RNA interactions for Protein: P36383

GJC1, Gap junction gamma-1 protein, humanhuman

Predictions only

Length 396 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GJC1P36383 ASTN2-201ENST00000288520 2356 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
GJC1P36383 CNKSR1-201ENST00000361530 2625 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
GJC1P36383 SHANK2-204ENST00000409530 2123 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
GJC1P36383 MARC1-201ENST00000366910 7439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
GJC1P36383 PODN-201ENST00000312553 3010 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
GJC1P36383 KIAA0319-201ENST00000378214 6802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
GJC1P36383 SLC2A11-203ENST00000345044 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
GJC1P36383 FOXRED2-201ENST00000216187 3933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
GJC1P36383 POFUT2-214ENST00000615172 2472 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
GJC1P36383 LFNG-202ENST00000338732 1968 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
GJC1P36383 TMUB2-209ENST00000587989 1969 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
GJC1P36383 GFOD2-203ENST00000602377 1991 ntTSL 4 BASIC16.52■□□□□ 0.24
GJC1P36383 LRRC28-202ENST00000331450 752 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
GJC1P36383 CRLF2-202ENST00000381567 1013 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
GJC1P36383 GRTP1-AS1-201ENST00000419199 867 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
GJC1P36383 CNN2P11-201ENST00000429351 262 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
GJC1P36383 LINC01143-201ENST00000449073 625 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
GJC1P36383 AC103736.1-203ENST00000524565 872 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
GJC1P36383 WASHC3-213ENST00000545679 865 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
GJC1P36383 COX5A-203ENST00000564811 568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
GJC1P36383 ZNF586-205ENST00000598885 578 ntTSL 4 BASIC16.52■□□□□ 0.24
GJC1P36383 AC097359.3-201ENST00000603982 1210 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
GJC1P36383 COLCA2-204ENST00000610738 975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
GJC1P36383 PDCD6-214ENST00000628729 1073 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
GJC1P36383 AC134684.3-201ENST00000641758 218 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
GJC1P36383 HDAC8-209ENST00000373589 1740 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
GJC1P36383 GORAB-202ENST00000367763 2189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
GJC1P36383 MST1L-201ENST00000442552 2185 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
GJC1P36383 CDC25B-203ENST00000344256 3071 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
GJC1P36383 RAPSN-203ENST00000524487 1462 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
GJC1P36383 PCGF2-206ENST00000618941 1499 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
GJC1P36383 AP002990.1-202ENST00000496634 5064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
GJC1P36383 SOWAHA-201ENST00000378693 3211 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.23
GJC1P36383 UBE4B-201ENST00000253251 4772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
GJC1P36383 ADD2-208ENST00000430656 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
GJC1P36383 HERPUD1-201ENST00000300302 1862 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
GJC1P36383 PCSK2-205ENST00000536609 2275 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
GJC1P36383 COX11-201ENST00000299335 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
GJC1P36383 SMAP1-202ENST00000370452 2491 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
GJC1P36383 PPHLN1-201ENST00000256678 1820 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
GJC1P36383 LINC00884-202ENST00000448892 2680 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
GJC1P36383 P2RY1-201ENST00000305097 6747 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.23
GJC1P36383 MOXD1-202ENST00000367963 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
GJC1P36383 CNDP1-201ENST00000358821 2215 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
GJC1P36383 PWP2-201ENST00000291576 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
GJC1P36383 TMEM181-201ENST00000367090 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
GJC1P36383 MX1-210ENST00000455164 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
GJC1P36383 CNDP2-201ENST00000324262 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
GJC1P36383 NPM1-201ENST00000296930 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
GJC1P36383 TBC1D1-201ENST00000261439 5700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
GJC1P36383 TMA16-201ENST00000358572 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
GJC1P36383 MBD1-203ENST00000339998 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
GJC1P36383 HEATR3-201ENST00000299192 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
GJC1P36383 FKBP5-201ENST00000357266 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
GJC1P36383 DUOXA1-202ENST00000430224 1317 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
GJC1P36383 CLCNKB-204ENST00000619181 1544 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
GJC1P36383 CENPT-235ENST00000626059 1737 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
GJC1P36383 ZBTB37-203ENST00000367704 2323 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
GJC1P36383 GRSF1-208ENST00000545193 2682 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
GJC1P36383 CCR7-203ENST00000579344 1874 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
GJC1P36383 RPS19-201ENST00000221975 500 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
GJC1P36383 LSM1-201ENST00000311351 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
GJC1P36383 RPL21-203ENST00000319826 806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
GJC1P36383 CAVIN1-201ENST00000357037 3828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
GJC1P36383 PDSS2-201ENST00000369031 1236 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
GJC1P36383 HFE-208ENST00000397022 1280 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
GJC1P36383 MRPS12-203ENST00000407800 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
GJC1P36383 SCRN1-203ENST00000409570 535 ntTSL 4 BASIC16.51■□□□□ 0.23
GJC1P36383 LINC01264-201ENST00000431395 500 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
GJC1P36383 AL513327.2-201ENST00000432703 490 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
GJC1P36383 LINC01705-201ENST00000438158 562 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
GJC1P36383 MLF1-206ENST00000471745 1266 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
GJC1P36383 HFE-214ENST00000488199 781 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
GJC1P36383 NT5C3B-215ENST00000521789 993 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
GJC1P36383 RIMS4-202ENST00000541604 1036 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
GJC1P36383 SNHG9-202ENST00000564014 471 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
GJC1P36383 NDRG4-247ENST00000568640 1281 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
GJC1P36383 LITAF-210ENST00000571976 548 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
GJC1P36383 LITAF-214ENST00000574703 486 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
GJC1P36383 RPS19-202ENST00000593863 526 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
GJC1P36383 AC010615.2-202ENST00000597444 832 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
GJC1P36383 RN7SL828P-201ENST00000607615 303 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
GJC1P36383 CBY1-211ENST00000619293 1118 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
GJC1P36383 AL139082.1-201ENST00000613982 3433 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
GJC1P36383 ZNF777-201ENST00000247930 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
GJC1P36383 TGOLN2-205ENST00000409232 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
GJC1P36383 TMEM147-AS1-203ENST00000589137 1627 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
GJC1P36383 GRN-214ENST00000589265 1632 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
GJC1P36383 LAT2-202ENST00000344995 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
GJC1P36383 RREB1-202ENST00000349384 7440 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
GJC1P36383 MAGEA8-201ENST00000286482 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
GJC1P36383 SCRN1-205ENST00000425819 1552 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
GJC1P36383 RRP1B-201ENST00000340648 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
GJC1P36383 CDH20-203ENST00000538374 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
GJC1P36383 ZNF252P-AS1-201ENST00000527067 3236 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
GJC1P36383 ICAM3-201ENST00000160262 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
GJC1P36383 TSSK3-201ENST00000373534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
GJC1P36383 GLMP-213ENST00000612353 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
GJC1P36383 PLXNB2-214ENST00000614805 1387 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
GJC1P36383 GLMP-215ENST00000622703 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.6 ms